| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 1,639,779 | 0 | T | G | 33.8% | 89.0 / 15.4 | 71 | N212H (AAC→CAC) | gcd | Quinoprotein glucose dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/34); new base G (24/0); total (37/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GGGTCGTAGCGCCAGATTTCTGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCGGTACGGCCGTAGGCCTGCCATTCGC > ACB143/1639649‑1639907 | gggTCGTAGCGCCAGATTTCTGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTc < 2:2643/134‑1 (MQ=255)gggTCGTAGCGCCAGATATCTGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCTCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGTTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCg < 2:75480/135‑1 (MQ=255) gTCGTAGCGCCAGATTTCTGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGATCCACCGGGTCGTGTTgggg > 3:302266/1‑134 (MQ=255) cgcaGCGCCCGATTTCTGCGCCAGTGTCCGGTGCCTGCGCCCGCCGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTg < 2:197302/132‑1 (MQ=255) cgcCAGATTTCTGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTGGGGTGGCAg > 2:92505/1‑134 (MQ=255) cgcCAGATTTCTGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGGTTGCAGAt > 6:319521/1‑136 (MQ=255) tGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGc < 4:115234/134‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTGTCCGGGGCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGc < 1:118913/134‑1 (MQ=255) ccAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATg < 1:130721/135‑1 (MQ=255) ccAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGGCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATg < 8:61597/135‑1 (MQ=255) tgtCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTGTGGGTTGGCAGAGAACCCGGGCGAATGCGcc > 8:224351/1‑135 (MQ=255) tgccGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCa < 1:193647/133‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGcttctt < 8:99022/135‑1 (MQ=255) gaGCGCCAGCTTGCGACTGTGCGCGGTGCTGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGGTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCttcttc < 2:187070/134‑1 (MQ=255) cgcCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTCGGGTGGGAGCTCACCCGGGGGAAAGCGCCCGGCGTCTTGC‑aa > 4:357853/1‑134 (MQ=255) agcagGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACgg < 4:121125/135‑1 (MQ=255) agGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGTTTGCAGATGACCGGGGGGAATGCGCCAGGCTTATTAC‑A‑GACGGGAgg > 5:397796/1‑136 (MQ=255) agGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGTTGGGAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTGC‑A‑GACGGTat > 3:247195/1‑134 (MQ=255) gACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGtt < 6:336113/136‑1 (MQ=255) gcgcGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCg < 4:212673/135‑1 (MQ=255) gcgGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTCGGTTGGGAGATCCCCGGTGCGAATTCGCCAGGCTTCTTGC‑A‑GACGGTAGGCGTTGTGCgggg > 5:363847/1‑136 (MQ=255) ggTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTCGGTTGGCAGATAACCGGTGCGCCTGAGCCAGGCTTATTCC‑A‑GACCGGAGGCGTTATGCggggg > 1:98574/1‑134 (MQ=255) gTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTg < 2:224181/135‑1 (MQ=255) aaaGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCAGCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCa < 3:7861/135‑1 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTGGGTTGGCAGATCACCGGGGGGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAgcgg > 7:382388/1‑135 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTGGGTTGGCAGATCACCCGTGCGAATGCGCCAGGCGTCTTGC‑A‑GACGGGAGGCGTTGTGCGGGGTGATCTGGCGCCgcgg > 4:392960/1‑135 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑TACGGTAGGCGGTGTGCGGGGTGATCTGGcgccgccg > 3:294686/1‑133 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTAGGTTGGCAGCTCACCGGTGGGAATGCGGCCGGCTTCTTCC‑A‑GCCGGTAGGCGTTGTGCGGGGTGCTCTGGCGCAgcgg > 8:224167/1‑135 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGTTGGCAGATGACCCGTGGGAATGCGCCCGGCGTGTTAC‑A‑GACGGTTGGCGGTGTGGGGGGGGGTCTGgcgccccgg > 7:191091/1‑130 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGTTGGCAGATCCCCGGGGCGAATTCGCCACGGGTGTTCC‑A‑GACCGGAGGCGTTCTGCGGGGGGGTCTTGCGCAgcgg > 2:24556/1‑135 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGGTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCCGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGGTCTGCGGGGGGATCTGGCGCAgcgg > 8:13208/1‑135 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTCGGTTGGCCGCTCCCCGGTGCGAATGCGCCCCGGTTGTTGC‑A‑GACGGGTGGCGGTCTGCGGGGTGGTCTGGCGCCgcgg > 2:72507/1‑135 (MQ=255) cATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTCGGGTGGCCGGAAAACCCTGCGAAAGGGCCAGGCGTAGTCCAA‑CACGG‑AGGGGGTGGGCGGGGTGCTCTGGCCCAgcgg > 2:355862/1‑135 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATAACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGGGTTATGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTa > 5:174667/1‑136 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTAGGTTGGCAGATAACCGGTGCGAATGAGCCAGGCTTCTTCC‑A‑CACGGGTGGCGTTCTGCGGGGTGTTCTGGCGCAGCGGCGAGt > 1:95763/1‑135 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTGTGGGTTGGCAGATCACCGGTGGGAATGCGGCAGGCGTGTTGC‑C‑GACGGGTGGCGTTCTGCGGGGGGTTGTGGCGCAGCGGCGAgg > 4:104229/1‑134 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGTTGGGTCATCACCCGTGCGAAAGCGCCACGCGGAGTAC‑A‑GACGGGAGGCGGTCTGGGGGGGGATCTGGCGCCGCGGCCAg > 6:365245/1‑134 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGTTGGGAGATCACCGGTGCGCATGCGCCCGGCGTGTTCC‑A‑GACGGGATGCGTTCTGGGGGGTGGTCTGGCGCAGCGGCGAGt > 4:116827/1‑135 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTCGGTTGGCCGATCCCCGGTGCGAAAGCGCCAGGGGTCTTCC‑A‑GACGGGAGGCGGTGTGCGGGGTGATATGGCGCCGCGGCGAGt > 8:231659/1‑135 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATTCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGa > 8:170484/1‑133 (MQ=255) cGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGGTAGGGTGGGCGCTCAACCGTGGGAATTCGCCAGGCTTCGTGC‑A‑CACGGGAGGCGGTGTGCGGGGGGGTGATGCGCAgcggccg > 8:179014/1‑131 (MQ=255) gTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGCTCACCCCGGCGCATGCCCCCGGCGTCATAC‑A‑CACCCGATGGGTTGTGCGGGGTGATCTGGCGCCCCGGCGCGTa > 2:50612/1‑135 (MQ=255) gTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTTGGTTGGCAGATCACAGGTGGGGATGGGCCAGGGTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGGGGTCTGGGGGGTGATCTGGCGCCGCGGCgtgtt > 7:308993/1‑134 (MQ=255) aCCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCgg < 5:131743/135‑1 (MQ=255) cAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGGTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGcc < 6:93716/135‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCCGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCAt < 1:176782/135‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCAt < 1:134043/135‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCAt < 7:289117/135‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCAt < 4:7758/135‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGGTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCAt < 1:288293/135‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGGTGGCAGATAACCGGGGCGCATGGGCCAGGCTGCATAC‑ACAACGGT‑GGCGGTGTGCGGGGGGGTATGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGccct > 8:106639/1‑133 (MQ=255) cGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTGGGTTGGCAGATAACCGGTGCGAATTCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATg > 1:224/1‑135 (MQ=255) cGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGGTGGCAGATCACCCGTGCGAATTCGCCAGGCTTCTTGC‑A‑GACGGTAGGCGGTATGGGGGGTGTTATGGCGCATCGGCGAGTTGCGGTAGCCATg > 8:129915/1‑135 (MQ=255) ggtggtCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 6:16158/136‑1 (MQ=255) ggTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGGCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 5:26819/136‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 8:309288/135‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 3:172705/135‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 1:94008/135‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 7:143734/135‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 3:170537/135‑1 (MQ=255) gtgtTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTCTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCTTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 1:48563/135‑1 (MQ=255) gtgtGCTGGTTGGGCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 2:387362/135‑1 (MQ=255) gggtTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCg < 4:330678/133‑1 (MQ=255) gttggtCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATTCGCCAGGCTTCTTGC‑A‑CACGGTAGGCGTTGATCGGGGTGCTCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCGGTACGGcc > 7:385362/1‑135 (MQ=255) ggtCAGCTCCACCGGGTCGTGTTGGGTTGGCAGATAACCCGTGCGAATTCGCCAGGCGTCTTAC‑A‑GAACGTAGGCGTTCTGCGGGGTGTTCTGGCGCCGCGGCGAGTAGCGGTCGGCATGCTCGGTACGGcccga > 4:182427/1‑132 (MQ=255) cAGCTCCACCGGGTCGTTTTGGGTTGGCAGATAACCGGTGGGGATTGGGCAGGCGTCTTCC‑A‑GCCGGTAGGCGGTGTGCGGGGGGATATGGCGCAGCGGGGAGTAGCGGTCGCCCTGCTCGGTACGGCCGGAggg > 8:388422/1‑134 (MQ=255) gCTCCACCGGGTCGTGTTCGGTTGGCAGATCCCCGGTGCGAAATGGCCAGGCTTGGTCC‑A‑GAAGGGAGGCGGTCTGCGGGGGGCTCTGGGGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCCTGCTCGGTAAGGCCCTAGGccag > 6:366350/1‑134 (MQ=255) gCTCCACCGGGTCGTGTTCGGGTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCGTGTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGGGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCGGTACGGCCGTAGGCCt > 4:322917/1‑135 (MQ=255) cACCGGGTCGTGTTGGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCGTCTTGC‑A‑GACGGTAGGCGTTATGCGGGGTGTTCTTGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCGGTACGGCCGTAGGCCTGccc > 8:121139/1‑134 (MQ=255) ggTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCGGTACGGCCGTAGGCCTGCCATTCGc < 1:32460/135‑1 (MQ=255) ggTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCGGTACGGCCGTAGGCCTGCCATTCGc < 3:211623/135‑1 (MQ=255) | GGGTCGTAGCGCCAGATTTCTGCGCCAGTGTCCGGGTCCAGCGCCAGCAGGCGACTGTGCGCGGTGCAGGCGTAAAGCATGCCGTTGACCTTCAGCGGGGTGTTCTGGTTGGTCAGCTCCACCGGGTCGTTTTCGGTTGGCAGATCACCGGTGCGAATGCGCCAGGCTTCTTCC‑A‑GACGGTAGGCGTTCTGCGGGGTGATCTGGCGCAGCGGCGAGTAGCGGTCGCCATGCTCGGTACGGCCGTAGGCCTGCCATTCGC > ACB143/1639649‑1639907 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |