| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,871 | +TAA | intergenic (‑64/+119) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676866 | 1 (0.010) | 64 (0.800) +AAT |
52/280 | 0.5 | 98.5% | intergenic (‑59/+124) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676867 = | 1 (0.010) | intergenic (‑60/+123) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
TATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA‑‑‑AATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAC > CP009273/3676718‑3677009 | tATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAGAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTaa < 2:212093/149‑1 (MQ=255) tttCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaa < 2:69343‑M1/149‑3 (MQ=255) tttCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCCGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGTGGTACCTGCGGCCTTAAaa > 2:156833‑M1/1‑147 (MQ=255) tttCAGGATAGAAAGGGCCAAGGAGAATACCAATGGCCATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaa < 2:730730‑M1/149‑3 (MQ=255) gATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAGaataataa > 1:775494‑M1/1‑141 (MQ=255) gATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataa < 1:845438‑M1/149‑9 (MQ=255) gATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGGACCTGCGGCCTTAAaataataa < 2:1282161‑M1/149‑9 (MQ=255) gATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGCTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataa < 1:863129‑M1/149‑9 (MQ=255) aaTGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGATTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacaccca > 2:1250023‑M1/1‑135 (MQ=255) aaGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaaca > 1:45097‑M1/1‑128 (MQ=255) aaGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataaaacccagacacca > 2:1272816‑M1/1‑128 (MQ=255) aaGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCAGAGGGTATCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTGGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaatgataacacccggacagca > 1:1281854‑M1/1‑128 (MQ=255) aGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAagtaataacacccagacaacat > 2:1021581‑M1/1‑127 (MQ=255) gagaATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTACaataataacacccagacaacatca > 1:78474‑M1/1‑125 (MQ=255) aaTACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCGGAAAGTAAAGGCTTGTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAATACACAGGTCGTGTAAGGTTATCGGGTACGTGCGGCCTTAAaataatcgcacctagacaacatcacag < 2:657311‑M1/149‑28 (MQ=255) tACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaa > 1:156604‑M1/1‑120 (MQ=255) aCCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaa < 1:477731‑M1/149‑31 (MQ=255) cAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatg > 1:845146‑M1/1‑117 (MQ=255) cAATGACTATCGCCGTCACGACCTGAAAGAAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTACAGCATTATaagaataacacccagacaacatcacagaaatg > 2:277812‑M1/1‑117 (MQ=255) aaTGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGTTTTTCATAGGGTATCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataactcccagacaacatcacagaaatgt < 2:912550‑M1/149‑34 (MQ=255) aaTGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTACGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcctagaaatgt > 2:578698‑M1/1‑116 (MQ=255) tGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAGCAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtac > 2:549767‑M1/1‑114 (MQ=255) tCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggat < 2:41004‑M1/149‑42 (MQ=255) tCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTACTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacaccccgacaacatcccagaaatgtacctggat > 2:862027‑M1/1‑108 (MQ=255) tCGCCGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaaggaaccaggat > 2:420506‑M1/1‑108 (MQ=255) aCCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaa > 1:149683‑M1/1‑97 (MQ=255) aGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGGCTAGTAAGGTTATGGGGTACCTGCTGCCTTAGaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattaagacaaaaaagttaa > 1:416496‑M1/1‑85 (MQ=255) gCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaa > 2:1063161‑M1/1‑83 (MQ=255) tAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGCCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagttt < 1:465423‑M1/149‑72 (MQ=255) aaCAGGGAGGTTTTCAGAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataagaacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttga < 1:642811‑M1/149‑74 (MQ=255) agagagGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagct > 1:133189‑M1/1‑73 (MQ=255) ggTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACATGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctc < 2:411927‑M1/149‑82 (MQ=255) gTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaataggttaaaaagtttgagctggctcg < 1:686009‑M1/149‑83 (MQ=255) ttttCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgc > 1:949744‑M1/1‑66 (MQ=255) tttCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGGCTTGTAAGTTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacaccaagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgca < 2:217034‑M1/149‑85 (MQ=255) aTAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataaatgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaa < 2:156604‑M1/149‑89 (MQ=255) aTAGGGTGTCATTTAGTCAATCCACAGGCCTTGTACGGTTCTGGGGTGCCTGCAGACTGAAACTAATGACACCCAAACAACAGCACAGAAATGGACCTGTGTCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACaaa < 2:775494/149‑1 (MQ=255) aGTAAATCCACAGGTCTTGTAAGGGTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaa < 2:706047‑M1/149‑103 (MQ=255) aGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaa > 2:551491‑M1/1‑47 (MQ=255) tAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcctaattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcaccaaacagcactttgtaaag > 2:782129‑M1/1‑45 (MQ=255) aaaaCCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagt < 1:289619‑M1/149‑106 (MQ=255) aaaCCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcccaaaccagcactttttaaagtt > 1:345942‑M1/1‑43 (MQ=255) aaaCCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagtt > 1:1019269‑M1/1‑43 (MQ=255) cacaGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaacggttaaaaagtttgagctggctcgcccaaaccagaactttttaacgttttgt > 1:1015899‑M1/1‑39 (MQ=255) acaGGTATTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctgcctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgta < 1:517742‑M1/149‑112 (MQ=255) cggtCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaat < 1:1211020‑M1/148‑114 (MQ=255) gTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAGgataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttgaaggtttttaatat > 2:416676‑M1/1‑34 (MQ=255) gTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggcccgcacaaaccagcactttttaacgatttgtaacga > 2:33804‑M1/1‑34 (MQ=255) cTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataacaacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaactaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaactcagcactttttaaagttttgtaatcagt < 1:864817‑M1/149‑118 (MQ=255) ttGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtt > 2:519952‑M1/1‑31 (MQ=255) tGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagttt > 1:771186‑M1/1‑30 (MQ=255) gTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtagctggaacataattgaaaaaaaaaggataaaaagtttgagatggctcgcacaaaacagcactttttaaagttttctcgtcagtttg > 2:699426‑M1/1‑29 (MQ=255) gTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtactcagttag > 1:556167‑M1/1‑29 (MQ=255) gTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttg > 2:162963‑M1/1‑29 (MQ=255) tAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttgg > 1:942579‑M1/1‑28 (MQ=255) aaGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggg < 2:149683‑M1/149‑123 (MQ=255) aGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcaccgaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttgggg < 2:1133208‑M1/149‑124 (MQ=255) gTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggta < 1:1093898‑M1/149‑126 (MQ=255) ttATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtag > 2:148374‑M1/1‑23 (MQ=255) ttATGGGGTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacacaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtag < 2:871401‑M1/149‑127 (MQ=255) ggTACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtagctactt > 2:165262‑M1/1‑17 (MQ=255) tACCTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtagctactttt < 1:1174360‑M1/149‑135 (MQ=255) ccTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgacacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtagctacttttcg < 2:560380‑M1/149‑137 (MQ=255) cTGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtagctacttttctt < 2:1018009‑M1/149‑138 (MQ=255) tGCGGCCTTAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggaccataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtactcagtttggggtggctacttttcgtc > 1:630997‑M1/1‑11 (MQ=255) ggCCTTAAaataataacacccagaccacatcacacacatctacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtagctacttttcttccag < 1:578698‑M1/149‑142 (MQ=255) ttAAaataataacacccagacaacaccacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtagctacttttcttccaggtaa < 1:314439‑M1/149‑146 (MQ=255) ctaAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaccttgtttaatcagtttggggtagctacttttcttccaggtaa < 1:319871‑M1/148‑146 (MQ=255) tAAaataataacacccagacaacatcacagaaatgtacctggatcataattgaaacaaaaaggttaaaaagtttgagctggctcgcacaaaccagcactttttaaagttttgtaatcagtttggggtagctacttttcttccaggtaac > 2:1078205‑M1/1‑3 (MQ=255) | TATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA‑‑‑AATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAC > CP009273/3676718‑3677009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |