Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2785894 | 2786805 | 912 | 35 [33] | [32] 34 | [ygaQ] | [ygaQ] |
TACTGATGGATAAATACATTGCAGTGGCGTGCCACGTACCAAAACACCAGCCCTCATTCGAAACCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCTAATAATATAACTTTATTACATTAGCTGAAGAGTTTTCGCATCATTATGATATCTGTTACTTTTCACTCCATAAAAATAAAC > NC_000913/2785595‑2786153 | tACTGATGGATAAACACATTGCAGTGGCGTGCCACCTACCAAAACACCAGCCCTCATTCGAAACCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTCGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATatga < 1:240709/299‑1 (MQ=255) aTACATTGCAGTGGCGTGCCACGTACCAAAACACCAGCCCTCATTCGAAACCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTAGCCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCCGCTCTCACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATCACAGAtt > 1:77611/1‑301 (MQ=255) aCATTGCAGTGGCGTGCCACGTACCAAAACACCAGCCCTCATTCGAAACCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTGAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCTTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATTATGTAAATAACAGTtttt > 1:595820/1‑301 (MQ=255) ttGCAGTGGCGTGCCACGTACCAAAACACCAGCCCTCATTCGAAACCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTAGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATTTAAATAACAGATTTTTAt > 1:303745/1‑301 (MQ=255) cAAAACACCAGCCCTCATTCGAAACCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAAGAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGt < 1:636775/301‑1 (MQ=255) aaaCCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATaaa > 1:443578/1‑301 (MQ=255) tcCTTGAAATGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTCACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCAtt > 1:215747/1‑300 (MQ=255) ccgtgcaaTGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATatga < 2:468822/212‑1 (MQ=255) gCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATCTGATGTAAATaaa > 2:424468/1‑217 (MQ=255) ttAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATAc < 1:437847/300‑1 (MQ=255) ttAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGTTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGt < 1:144470/301‑1 (MQ=255) ctatctctTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTCGCCCTTGCTGGACTTGACCCAGCGACCAAGCGAGTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACTCGACATAAAACCCGACACCTCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGt < 1:272431/297‑1 (MQ=255) aTACGTAAATAATGGTTTGGTGGCCCTTGCTGGACCTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGac < 2:60936/218‑1 (MQ=255) aTACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGac < 2:269368/218‑1 (MQ=255) ttAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGa < 1:424477/300‑1 (MQ=255) tgttGGTGGCCCTTGCTTGACTTGAACCCGCGACCAAGCGATTATGAGTAGCATGCTCTATCCACTGATCTAAAGTGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGAAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAACCCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATGAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTaa < 1:572096/299‑1 (MQ=255) tGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCtaat < 1:327978/301‑1 (MQ=255) ttGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCTAATAatat < 1:583646/301‑1 (MQ=255) aaCCTGCGACCAATCGATTATGAGTCGCCAGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTcaaca < 2:215740/218‑1 (MQ=255) nctaTTATGAGTCGCTTGATCTAGCCACTGAGCTAAAGCGCCTGTAGTGTGGAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGAGGATATGATGTAAATAACAGATTGTTATGCGTTCCCATTCACCATGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCACCATGCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTtaat < 2:595802/215‑1 (MQ=255) ccTGCTCTAACCAATTAGCTAAAGGGACTAGAATGTACAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATAATGATCATATGATGTAAAAAGCAGATCTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCActatct < 2:154863/218‑1 (MQ=255) tcaaaCCACTGAGCTAAAGGGCATGGAGTAGGAAATAAAAATGAATATAATACACGCAATAAACATAATAATCTTATGATGTAAGAAAGAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTAAACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGt < 2:77610/215‑1 (MQ=255) tccTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTAACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATAc < 2:303737/217‑1 (MQ=255) gtgCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCa < 2:71575/161‑1 (MQ=255) gtgCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCa > 1:71576/1‑161 (MQ=255) gCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAACACACGACACCGCCCCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAAAAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGAt > 2:375822/1‑218 (MQ=255) gCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCTAATAATATAACTTTATTACATTAGc < 1:375829/252‑1 (MQ=255) cTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTtaataa > 2:458350/1‑158 (MQ=255) cTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTtaataa < 1:458359/158‑1 (MQ=255) cAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCTAATAATATAACTttat > 2:79899/1‑218 (MQ=255) cAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCTAATAATATAACTTTATTACATTAGCTGAAGAGTTTTCGCATCATTATGATATCTGTTACTTTTCACTCCATAAAAATAAAc < 1:79900/283‑1 (MQ=255) aCATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATAc < 1:147777/176‑1 (MQ=255) gatCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCAc < 2:221336/139‑1 (MQ=255) gatCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCAc > 1:221343/1‑139 (MQ=255) aatatGATGTAAATAACAGATTTTTAGGCGTTCCCATGCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCTAATAATATAACTTTATTACATTAGCTGAagag < 2:443569/217‑1 (MQ=255) | TACTGATGGATAAATACATTGCAGTGGCGTGCCACGTACCAAAACACCAGCCCTCATTCGAAACCACCCACCGCACTTCTTCCTTGAAATGGCGTTAGTCATGAAATATAGACCGCCATCGAGTACCCCTTGTACCCTTAACTCTTCCTGATACGTAAATAATGATTTGGTGGCCCTTGCTGGACTTGAACCAGCGACCAAGCGATTATGAGTCGCCTGCTCTAACCACTGAGCTAAAGGGCCTTGAGTGTGCAATAACAATACTTATAAACCACGCAATAAACATGATGATCATATGATGTAAATAACAGATTTTTATGCGTTCCCATTCACCTTGGGTCGTGATTACACGCGACATAAAACCCGACACCGCCTCCATTCGCAAAGTCGATACTCGCAGTCAACAAGCAAATGTTAATAATTAGCACTATCTATAGTTATCATCGATTCAATGATACTTTGTAATGATTTTGTATCTAATAATATAACTTTATTACATTAGCTGAAGAGTTTTCGCATCATTATGATATCTGTTACTTTTCACTCCATAAAAATAAAC > NC_000913/2785595‑2786153 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |