| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,871 | +TAA | intergenic (‑64/+119) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676866 | 1 (0.010) | 64 (0.800) +AAT |
52/280 | 0.5 | 98.5% | intergenic (‑59/+124) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676867 = | 1 (0.010) | intergenic (‑60/+123) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
TTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676720‑3676866‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAC > CP009273/3676867‑3677009 ||| TTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAA < 2:69343/149‑1TTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCCGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGTGGTACCTGCGGCCTTAAAA > 2:156833/1‑149TTTCAGGATAGAAAGGGCCAAGGAGAATACCAATGGCCATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAA < 2:730730/149‑1 GATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAGAATAATAA > 1:775494/1‑149 GATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAA < 1:845438/149‑1 GATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGGACCTGCGGCCTTAAAATAATAA < 2:1282161/149‑1 GATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGCTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAA < 1:863129/149‑1 AATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGATTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCA > 2:1250023/1‑149 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACA > 1:45097/1‑149 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAAAACCCAGACACCA > 2:1272816/1‑149 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCAGAGGGTATCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTGGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATGATAACACCCGGACAGCA > 1:1281854/1‑149 AGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAGTAATAACACCCAGACAACAT > 2:1021581/1‑149 GAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTACAATAATAACACCCAGACAACATCA > 1:78474/1‑149 AATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCGGAAAGTAAAGGCTTGTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAATACACAGGTCGTGTAAGGTTATCGGGTACGTGCGGCCTTAAAATAATCGCACCTAGACAACATCACAG < 2:657311/149‑1 TACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAA > 1:156604/1‑149 ACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAA < 1:477731/149‑1 CAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATG > 1:845146/1‑149 CAATGACTATCGCCGTCACGACCTGAAAGAAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTACAGCATTATAAGAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATG > 2:277812/1‑149 AATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGTTTTTCATAGGGTATCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACTCCCAGACAACATCACAGAAATGT < 2:912550/149‑1 AATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTACGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCCTAGAAATGT > 2:578698/1‑149 TGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAGCAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTAC > 2:549767/1‑149 TCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT < 2:41004/149‑1 TCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTACTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCCGACAACATCCCAGAAATGTACCTGGAT > 2:862027/1‑149 TCGCCGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAGGAACCAGGAT > 2:420506/1‑149 ACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAA > 1:149683/1‑149 AGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGGCTAGTAAGGTTATGGGGTACCTGCTGCCTTAGAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTAAGACAAAAAAGTTAA > 1:416496/1‑149 GCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAA > 2:1063161/1‑149 TAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGCCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTT < 1:465423/149‑1 AACAGGGAGGTTTTCAGAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAAGAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGA < 1:642811/149‑1 AGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCT > 1:133189/1‑149 GGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTC < 2:411927/149‑1 GTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAATAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCG < 1:686009/149‑1 TTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGC > 1:949744/1‑149 TTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGGCTTGTAAGTTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCAAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCA < 2:217034/149‑1 ATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAAATGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAA < 2:156604/149‑1 AGTAAATCCACAGGTCTTGTAAGGGTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAA < 2:706047/149‑1 AGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAA > 2:551491/1‑149 TAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCCTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACCAAACAGCACTTTGTAAAG > 2:782129/1‑149 AAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGT < 1:289619/149‑1 AAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCCCAAACCAGCACTTTTTAAAGTT > 1:345942/1‑149 AAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTT > 1:1019269/1‑149 CACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAACGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCCCAAACCAGAACTTTTTAACGTTTTGT > 1:1015899/1‑149 ACAGGTATTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGCCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTA < 1:517742/149‑1 cGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAAT < 1:1211020/148‑1 GTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAGGATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTGAAGGTTTTTAATat > 2:416676/1‑147 GTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCCCGCACAAACCAGCACTTTTTAACGATTTGTAAcga > 2:33804/1‑146 CTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACTAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAACTCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGT < 1:864817/149‑1 TTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTT > 2:519952/1‑149 TGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTT > 1:771186/1‑149 GTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTAGCTGGAACATAATTGAAAAAAAAAGGATAAAAAGTTTGAGATGGCTCGCACAAAACAGCACTTTTTAAAGTTTTCTCGTCAGTTTG > 2:699426/1‑149 GTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTACTCAGTTag > 1:556167/1‑147 GTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTG > 2:162963/1‑149 TAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGG > 1:942579/1‑149 AAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGG < 2:149683/149‑1 AGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACCGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGG < 2:1133208/149‑1 GTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTA < 1:1093898/149‑1 TTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAG > 2:148374/1‑149 TTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACACAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAG < 2:871401/149‑1 GGTACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTT > 2:165262/1‑149 TACCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTT < 1:1174360/149‑1 CCTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGACACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCg < 2:560380/149‑2 CTGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTT < 2:1018009/149‑1 TGCGGCCTTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGACCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTACTCAGTTTGGGGTGGCTACTTTTCGTC > 1:630997/1‑149 GGCCTTAAAATAATAACACCCAGACCACATCACACACATCTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAG < 1:578698/149‑1 cTAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAACCTTGTTTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAA < 1:319871/148‑1 TTAAAATAATAACACCCAGACAACACCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAA < 1:314439/149‑1 TAAAATAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAC > 2:1078205/1‑149 ||| TTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676720‑3676866‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAC > CP009273/3676867‑3677009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |