| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 605,516 | C→T | 8.6% | A572A (GCG→GCA) | dxs ← | 1‑deoxy‑D‑xylulose‑5‑phosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 605,516 | 0 | C | T | 8.6% | 253.1 / 11.9 | 81 | A572A (GCG→GCA) | dxs | 1‑deoxy‑D‑xylulose‑5‑phosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/37); new base T (3/4); total (40/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
CCGGCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGC > ACB143/605382‑605647 | ccGGCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGccc < 3:280668/135‑1 (MQ=255)ccGGCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGccc < 1:291093/135‑1 (MQ=255)ccGGCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGccc < 3:298866/135‑1 (MQ=255)ccGGCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGccc < 4:189561/135‑1 (MQ=255)ccGGCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCcg < 7:344829/136‑1 (MQ=255) ggCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGccc < 1:57837/133‑1 (MQ=255) gCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCTgcgc < 7:14048/136‑1 (MQ=255) ccAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCat > 1:320179/1‑136 (MQ=255) cgcGCACTCAGCCAGCATTTGCTCAGTCTTGTCTTGCTCTACTTAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCTCTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCAGCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCattttg < 6:188846/134‑5 (MQ=255) cccGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGTTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCatgatg < 5:122210/136‑1 (MQ=255) cGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGc < 1:319663/136‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCcgc > 5:338428/1‑116 (MQ=255) tCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCcgc < 6:338428/116‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTtct > 3:188669/1‑136 (MQ=255) tCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTtct > 3:117588/1‑136 (MQ=255) agccagcATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTtct < 1:317052/134‑1 (MQ=255) gccagcATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCCTGATGGCGTTCTCtt < 6:387271/136‑1 (MQ=255) gccagcATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCtt < 5:285300/136‑1 (MQ=255) ccagcATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCCCCCACCGCAGCGCCCCCGCCACCCATGATGGCGTtcacatc > 5:241425/1‑131 (MQ=255) cagcATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTc > 1:108291/1‑135 (MQ=255) cgcAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTAc < 1:322320/135‑1 (MQ=255) aGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACcagc < 8:301978/136‑1 (MQ=255) aGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACcag > 2:326729/1‑135 (MQ=255) ttGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCTGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCt > 3:98610/1‑136 (MQ=255) gCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCAt < 6:324093/136‑1 (MQ=255) tGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCGGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGATCTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGc > 5:174353/1‑136 (MQ=255) tGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTCCCAGCAGCTCATGGc > 1:85132/1‑136 (MQ=255) gACATAGATCTCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACAATCAGCTCATGGctgcct < 1:248836/136‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTTACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 3:309000/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCTGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct < 7:210313/136‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCTGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 8:369826/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCTGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcc < 8:60915/135‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct < 1:15349/136‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 8:67527/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 5:62798/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 6:107950/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 8:43911/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 6:291164/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct < 6:3062/136‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 8:209377/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct < 8:100415/136‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 7:100415/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 3:154622/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 4:102581/1‑136 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct < 4:76417/136‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct < 1:292741/136‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcc < 2:399794/135‑1 (MQ=255) gACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCACAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 6:10027/1‑136 (MQ=255) aCATAGATATCCGGCAGCCCCATGTGCAGAAGCGGCGTGAGCACTGCCTGGCTTGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcctg < 2:292596/136‑1 (MQ=255) gATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGc < 6:209692/136‑1 (MQ=255) ggCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCa < 8:11306/136‑1 (MQ=255) cAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCAc > 3:89335/1‑135 (MQ=255) cAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCAc > 2:345197/1‑135 (MQ=255) ccccAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAgc < 6:294981/136‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGcc > 4:199075/1‑136 (MQ=255) tGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGt < 4:170817/136‑1 (MQ=255) aGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCg > 2:233345/1‑136 (MQ=255) aGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCAGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCg < 4:238865/136‑1 (MQ=255) gCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCTGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCgg > 2:293903/1‑136 (MQ=255) tGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct < 8:104159/98‑1 (MQ=255) tGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGctgcct > 7:104159/1‑98 (MQ=255) tGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGAc > 5:160198/1‑136 (MQ=255) aGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACg < 3:238339/135‑1 (MQ=255) aGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACg < 7:124595/135‑1 (MQ=255) aGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGa < 1:318392/136‑1 (MQ=255) aCTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGctc > 7:131758/1‑101 (MQ=255) aCTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGctc < 8:131758/101‑1 (MQ=255) ctggctggCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGcc > 1:79944/1‑39 (MQ=255) ctggctggCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGcc < 2:79944/39‑1 (MQ=255) ctggctggCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATg > 5:32106/1‑136 (MQ=255) ctggctggCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATg > 7:3102/1‑136 (MQ=255) tggcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGac > 4:364334/1‑136 (MQ=255) gcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCTGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGacca < 5:216635/136‑1 (MQ=255) gcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGCAGAGCATGTCGacca > 4:296067/1‑136 (MQ=255) gcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGacca < 2:66124/136‑1 (MQ=255) gcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGacca < 1:233345/136‑1 (MQ=255) gcAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCGCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGacca > 3:328693/1‑136 (MQ=255) gAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTg > 5:15621/1‑136 (MQ=255) gAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTg > 5:273501/1‑136 (MQ=255) gAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTg < 5:267112/136‑1 (MQ=255) cacccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGtt < 7:336689/136‑1 (MQ=255) cacccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGtt < 5:147975/136‑1 (MQ=255) acccaccGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGtt < 7:261781/135‑1 (MQ=255) cGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGt < 8:365847/136‑1 (MQ=255) cAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGACGCGCATGTCTCCCACCGGGGCGTTGATCTGTTc > 4:896/1‑136 (MQ=255) cAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTc < 7:262101/136‑1 (MQ=255) cAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTc > 6:63593/1‑136 (MQ=255) cgcCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGa < 7:69525/96‑1 (MQ=255) cgcCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGa > 8:69525/1‑96 (MQ=255) ccgccGCGCCAACCATGTAGGGGTTACGCTCGAATGTTTACAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGc < 8:361171/133‑1 (MQ=255) | CCGGCCGCATCCAGCCCGCACTCAGCCAGCATTTGCGCAGGCTTGGCATGCTCGACATAGATATCCGGCAGCCCCAGGTGCAGAAGCGGCTTGAGCACTGCCTGGCTGGCAAGGAACTCACCCACCGCAGCGCCCGCGCCACCCATGATGGCGTTCTCTTCGATGGTTACCAGCAGCTCATGGCTGCCTGCCAGCTCTAGCACCAGCGCCTCGTCCAGCGGCTTGACGAAGCGCATGTCGACCACCGTGGCGTTGATCTGTTCGGC > ACB143/605382‑605647 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |