| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 3,994,687 | C→T | S247S (AGC→AGT) | dmoA_3 → | Dimethyl‑sulfide monooxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 3,994,687 | 0 | C | T | 97.4% | 233.7 / NA | 79 | S247S (AGC→AGT) | dmoA_3 | Dimethyl‑sulfide monooxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base T (42/34); minor base G (0/2); total (43/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGAGCACTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGCGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCACGCGGGAAGAG > ACB143/3994554‑3994819 | gCGAGCACTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACTCACCCCGGTGTTGTTCCTGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTgg < 4:290254/136‑1 (MQ=255)gCGAGCACTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTgg > 3:350863/1‑136 (MQ=255)gCGAGCACTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTgg > 3:199715/1‑136 (MQ=255)gCGAGCACTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTgg < 4:211446/136‑1 (MQ=255) aGCACTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGc > 8:43840/1‑135 (MQ=255) aCTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAAc > 1:315001/1‑136 (MQ=255) aCTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAAc > 4:304749/1‑136 (MQ=255) ccAGGTGCCCGGCATGCCCCGGGGCCTGCCATCCCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCCGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGc < 8:312790/134‑1 (MQ=255) ccAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGc < 5:152396/134‑1 (MQ=255) ccAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGc < 5:128401/134‑1 (MQ=255) ccAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGc < 2:64085/134‑1 (MQ=255) ccGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCCCCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCACCGCCGACGGtgct > 1:21721/1‑136 (MQ=255) gCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTgcg > 2:185016/1‑136 (MQ=255) gCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTgcg > 7:89688/1‑136 (MQ=255) gCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTgcg > 7:84456/1‑136 (MQ=255) gCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTgcg > 8:353714/1‑136 (MQ=255) 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tgttCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCgg > 8:175569/1‑136 (MQ=255) tgttCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGAAGTTTGCCGCCCGGCATGCCGAATGCGTTTTCATAAGTGGGCCAACGCCGACGTTGCTGCGCCGATACGCCGACGGAATCCGCCAGGCATCCGAAGCGCCCgg > 8:187699/1‑136 (MQ=255) tgttACACGCAGGTGCGTCGGCACGAGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCAGATAGCGAGTTCATCAGTGTGCAAACGCCGACGGTAATGCGCCGCTACTCCGACCGCATCCGCCAGACCTGCGAAGAGGCCgg > 8:300208/1‑136 (MQ=255) ttCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCggg < 1:587/135‑1 (MQ=255) tCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCg > 4:87380/1‑136 (MQ=255) ccgcccGGGGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAAGGCGTGGTCATCCGGGGGCCACCGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTg < 3:211466/132‑1 (MQ=255) cAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTg > 5:96718/1‑136 (MQ=255) cGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGt > 2:15488/1‑136 (MQ=255) ggTGGGTCGCCACGCGGCCAGCAGTTTTCCGCACGGCTTGCCGAATGCGTGTTCTGCTGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCGGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTg < 1:380005/136‑1 (MQ=255) ggTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGTCGTGGCCGTg < 5:181037/136‑1 (MQ=255) ggTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTg < 3:368209/136‑1 (MQ=255) ggTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTg < 4:218450/136‑1 (MQ=255) 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cagTTTGCCGCACGGCATGCCGAAGGCGTGTTCATCAGGGGGCCACCGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGccc < 6:209621/136‑1 (MQ=255) gTTTGCCGCACGGCAGGCCGAATGCGGGTGCAGCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAg < 7:281480/136‑1 (MQ=255) tGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGgcg > 1:357026/1‑136 (MQ=255) aCGGCGTGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGtt > 8:180556/1‑135 (MQ=255) ggCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGAt < 6:225938/136‑1 (MQ=255) gCCGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGAtcgtcg > 1:21191/1‑136 (MQ=255) cGAATGCGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGcc > 6:362129/1‑136 (MQ=255) cGTGTTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCAc < 4:208258/135‑1 (MQ=255) gtgtTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCAcgc > 7:287918/1‑136 (MQ=255) gtgtTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCAcgc > 1:263616/1‑136 (MQ=255) gtTCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCACGCgg < 2:320421/136‑1 (MQ=255) ttCATCAGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCACGCggg < 6:103643/136‑1 (MQ=255) tcatcaGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGCCATCCGCCAGGCCAGCGAAGCCGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCCCTGTTGATCGTAGCCCCCACGCggg > 8:61043/1‑135 (MQ=255) atcaGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCACGCggg > 4:306087/1‑133 (MQ=255) caGTGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCACGCGGGAagag > 3:110970/1‑136 (MQ=255) | GCGAGCACTTCCAGGTGCCCGGCATGCACCTGTGCCAGCCATCGCCGCAACGCACCCCGGTGTTGTTCCAGGCCGGTGCGTCGGCACGCGGCCAGCAGTTTGCCGCACGGCATGCCGAATGCGTGTTCATCAGCGGGCCAACGCCGACGGTGCTGCGCCGCTACGCCGACGGCATCCGCCAGGCCTGCGAAGCGGCCGGGCGTGGCCGTGACGAAGTGCTGATCTACGCCCAGGCGCTGTTGATCGTCGCCCCCACGCGGGAAGAG > ACB143/3994554‑3994819 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |