| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 55,609 | C→T | 5.9% | G76G (GGC→GGT) | alkJ_1 → | Alcohol dehydrogenase [acceptor] |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 55,609 | 0 | C | T | 5.9% | 233.8 / 3.3 | 71 | G76G (GGC→GGT) | alkJ_1 | Alcohol dehydrogenase [acceptor] |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/32); new base T (2/2); total (36/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.23e-01 | |||||||||||
CTGCCGCGTGCTGCTGCTGGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGTGGAA > ACB143/55474‑55743 | cTGCCGCGTGCTGGTGCTGGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCGCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTcggc < 5:252445/136‑1 (MQ=255)cTGCCGCGTGCTGCTGCTGGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTcggc < 2:259502/136‑1 (MQ=255) ccGCGTGCTGCTGCTGGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTcggcg < 1:148663/134‑1 (MQ=255) tgctgctgcTGGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCGCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGCCTGGTGCTTCAAGACCCACGCACAACCAGGCCTCGGGGGTcgc > 4:245484/1‑134 (MQ=255) tgctgctgGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGCCTGGTGCTTCAAGCCCGCGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCttt > 2:77406/1‑136 (MQ=255) tgctgctgGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCttt > 7:15819/1‑136 (MQ=255) ctgctgGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGCTCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCttt < 1:288864/134‑1 (MQ=255) ctgctgGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCttt < 3:36993/134‑1 (MQ=255) ctgctgGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCttt < 3:26382/134‑1 (MQ=255) ctgctgGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCttt < 3:24768/134‑1 (MQ=255) gAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTa < 1:81683/134‑1 (MQ=255) gggTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAgg > 6:251601/1‑136 (MQ=255) gggTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAgg < 1:96763/136‑1 (MQ=255) ggTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCTAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg < 5:274192/136‑1 (MQ=255) ggTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg < 3:126765/136‑1 (MQ=255) ggTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg < 7:223680/136‑1 (MQ=255) gTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAgggg < 5:280184/136‑1 (MQ=255) tGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGc > 5:190970/1‑136 (MQ=255) ggCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGGTTTGGGTTATCCAAGGGGc > 3:164921/1‑135 (MQ=255) gCCGTGACAATTATCCCTGGCTCCACATCCCCGTTGGTTACCTCAACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCGTTGGGGTATGCAAGGGGc > 1:258810/1‑134 (MQ=255) gCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGc > 3:278336/1‑134 (MQ=255) gTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg < 7:30748/129‑1 (MQ=255) gTGACAATTATCCATGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg > 8:30748/1‑129 (MQ=255) taccTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCACGGCGGTCGCGCTTTGGGGTATACAATGGGCAAGGTGGTAGGTGGc > 8:4309/3‑136 (MQ=255) cTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGt < 1:143129/136‑1 (MQ=255) ggATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGGTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTtc > 4:272874/1‑136 (MQ=255) tCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCGTTTGGTTATCAAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTtcgtc > 3:154429/1‑136 (MQ=255) tCCAAATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTtcgtc < 7:216780/136‑1 (MQ=255) acaTCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGAt < 3:42909/136‑1 (MQ=255) ccccGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCCAc > 6:62201/1‑136 (MQ=255) ccccGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAAc < 6:146733/136‑1 (MQ=255) cccGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAAc < 3:30172/135‑1 (MQ=255) cccGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACg < 7:179917/136‑1 (MQ=255) cccGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCAGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGCCCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACg < 3:92742/136‑1 (MQ=255) cccGGTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCAGAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACACCCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACg < 1:122963/136‑1 (MQ=255) cGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGc < 3:44832/136‑1 (MQ=255) ttGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCAt > 7:46904/1‑136 (MQ=255) gTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGAt < 5:114334/136‑1 (MQ=255) tACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGc > 7:23416/1‑136 (MQ=255) cATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGTGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg > 7:46297/1‑83 (MQ=255) cATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGTGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg < 8:42148/83‑1 (MQ=255) cATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGTGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg < 8:46297/83‑1 (MQ=255) cATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGTGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAggg > 7:42148/1‑83 (MQ=255) cGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGcc > 6:133486/1‑134 (MQ=255) ggCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCCAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGAGGTCGCGCTTTGGGTCTTCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGGGGGGCCAAg < 4:23295/136‑1 (MQ=255) ggCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAg < 3:177353/136‑1 (MQ=255) ggCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAg < 1:190017/136‑1 (MQ=255) gCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAgc > 7:132375/1‑136 (MQ=255) gCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAgc > 5:134862/1‑136 (MQ=255) gCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAgc > 4:61323/1‑136 (MQ=255) gCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAgc > 3:82520/1‑136 (MQ=255) gCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTAGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATACAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAgc > 7:86083/1‑136 (MQ=255) aCCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAgggg > 8:122515/1‑76 (MQ=255) aCCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAgggg < 7:122515/76‑1 (MQ=255) gcgcACTGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACATCCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGTTTAACCAAGGGGCAAGGTGCTAGGGGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATCATCTCCATGCTGGGCCAAGCCGCCGAc < 3:63940/136‑1 (MQ=255) ggTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTg > 1:59315/1‑136 (MQ=255) gTGCTTCAAGACCGCGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCAtt < 1:58334/134‑1 (MQ=255) cTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGcc > 8:71760/1‑136 (MQ=255) cTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGcc < 5:233462/136‑1 (MQ=255) cTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGcc > 7:279335/1‑136 (MQ=255) aaGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCgcgc < 6:109300/136‑1 (MQ=255) gACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCgcgc > 1:29909/1‑134 (MQ=255) gACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGGGCTAGGTGGCTGTTCGTCGCTCAACGGCATTATCTACCTGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCa > 6:27475/1‑135 (MQ=255) cacaACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGCCCATTGGGCCGCGCAAGGCAacga > 4:192332/1‑136 (MQ=255) cacaACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAacga < 3:195272/136‑1 (MQ=255) cacaACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAacga > 8:186497/1‑136 (MQ=255) cacaACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATAAACGGCATGAACTACATTCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGACACGCAATGCAacga > 4:60989/1‑136 (MQ=255) cTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTg < 8:73045/136‑1 (MQ=255) cTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTg > 6:227123/1‑136 (MQ=255) cTCGGCGGTCGCGCTTTGGGGTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGt < 4:32349/136‑1 (MQ=255) tCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGCTCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAAAGACGGCTGGGCGTg > 8:118388/1‑136 (MQ=255) tCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGCCCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGTg > 5:121901/1‑136 (MQ=255) tCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAacgac > 5:278718/1‑125 (MQ=255) tCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAacgac < 6:278718/125‑1 (MQ=255) gcggTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGTGGaa < 8:60136/136‑1 (MQ=255) gcggTCGCGCTTGGGGTTATCCAAGGGTGAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTGGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACCACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGTGGaa < 2:275215/136‑1 (MQ=255) cggTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGTGGa > 3:140586/1‑134 (MQ=255) cggTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCGGTTCGGCGCTCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGTGGa > 7:139803/1‑134 (MQ=255) | CTGCCGCGTGCTGCTGCTGGAGGCGGGTGGCCGTGACAATTATCCCTGGATCCACATCCCCGTTGGTTACCTCTACTGCATCGGCAACCCGCGCACAGACTGGTGCTTCAAGACCGAGGCACAACCTGGCCTCGGCGGTCGCGCTTTGGGTTATCCAAGGGGCAAGGTGCTAGGTGGCTGTTCGTCGATCAACGGCATGATCTACATGCGGGGCCAAGCCGCCGACTACGACCATTGGGCCGCGCAAGGCAACGACGGCTGGGCGTGGAA > ACB143/55474‑55743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |