| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,536,312 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (479‑484/510 nt) | crr → | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 130 (1.080) | 83/494 | 0.1 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2536317 | 0 (0.000) | coding (484/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 104 (0.860) | 67/496 | 0.4 | 99.0% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2536312 = | 1 (0.010) | coding (479/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CGACCAAACTGGTTTCCAACGAGTTCGTTGCGATGATGGATCTGCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGTCACTGCATGGGCTCAGCTCCATGACGTTGCAACATTATCTGACGTGGCTCTCCTGAAG > NC_000913/2513982‑2514567 | cGACCAAACTGGTTTCCAACGAGTTCGTTGCGATGATGGATCTGCAGAAAATTGCTTCCACGCTCTCTCCGCGTGCTGAAGGCATCATCTCTGTGTTCCTGGTTTCCTTCGCTAACTTCTCTTCAATCGGGATTATCGCAGGTGCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAg < 2:512827/300‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |