| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1045234 = | 98 (1.400) | 49 (0.700) | 36/276 | NT | 45.2% | intergenic (‑34/‑55) | gfcA/insA | O‑antigen capsule production threonine‑rich inner membrane protein/IS1 repressor TnpA |
| ? | CP009273 | = 1973123 | 21 (0.300) | intergenic (‑669/‑111) | flhD/uspC | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/universal stress protein | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GTGCCAGTAGTACCCGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCT > CP009273/1045088‑1045380 | gtgCCAGTAGTTCCCGGCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGt < 1:324131/149‑1 (MQ=255) gCCAGTAGTACCCGTGGTCGCCTCGGGCCCGTCTGCTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCGGGCGTCGTCAAAATGAAGGCCATACGGATTGCAGAAAGGTTGTGTTTCAGAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGGCAATACGGGTGa < 2:595806/149‑1 (MQ=255) aagaaaggcaacaatcaacttaatgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGa > 1:615706‑M1/145‑149 (MQ=255) agaaaggcaacaatcaacttaatgttaatgaaatgttttacatagattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaggtaat < 2:755790‑M1/6‑4 (MQ=255) aaaggcaacaatcaacttaatgttaatgaaatgttttacatatattaactacttgtttaatgcggagaatcagtacactatgttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGAtgc > 2:243939‑M1/142‑149 (MQ=255) gtagtaCCCGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTGATTCATCGCATGGACAATACGGGTGAtgct > 1:1002358/1‑149 (MQ=255) tagtaCCCGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGAtgctg > 1:633290/1‑149 (MQ=255) ggcaacaatcaacttaatgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgttaaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGAtgctgc > 1:35145‑M1/139‑149 (MQ=255) gtaCCCGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGcc < 1:997664/149‑1 (MQ=255) gcatcaatcaacttaatgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGcc > 1:662061‑M1/138‑149 (MQ=255) caacaatcaacttaatgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCa > 1:545292‑M1/137‑149 (MQ=255) aacaatcaacttaatgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCaa > 2:864825‑M1/136‑149 (MQ=255) ccGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATACGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACATTCCGGATGACGCTGCCAACt > 1:497229/1‑149 (MQ=255) ccGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGGCAACt > 2:481224/1‑149 (MQ=255) ccGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACt > 1:1015467/1‑149 (MQ=255) gtcgtTGCGGCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCGGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGACAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTa < 2:7470/149‑1 (MQ=255) acttaatgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGa < 1:345171‑M1/22‑1 (MQ=255) tGCCTCGGTGCCGTTTGTTGCGTCAGGGGCAGCAAACGCAGCGGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAt < 2:357437/149‑1 (MQ=255) tGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAt < 2:1183823/149‑1 (MQ=255) tgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGCTCTAgt < 2:656240‑M1/28‑1 (MQ=255) tgttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAgt > 1:193700‑M1/122‑149 (MQ=255) cGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGGTTTAgt > 1:334518/1‑149 (MQ=255) gttaatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAgtg < 2:789107‑M1/29‑1 (MQ=255) gTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAgtgt > 1:1050256/1‑149 (MQ=255) taatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaagttatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATTCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTa < 2:414392‑M1/31‑1 (MQ=255) taatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTa < 2:38594‑M1/31‑1 (MQ=255) aatgaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTat > 1:861927‑M1/118‑149 (MQ=255) aatgaaatgttttacagatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTat > 1:42887‑M1/118‑149 (MQ=255) gaaatgttttacatatattaaccacttgtttaatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTatgat > 1:115139‑M1/115‑149 (MQ=255) ttaattCAGTGGCAGAAATCATCGCCGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGgtgt > 2:887113/5‑149 (MQ=38) gCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGAGTCGGCAAGATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCGGCCAACTTACTGAGTTAGTGTATGATGGTGttt > 2:270792/1‑149 (MQ=255) cAGGGGCAGAAAAGGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGa < 2:192465/149‑1 (MQ=255) aGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAg < 2:389653/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGtt < 1:795201/149‑1 (MQ=255) ggCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGAGGCTGCCAAATTACGGATTTAGTGGATGATGGTATTATTGACGtt > 2:366774/1‑149 (MQ=255) ggCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGAATTGACGAAAGCTTGTGATCCCTCCCTTTTCCTTTATTCATCTTATTTACAAGACGGCATTTGCGCCCAACTTTCTGCTGTAGGGTATGATGGTGTTTTTGAGGtt > 2:1220113/1‑149 (MQ=255) gcagcaAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTtc < 1:121538/149‑1 (MQ=255) caAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGGGTTTTTGAGGTTCTCCa > 1:640332/1‑149 (MQ=255) gCAGCTGGCGGCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGc < 1:447765/149‑1 (MQ=255) gCAGCCGCCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGc < 1:193998/149‑1 (MQ=255) gCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTc < 1:425783/149‑1 (MQ=255) taatgcggagaatcagtacactattttcttataattacatttgaaattatatgatcaccgggagtgattgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTg > 1:1155831‑M1/85‑149 (MQ=255) ggCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTTTTCATCGCCTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGt > 2:200228/1‑149 (MQ=255) 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aTAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTaa < 2:1015467/149‑1 (MQ=255) aTAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTaa < 1:598572/149‑1 (MQ=255) aTAACTTTGCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTaa < 1:681171/149‑1 (MQ=255) ttttCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTATTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCa < 1:687767/149‑1 (MQ=255) ttttCCCTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCa < 2:88281/149‑1 (MQ=255) cTTTATTCATCGCATGGACAATACGGATGCGTCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGGTGGTGTTGTTGAGGTTGTCCAGTGGATTCTGTTTCTATAAGCTGTCCCTCCTATTCAGCTACTTAGGGGGTGGTGCGTGCGGGCaaaacg > 2:85697/1‑147 (MQ=17) tttATTCATCGCATGGACAATGCGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCa < 2:539853/149‑1 (MQ=255) tttATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAAGATGTTTTTGAGATTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCACCTGTTCCGCTCCTGACCGGGTGCTGCGTGACGGCAAAAGCa > 1:1031482/1‑149 (MQ=17) tATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACt < 1:180805/149‑1 (MQ=255) attgattaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCg > 1:492011‑M1/19‑149 (MQ=255) aTCGCATGGACAATACGGGTGATCCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCGATCAGCTGTCCCGCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCgg > 2:849207/1‑149 (MQ=255) attaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTGCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACa < 1:1212249‑M1/135‑1 (MQ=255) attaattatctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGGGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACa < 1:951599‑M1/135‑1 (MQ=255) aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc < 1:932407/149‑1 (MQ=255) aTGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATc > 2:864842/1‑149 (MQ=255) gACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACCGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCGCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAACAGCACTGCCGGACATCacc > 2:707479/1‑147 (MQ=255) cAATACGGGTGATGCTGCCAACTTAATGATTTATTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCACCTGTCCCTCCTGTACAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTTACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAgcgc < 1:755653/149‑1 (MQ=11) atcgttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAgcgc > 1:315359‑M1/8‑149 (MQ=255) tctttaGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGGATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTTTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCt > 2:598854‑M1/7‑149 (MQ=255) aaTACGGTGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCt < 2:1024029/149‑1 (MQ=25) ctttaGGGGGTGCTGCCGACTTGCTGGTTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGGGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTa > 2:476504‑M1/6‑149 (MQ=255) taGGTTATGCTGCCAACTTACTGATTCAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCATAAAGGAAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTAtct > 2:1111198‑M1/3‑149 (MQ=255) | GTGCCAGTAGTACCCGTCGTTGCCTCGGTCCCGTTTGTTGCTTCAGGGGCAGCAAACGCAGCTGGCGTCGTCAACATGAAGGCCATAAGGATTGCAGAAAGCTTGTGTTTCATAACTTTTCCTTTATTCATCGCATGGACAATACGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTTCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACTGCCGGACATCAGCGCTATCT > CP009273/1045088‑1045380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |