| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,860:1 | (GGTACCTGCGG)1→2 | 89.8% | intergenic (‑53/+130) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676847 | 8 (0.380) | 72 (3.330) +GGGGTACCTGC |
58/222 | NT | 89.8% | intergenic (‑40/+143) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676848 = | 9 (0.380) | intergenic (‑41/+142) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
GGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676701‑3676847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTT > CP009273/3676848‑3676982 ||||||||||| GGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGG < 2:431863/149‑1 ATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGGCCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTGATGG > 1:375140/1‑143 TTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGG < 1:361457/143‑1 GCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCG < 2:292261/149‑1 GCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCG < 2:285384/149‑1 TCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGATTATGGGGTATCTGCGGG > 2:419698/1‑149 GCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGg > 2:332932/1‑148 ATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATAACAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTACACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTCACAACACATGTCTTGTAGGGTTATGGGATACCTGCGGGGTACCT > 2:226445/1‑149 TTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCGCCGGGGTACCTG > 2:107847/1‑149 AGGATAGAAATTGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCGGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGC < 2:314008/149‑1 AGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGC < 2:255351/149‑1 GATCGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGCGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCGCATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGGACCTGCGGCCT > 2:260735/1‑149 TAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCG > 1:255189/1‑143 GAAGTGGCCAAGGAGGATGCCAATGGCTATCGCTGTGAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTGAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGC < 1:342567/143‑1 GAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGC < 1:162150/143‑1 AAATGGCCAAGGAGAATACCCATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTCCCTGCAGAGTACCTGCGGCCTTAAca > 2:29057/1‑147 AAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAA < 2:82320/149‑1 AAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAA < 2:312089/149‑1 AATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAAT > 2:105930/1‑149 TGGCTAAGGAGAATACCAAGGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAA < 2:173205/149‑1 GGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAAC < 2:370301/149‑1 GCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAA < 1:321659/143‑1 CCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAA > 1:89659/1‑143 CAAGGGGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACC < 2:333649/149‑1 CAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTGTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAAT > 1:20820/1‑143 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCC > 2:262191/1‑149 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCC > 2:262159/1‑149 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATA < 1:348074/143‑1 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCAGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAAGTCTTGTGAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCC > 2:321339/1‑149 AGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTACGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACGTGCGGCAGTAAAATAACACCCA > 2:118733/1‑149 GAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGGGGGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGA > 2:230492/1‑149 AGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGAC > 2:392252/1‑149 ATACCTATGGCTATCGCGGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTGAAACAGAGAGGTTTTCATAGTGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTCTAAGGTTATGGTGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCA < 1:60537/143‑1 TACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTTCGGGGTACCGGCGGCCTTAAAATCACACCCcg > 1:25580/1‑141 cggtgttgGGACCTGAAAGTAAAGGCTTGTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTTCCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTA < 2:204202/141‑1 TCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTACACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACCAGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTACGGCCTTAAAATAACACCAAGCGCACATCAGAGTAAAGT > 1:352165/1‑143 AGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTGATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT > 2:343002/1‑149 CTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAA > 2:141511/1‑149 CTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAGGTACCTGGATCATAA > 2:28717/1‑149 CTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTACTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGA > 1:149343/1‑143 TGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACCGAAATGTACCTGGATCATAAT > 2:192725/1‑149 ggAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAATACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGGACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTCGAct < 1:256779/141‑3 GAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAcc > 1:77875/1‑141 GTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCGTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAA > 2:256226/1‑149 TAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGACCATAAT > 1:137799/1‑143 TAAAGGCTTTACAACAGAGGGGTTTTCATAGGGGGTCTTTTAGTAAAACCACAGGTCGTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAAT < 1:150990/143‑1 GCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGTTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAA < 2:365590/149‑1 CTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAACACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAG < 2:70823/149‑1 TTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAA > 1:9689/1‑143 TTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAGCACAGAAATGTACCTGGTTCATAATTGAAACAAA > 1:9652/1‑143 AAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGGTCATAATTAAGACCAAAAGGTTAA > 2:169536/1‑149 AAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGAGGACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGCATCATAATTGAAACAAAAA > 1:111875/1‑143 AACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAG < 1:226583/143‑1 GAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTT < 2:108832/149‑1 AGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGACATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAACGGTTAAAAAGTTTG > 2:398582/1‑149 GGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGGAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGA < 2:384402/149‑1 GTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAG > 2:201816/1‑149 GTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAG < 2:35496/149‑1 GTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAG > 1:373379/1‑143 GTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAAAATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAG < 2:85916/149‑1 TTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGT > 1:291066/1‑143 TTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCAAATGTCTTGTAAGGTTATGTGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATAAAAAAAAAAAGGTTAAAAAGTT < 1:296449/143‑1 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AAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAG > 1:225949/1‑143 atGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTT < 1:95913/141‑1 GTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCCCAAACCAGCACTTTTTAAAGGTT > 2:152678/1‑149 TTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAG > 1:377170/1‑143 TGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTA < 2:95342/149‑1 TGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTA < 2:95320/149‑1 GTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAA < 2:286394/149‑1 AAGGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGGTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATC < 2:4196/149‑1 GGTTATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGT > 1:278126/1‑143 TATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTT > 2:181734/1‑149 TATGGGGTACCTGCGGGGTACCTGCGGCCTTAAAACAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTT < 2:347113/149‑1 ||||||||||| GGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676701‑3676847‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTT > CP009273/3676848‑3676982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |