Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | ACB143 | 5,050,496 | G→A | G225G (GGC→GGT) | hcnB ← | Hydrogen cyanide synthase subunit HcnB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 5,050,496 | 0 | G | A | 98.6% | 226.9 / ‑4.7 | 73 | G225G (GGC→GGT) | hcnB | Hydrogen cyanide synthase subunit HcnB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (53/19); total (54/19) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 |
ATAGAAGGAATCACCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACGCCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTCGCCAACCGCCTGGCGGCGTA > ACB143/5050371‑5050625 | aTAGAAGGAATCACCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTc < 4:208610/136‑1 (MQ=255) tAGAAGGAATCACCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCg < 8:151178/136‑1 (MQ=255) gAAGGAATCACCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCgcc > 4:234350/1‑134 (MQ=255) gAAGGAATCACCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGAc > 8:251496/1‑136 (MQ=255) aCCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACGCCTTTGATTCGACGGGCTCCCg > 2:90622/1‑136 (MQ=255) aCCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTccc > 6:176915/1‑135 (MQ=255) aCCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTccc > 3:369881/1‑135 (MQ=255) aCCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTccc > 3:98116/1‑135 (MQ=255) aCCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTccc > 4:156976/1‑135 (MQ=255) aCCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCg > 7:7092/1‑136 (MQ=255) aCCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACAGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCATGGCCCGCAGCTCTTTAACACCTTTGATACGACGGGCTccc > 3:306154/1‑135 (MQ=255) ccTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGc < 3:179569/136‑1 (MQ=255) ttCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGa > 6:103324/1‑136 (MQ=255) aCAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTc < 2:200979/136‑1 (MQ=255) aCAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTc < 2:217880/136‑1 (MQ=255) aCAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTc < 5:176915/136‑1 (MQ=255) aCAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTc < 1:162143/136‑1 (MQ=255) gACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGc > 3:191382/1‑136 (MQ=255) cTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATg < 5:59718/136‑1 (MQ=255) tCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCCTg > 1:192697/1‑135 (MQ=255) tCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATg > 2:128152/1‑135 (MQ=255) gCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGc > 1:10895/1‑134 (MQ=255) ggCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGc > 6:90378/1‑136 (MQ=255) ggCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGc > 3:298774/1‑136 (MQ=255) tgCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTAc < 8:205775/135‑1 (MQ=255) gCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGTATTGAAGCTGCTCAAGCCGTCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACGTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTg < 2:250169/136‑1 (MQ=255) ctgagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTTCTCACGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTg < 3:309979/133‑1 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCCCCCAGGGCCCGCAGCTCTGTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 4:219505/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 4:151604/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 5:116145/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 5:60374/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 1:76596/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 2:2654/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 2:77115/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 2:99780/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 3:310467/1‑136 (MQ=255) agagCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGAc > 6:62385/1‑136 (MQ=255) cccGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCtt > 1:364009/1‑135 (MQ=255) cccGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTCTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCtt > 6:276150/1‑135 (MQ=255) cGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGaa < 3:81733/136‑1 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCCCCCAGCGCCCGCAGCACTTTCACACCTTTGATTAGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 5:239221/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTTATTCGACGGGCTCCCGAGCGACCGATTTCATCAAGCCAAGAATGGCCCTTACTCACTTCCTTGaa > 5:273159/1‑135 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 5:327621/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 3:199066/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 1:227910/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 6:175843/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 1:131129/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 7:352416/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 2:122832/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 4:163808/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 3:292456/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 3:280049/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTAATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAAc > 5:83824/1‑136 (MQ=255) gCTTTTGAGACTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTATCACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGagc > 5:293280/1‑134 (MQ=255) gCTGTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCGGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGCGTTGCTTGatc > 7:96392/1‑134 (MQ=255) ttttGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACt > 5:285010/1‑135 (MQ=255) ttGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCa < 4:89821/135‑1 (MQ=255) cTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCa > 5:331373/1‑136 (MQ=255) cTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCa > 1:174177/1‑136 (MQ=255) aaTTGCAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATc < 5:48401/135‑1 (MQ=255) aaTTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCg < 3:174274/136‑1 (MQ=255) aTTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACTGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCg < 4:98116/135‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAg < 8:7092/136‑1 (MQ=255) cATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGcgcgcg > 8:220281/1‑136 (MQ=255) tCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGCGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTc > 4:61970/1‑136 (MQ=255) tCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTc > 3:86130/1‑136 (MQ=255) tCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTc > 3:232373/1‑136 (MQ=255) tCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTc > 8:49875/1‑136 (MQ=255) tCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCATTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGACCATGGAAGCGCGCGTc > 8:218215/1‑136 (MQ=255) ccGCAGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTCGCCAACCGCCt < 1:122832/136‑1 (MQ=255) aGCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTCGCCAACCGCCTggcg > 4:325002/1‑136 (MQ=255) gCTCTTTCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTCGCCAACCGCCTggcgg > 8:311136/1‑136 (MQ=255) tCACACCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTCGCCAACCGCCTGGCGGCgta < 8:152552/134‑1 (MQ=255) | ATAGAAGGAATCACCCCTTCGTGGGACAGTAGGACGCTCGCCGGCACTGTGCAGAGCTCCCCGCTTTTGAGCCTGAATTGAAGCTGCTCAAGCCGGCCATCACCCAGGGCCCGCAGCTCTTTCACGCCTTTGATTCGACGGGCTCCCGAGCGACGGATTTCATGCAGCCATGCAAGGCCCTTACTGACTTCCTTGAACTCAGCAACCATCGAGCTCGCCCATGGAAGCGCGCGTCGCCAACCGCCTGGCGGCGTA > ACB143/5050371‑5050625 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |