Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB143 | 5,390,745 | G→A | 6.6% | G280D (GGC→GAC) | ligH → | 10‑formyltetrahydrofolate synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 5,390,745 | 0 | G | A | 6.6% | 251.2 / 6.1 | 76 | G280D (GGC→GAC) | ligH | 10‑formyltetrahydrofolate synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/21); new base A (3/2); total (53/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.39e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.88e-01 |
TGGCCAGCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAGGCGGGCCTCAAGCCCTC > ACB143/5390613‑5390880 | tGGCCAGCGAGGTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTAAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGAGATCATCCATGGCGGCACCATCGCGAACATCGCGCATGGc > 7:317486/1‑134 (MQ=255) tGGCCAGCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTg > 8:96084/1‑136 (MQ=255) tGGCCAGCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTg > 3:189948/1‑136 (MQ=255) tGGCCAGCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTg > 2:89001/1‑136 (MQ=255) tGGCCAGCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCGGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTg > 4:277010/1‑136 (MQ=255) aGCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGTGAACATCGCGCATGGCTGCAACt > 1:39071/1‑136 (MQ=255) gCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGACTGCAACTc < 5:106638/136‑1 (MQ=255) cGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGTGCATGGCTGCAACTCg > 7:3426/1‑136 (MQ=255) gCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTg > 7:118954/1‑136 (MQ=255) gCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTg < 5:6676/136‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTg > 5:201918/1‑136 (MQ=255) gCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTg > 2:243135/1‑136 (MQ=255) gCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTg < 1:243135/136‑1 (MQ=255) gCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCGGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCTAACATGGGGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTg < 6:388834/136‑1 (MQ=255) aCCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCCCCAAGCCCGCGCTc > 6:292283/1‑135 (MQ=255) tgctgcTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGAt < 5:163888/136‑1 (MQ=255) tgctgcTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGAt < 7:18852/136‑1 (MQ=255) gctgctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATTGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGAt < 3:353945/135‑1 (MQ=255) tgctCAAGTACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCCCCCAGACCGAGCTCAAGATCGc > 2:97072/1‑136 (MQ=255) tgctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGc > 6:218553/1‑136 (MQ=255) tgctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGc > 5:55640/1‑136 (MQ=255) tgctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGc > 4:50035/1‑136 (MQ=255) tgctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGc > 2:229551/1‑136 (MQ=255) tgctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGc > 3:187263/1‑136 (MQ=255) ggctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGc > 5:2660/2‑136 (MQ=255) ggctCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACACGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGc > 4:19039/2‑136 (MQ=255) aaGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGCCCGCGCTCAAGATCGCCGag > 6:338304/1‑134 (MQ=255) aaGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGCACGCGCTCAAGATCGCCGAtt > 2:405649/1‑136 (MQ=255) aaGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGAt > 7:127879/1‑135 (MQ=255) aaGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGAt > 1:234796/1‑135 (MQ=255) ggACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTAt < 1:211675/136‑1 (MQ=255) cgcgCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTAtgtg > 6:293839/1‑136 (MQ=255) tGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGAc > 3:124148/1‑136 (MQ=255) tGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGAc > 8:74399/1‑136 (MQ=255) tGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGAc > 8:253178/1‑136 (MQ=255) gCCGAACATGGTGCAGACGCGTGAGACTAATCCGGTGCTCCTCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGaa < 6:23787/136‑1 (MQ=255) aCATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGGGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCgg < 7:1283/136‑1 (MQ=255) aTGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCt > 1:295001/1‑136 (MQ=255) ggTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTc > 6:186986/1‑136 (MQ=255) cAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGt < 7:56535/135‑1 (MQ=255) aCGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCg < 7:284429/130‑1 (MQ=255) aCGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCg > 8:284429/1‑130 (MQ=255) cTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGAcc < 3:252446/136‑1 (MQ=255) gaATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGt > 5:49244/1‑136 (MQ=255) gaATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGt > 3:375384/1‑136 (MQ=255) gaATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGt > 6:167531/1‑136 (MQ=255) gaATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGt > 3:252722/1‑136 (MQ=255) ccGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGgag > 1:371086/1‑135 (MQ=255) ggTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGTCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAg > 7:362902/1‑136 (MQ=255) ggTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAg > 1:110366/1‑136 (MQ=255) ggTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAg > 2:313407/1‑136 (MQ=255) ggTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAg > 2:62430/1‑136 (MQ=255) ggTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAg > 1:60099/1‑136 (MQ=255) tGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGtt < 4:67015/136‑1 (MQ=255) tGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGtt < 1:89001/136‑1 (MQ=255) cTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGttct < 3:124203/136‑1 (MQ=255) cTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGttct < 3:352630/136‑1 (MQ=255) tCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGACGCCGGCTTCGGTGCCGCCCTGGGTGCGGCGAAGtgctt > 7:97670/1‑136 (MQ=255) tCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGttct > 3:16498/1‑135 (MQ=255) tCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGACTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGttctt > 8:12568/1‑136 (MQ=255) cATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGACTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGCCCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACa > 7:264930/1‑136 (MQ=255) cggcCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCaaa > 7:19350/1‑136 (MQ=255) cggcCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCaaa > 7:9038/1‑136 (MQ=255) cggcCCGTTCGCGAACATCGCGCATGACTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCaaa > 7:124576/1‑136 (MQ=255) cGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGCTCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCg > 2:9117/1‑136 (MQ=255) cGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGCCCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCg > 1:109054/1‑136 (MQ=255) cGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGCCCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCg > 6:206518/1‑136 (MQ=255) ttCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCa < 8:118954/136‑1 (MQ=255) gcgAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAg < 2:322664/135‑1 (MQ=255) gcgAACATCGCGCATGACTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAg < 6:67215/135‑1 (MQ=255) gcgAACATCGCGCAGGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGAGGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAg < 2:188458/135‑1 (MQ=255) gcATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCgg < 3:309954/72‑1 (MQ=255) gcATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCgg > 4:309954/1‑72 (MQ=255) gcATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAGGCGGGCCTCAAg > 1:254449/1‑136 (MQ=255) cATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAGGCGGGCCTCAAGc < 2:377635/136‑1 (MQ=255) aTGGCTGCAACTCGGTGCTCGCAACCAAGAACGCGCTAAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAGGCGGGCCTCAAGca > 8:72880/1‑135 (MQ=255) gCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAGGCGGGCCTCAAGCCCTc < 2:234796/136‑1 (MQ=255) | TGGCCAGCGAGCTGAATGCCTCGGGCGCCATGACCGTGCTGCTCAAGGACGCGCTGCAGCCGAACATGGTGCAGACGCTGGAGAATAATCCGGTGCTCATCCATGGCGGCCCGTTCGCGAACATCGCGCATGGCTGCAACTCGGTGCTCGCCACCAAGACCGCGCTCAAGATCGCCGATTATGTGGTGACGGAAGCCGGCTTCGGTGCCGACCTGGGTGCGGAGAAGTTCTTCGACATCAAATGCCGCAAGGCGGGCCTCAAGCCCTC > ACB143/5390613‑5390880 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |