| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,871 | +TAA | intergenic (‑64/+119) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676866 | 1 (0.010) | 64 (0.800) +AAT |
52/280 | 0.5 | 98.5% | intergenic (‑59/+124) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676867 = | 1 (0.010) | intergenic (‑60/+123) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
GATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA‑‑‑AATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAC > CP009273/3676726‑3677009 | gatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacaggtcttgtaaggttatggggtacctgcggccttagaataataa > 1:775494‑M2/145‑149 (MQ=255)gatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacaggtcttgtaaggttatggggtacctgcggccttaaaataataa < 1:845438‑M2/5‑1 (MQ=255)gatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacaggtcttgtaaggttatgggggacctgcggccttaaaataataa < 2:1282161‑M2/5‑1 (MQ=255)gatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcataggctgtcctttagtaaaaccacaggtcttgtaaggttatggggtacctgcggccttaaaataataa 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taaaatAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAc > 2:1078205‑M2/7‑149 (MQ=255) | GATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA‑‑‑AATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGTTTGGGGTAGCTACTTTTCTTCCAGGTAAC > CP009273/3676726‑3677009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |