| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1046001 | 114 (0.970) | 134 (1.140) | 92/292 | 0.1 | 69.1% | intergenic (+15/+418) | insB1/cspH | IS1 transposase B/stress protein, member of the CspA‑family |
| ? | CP009273 | 1973115 = | 6 (0.050) | intergenic (‑661/‑119) | flhD/uspC | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/universal stress protein | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TTGAGCGGTATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1045856‑1046001‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGT > CP009273/1973115‑1973262 GTATAACCTGAAGCTGCGGCAGCACCTGGCACTTCAGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTAC < 2:1527658/149‑1 TAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAA < 2:1908801/149‑1 TAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTT > 1:845893/1‑144 TAACCCGAAGCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAA < 2:176917/149‑1 AACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTA > 1:641116/1‑144 CCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACCCTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACT > 1:1500009/1‑144 ccGAATCGTAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTTCCTGTCGTCCTCATAATCGGTGTAGCTGCATGACAAAGTTATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTA < 1:418963/142‑1 CTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAGTCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAAAGTAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTAACTTATCTTTACTA > 1:1192816/1‑144 CTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTA > 1:224459/1‑144 CTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCACCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTA > 1:1606383/1‑144 TGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTA > 2:1806493/1‑149 GAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAG > 1:245287/1‑144 GCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTGTCTTTACTAATAATCAGACTAATAT > 2:215613/1‑149 GCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACT > 1:1525465/1‑144 AGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTT > 2:1780697/1‑149 ACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATGAGTTGGGGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATAGTTACC > 2:539551/1‑149 ccgGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCT < 2:1697876/146‑1 CTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCGGCCTAATATTT > 1:710603/1‑144 GGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTT > 2:729955/1‑149 GGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTT > 2:1919272/1‑149 GCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTT < 2:535998/149‑1 CGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGT < 1:254648/144‑1 CGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTAGCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGT < 1:395906/144‑1 TGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAG > 2:1242337/1‑149 TGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTACATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCATTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGA > 1:928153/1‑144 TGGGACGGAAGGCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTACATGACAAAGTCGTCGGGCGTTATCTGAACATAAAACACGATCAATGAGTTGGGGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATCTTTACCGGTTTGA > 1:600662/1‑144 GGGACGGAAGTCGCGGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGAC < 1:1428910/144‑1 GGACGGAAGTCGCTATCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTT < 2:1878935/149‑1 cAGTCGCTTTCGTCCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTG < 1:182849/143‑1 CGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGT > 2:1505842/1‑149 CGCTGTCGTTCGCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGT < 2:395268/149‑1 GCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATATGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGGGTTGGGCTT > 1:1127336/1‑144 TGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGC > 1:1375482/1‑144 TCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTT > 2:1124930/1‑149 TCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTT > 2:1896613/1‑149 TCGTTCTCAAAATCGATGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGT > 1:1004758/1‑144 GTTCTCAACAGCGGTGGAGCTGCATGACAACGTCATCGGGCATTATCTGAACCTAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGTTTGCGTCG < 1:1226997/144‑1 GTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCT > 2:886011/1‑149 CTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTT > 1:221492/1‑144 CTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTT > 1:1565776/1‑144 TCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGTGTCGTTTCTCCAT < 2:1351064/149‑1 aacATCGGTGCAGCTGCATGACAAAGTCATCGGTCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCACACTAATATTTACCTGTTTTACCGAGTTGTGATTGCGTCGTTTCTC < 1:1185955/141‑1 AAAATCGGTGGTGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATCAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTA < 2:55665/149‑1 AAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTC > 1:388141/1‑144 AAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTTAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAG < 2:229770/149‑1 AAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAG < 2:1669019/149‑1 AAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAG > 2:812739/1‑149 CGGGGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTA < 1:131244/144‑1 GTGGGGCTGCATGAAAAAGTCAACGGGCATTATCTGAACATAATACACTATGAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACTGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAA < 2:581450/149‑1 GTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTGATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCAATAGG > 1:103838/1‑144 TGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAA < 2:248559/149‑1 TGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGA < 1:615659/144‑1 GGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAG > 2:143249/1‑149 TGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTCAAG > 1:1639959/1‑144 GCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGC > 1:1222794/1‑144 CATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAAT > 2:1611387/1‑149 tccTCGGGCGTTATCTGAACAGAAAACACTATCAATAAGTTGTGGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCTGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCAC < 1:1092667/141‑1 TCATCGGGCATTATCTGAACATCAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAA < 2:1587921/149‑1 TCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAA < 2:1273293/149‑1 TCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTCCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCCCCTGca > 2:1571779/1‑147 TCATCGGGCATTAACTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGTGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAA < 2:1098899/149‑1 CATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAG < 2:898279/149‑1 ATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATACGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGATTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAACCTTTACTGTCACCg > 1:1595706/1‑143 ATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCT < 1:1356497/144‑1 CGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGGCCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGA > 1:738902/1‑144 GGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAACTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCAC < 2:14043/149‑1 GCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACA < 2:1489549/149‑1 ATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACA < 1:691192/144‑1 gCTGCACATAAAACACTACCAATAAGTTGGAGTTATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGTGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAA < 2:427424/148‑1 TCTGAACATAAAACACTATCCATAGGCTGGAGTCCTTACCGTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATCTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAA < 2:63247/149‑1 TGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTAACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCCGAAGTTCACAGAA > 1:52548/1‑144 CATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGTAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAG > 1:195468/1‑144 CATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAG < 1:1570708/144‑1 CATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAG < 1:1713312/144‑1 ATAAAACCCGATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATTATCTTACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAG < 2:266867/149‑1 AAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAA < 1:1770468/144‑1 AAACACTAGCAATAAGTTGGAGTCATTACCTGATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGAGTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAAC < 1:1268044/144‑1 AACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTA < 2:829396/149‑1 CACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATATTTCATTTTTATATTTCTCATGTTTTCCTCTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGG < 1:1764301/144‑1 ACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGA < 2:148603/149‑1 TATCAATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGC > 2:103800/1‑149 AATCAGTTGGAGTCATTAGCTTATTTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTGTGAGCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTACTGTCACCTGAAGTTCACAGAATAACGAACAGGTTATGtg < 1:1615210/144‑3 AATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGGCCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATA < 2:1222635/149‑1 AATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAG > 1:1042400/1‑144 ATAAGTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATATAACTATATGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGCAACAGGTTATGAGCTATAG < 2:1440992/149‑1 tacgTGGAGTCATTACCCTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTA < 1:822493/140‑1 GTTGGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATA < 1:504109/144‑1 GGAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATT < 2:702319/149‑1 GAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTC < 2:1809510/149‑1 GAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTC > 2:705335/1‑149 GAGTCATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCCCCATTAGGAGTACAGCTGTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACCGGTTATAGGCTCTAGCACTATTC > 2:1748349/1‑149 GTCATTACCTTAGTTTGACTAATTATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTT < 2:13055/149‑1 GTCATGACCTTATCTTTACTAATAATCAGCCTAACAATTACCGTTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTT < 2:548440/149‑1 CATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGT > 2:803286/1‑149 ATTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAACGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTC > 1:1362548/1‑144 TTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGGAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCT > 1:1247234/1‑144 TTACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCGGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCT > 1:481570/1‑144 ACCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCT > 2:1644561/1‑149 CCTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTG > 2:400/1‑149 CTTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGT > 2:1743794/1‑149 TTGAGCGGTATAACCTGAATCTGAGGCAGCACCTGGCACGGCTGGGACGGAAGTCGCTGTCGTTCTCAAAATCGGTGGAGCTGCATGACAAAGTCATCGGGCATTATCTGAACATAAAACACTATCAATAAGTTGGAGTCATTACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1045856‑1046001‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATCTTTACTAATAATCAGACTAATATTTACCTGTTTGACCGAGTTGGGATTGCGTCGTTTCTCCATTAGGAGTAAAGCTTTAATGTCACCTGAAGTTCACAGAATAAGGAACAGGTTATGAGCTATAGCAATATTCTTGTCGCTGT > CP009273/1973115‑1973262 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |