Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB143 | 6,120,698 | G→A | 5.6% | A35V (GCG→GTG) | gbsA ← | Betaine aldehyde dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 6,120,698 | 0 | G | A | 5.6% | 247.2 / 2.1 | 71 | A35V (GCG→GTG) | gbsA | Betaine aldehyde dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (36/31); new base A (2/2); total (38/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGCGGCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAGT > ACB143/6120568‑6120831 | cgcgGCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGc < 3:11391/132‑1 (MQ=255) gaaaCCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCGGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 5:139727/134‑1 (MQ=255) gCAACCTCACGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 6:311398/136‑1 (MQ=255) gCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCATAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 4:104643/136‑1 (MQ=255) gCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 3:105599/136‑1 (MQ=255) gCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 5:270689/136‑1 (MQ=255) gCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 5:31848/136‑1 (MQ=255) gCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 3:275720/136‑1 (MQ=255) gCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTGCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGt < 5:155394/136‑1 (MQ=255) ccTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCgt > 8:243832/1‑136 (MQ=255) aaGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCgtggtg < 4:11536/136‑1 (MQ=255) aaGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCgtggt < 3:166657/135‑1 (MQ=255) aaGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCgtggt < 4:306999/135‑1 (MQ=255) aaGCAACCAGGGCACCCGATGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGTGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCgtggtg < 8:111646/136‑1 (MQ=255) cAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGGGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGt < 3:152238/136‑1 (MQ=255) gTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTtgt > 2:280750/1‑136 (MQ=255) gTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGGCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTtgt < 2:317759/136‑1 (MQ=255) cACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTtgtg > 6:270531/1‑135 (MQ=255) ccGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATa < 5:112323/136‑1 (MQ=255) ccGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATa < 3:56309/136‑1 (MQ=255) gCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACt < 6:200108/136‑1 (MQ=255) cgcAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAg < 7:246568/135‑1 (MQ=255) cAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGtg > 4:223307/1‑136 (MQ=255) ggACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGtgct < 5:223095/136‑1 (MQ=255) cGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGt > 5:206066/1‑136 (MQ=255) cGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGt > 6:259739/1‑136 (MQ=255) cGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGt > 6:251699/1‑136 (MQ=255) cGGTTCAGAGCGTTGCTGACAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCAGTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGt > 7:105350/1‑136 (MQ=255) cAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGTCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTc > 8:40850/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGcc < 6:269471/88‑1 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGcc > 5:269471/1‑88 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATAGTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 3:68420/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 6:265147/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 2:8699/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 6:70868/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 1:313783/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 2:119892/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 3:216550/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc > 2:181239/1‑136 (MQ=255) tGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCAGTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCCCAAGGTCCCTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTgcacgac > 7:125421/1‑130 (MQ=255) tCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc < 2:177801/134‑1 (MQ=255) tCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTc < 4:216550/134‑1 (MQ=255) gccgccTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGt < 5:134694/136‑1 (MQ=255) cgccTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGc > 3:233673/1‑136 (MQ=255) cgccTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCACCACAAGGTCCGTGGTGcc > 2:35900/1‑69 (MQ=255) cgccTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCACCACAAGGTCCGTGGTGcc > 2:31350/1‑69 (MQ=255) cgccTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCACCACAAGGTCCGTGGTGcc < 1:35900/69‑1 (MQ=255) cgccTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCACCACAAGGTCCGTGGTGcc < 1:31350/69‑1 (MQ=255) gccTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCg < 2:27780/136‑1 (MQ=255) gCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCAAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTTGCCGTCGATGCAGGTTAGCCAGTGCGGAGc > 3:189957/1‑136 (MQ=255) cAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGc < 3:2689/135‑1 (MQ=255) cAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGc < 1:205083/135‑1 (MQ=255) cAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCt < 1:22405/136‑1 (MQ=255) cGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCatgat < 2:202641/136‑1 (MQ=255) gCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGgc < 1:280750/135‑1 (MQ=255) tGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGt > 6:141517/1‑136 (MQ=255) gggCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGtt > 8:262722/1‑136 (MQ=255) ggCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAATGTTAGCCAGTGCGGAGCTATAGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGtt > 3:219348/1‑135 (MQ=255) gATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAg > 8:61223/1‑135 (MQ=255) gATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAg > 3:45282/1‑135 (MQ=255) gATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAg > 3:150514/1‑135 (MQ=255) gATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAg > 3:122982/1‑135 (MQ=255) aTGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGca > 1:308286/1‑136 (MQ=255) gTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAg < 7:105648/136‑1 (MQ=255) tCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATTATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAGt > 3:259941/1‑136 (MQ=255) tCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAg > 4:217447/1‑135 (MQ=255) tCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAg > 4:119079/1‑135 (MQ=255) tCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAGt > 5:57557/1‑136 (MQ=255) tCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAGt > 1:29923/1‑136 (MQ=255) tCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAGt > 1:273655/1‑136 (MQ=255) tCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAGt > 1:207657/1‑136 (MQ=255) | CGCGGCAACCTCAAGCAACCAGGTCACCCGCTGCGCAGGACGCACACGGTTCAGAGCGTTGCTGTCAGCACAGCGCCGAGCCGCCTGCAGGGCGCATTCGGCGTCGGCCACACTGGCTTGGGCGATGGTCGCCACAAGGTCCGTGGTGCCAGGGTTGTGGATACTCAGGTGCTGCTCACTGTCGGTCCACTGGCCGTCGATGAAGTTTAGCCAGTGCGGAGCTATCGGATGCATGATGATCACCTCAGGCGCGTTGAGCACAGT > ACB143/6120568‑6120831 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |