Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 4476480 | 4477229 | 750 | 49 [47] | [44] 48 | yjgL | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
AAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGA > NC_000913/4476192‑4476620 | aaaTAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATCATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCatat < 2:342160/288‑1 (MQ=255) aaaTAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTg > 2:218066/1‑296 (MQ=255) aCTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAAc > 2:198349/1‑299 (MQ=255) ctctAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAAACtt > 2:553264/1‑301 (MQ=255) aaGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACTGGTTTATTAAAAGAAACATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTacac < 2:731940/301‑1 (MQ=255) gTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAAcc < 2:408675/288‑1 (MQ=255) cAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTc < 2:375673/249‑1 (MQ=255) aTTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTc < 2:473067/247‑1 (MQ=255) aTTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGAc < 2:429776/301‑1 (MQ=255) ttattaAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCatat < 1:487544/218‑1 (MQ=255) attaAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATAtt > 1:171179/1‑217 (MQ=255) attaAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGgag < 2:171180/280‑1 (MQ=255) aaGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCG‑AAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTg < 1:354167/218‑1 (MQ=255) aaCCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTg < 1:218062/216‑1 (MQ=255) ccATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGAtt > 1:154612/1‑217 (MQ=255) gAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTc > 2:598898/1‑203 (MQ=255) gAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTc < 1:598887/203‑1 (MQ=255) aatGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATAc < 2:154613/301‑1 (MQ=255) tattaGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTc < 2:181115/192‑1 (MQ=255) tattaGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTc > 1:181113/1‑192 (MQ=255) cAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTg < 1:661002/192‑1 (MQ=255) cAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTg > 2:661013/1‑192 (MQ=255) aacgaacATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTacac < 1:387346/217‑1 (MQ=255) gaacATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCa > 2:339612/1‑301 (MQ=255) gCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAgg > 1:589302/1‑194 (MQ=255) gCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAgg < 2:589313/194‑1 (MQ=255) ttAATGACTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtg < 2:600853/301‑1 (MQ=255) aTTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGAGAATGACAAAGTAGGTAACTATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTacac < 2:539962/175‑1 (MQ=255) tttCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCatat < 1:198346/218‑1 (MQ=255) cATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAgatg < 2:30421/150‑1 (MQ=255) cATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAgatg > 1:30421/1‑150 (MQ=255) aaGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAgatg < 2:306350/132‑1 (MQ=255) aaGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAgatg > 1:306348/1‑132 (MQ=255) gTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTg > 2:329786/1‑117 (MQ=255) gTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTg < 1:329784/117‑1 (MQ=255) gaaATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTacac < 2:350616/139‑1 (MQ=255) gaaATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTacac > 1:350613/1‑139 (MQ=255) aaaTAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTtaat < 1:553256/218‑1 (MQ=255) tAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGAt < 1:479230/104‑1 (MQ=255) tAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGAt > 2:479233/1‑104 (MQ=255) ttAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTtga < 1:339610/218‑1 (MQ=255) gATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAAt < 2:472296/161‑1 (MQ=255) gATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAAt > 1:472293/1‑161 (MQ=255) aaGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatga > 1:910763/1‑142 (MQ=255) aaGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatga < 2:910793/142‑1 (MQ=255) aGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatg > 1:861959/1‑137 (MQ=255) aGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAatg < 2:861987/137‑1 (MQ=255) ctcATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTacac < 2:597938/48‑1 (MQ=255) ctcATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTacac > 1:597927/1‑48 (MQ=255) | AAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGTTGTACAGTTTCAGTTGATTCTACGATTACGGGTTTATTAAAAGAACCATTGAATAATGCATTATTAGCAATAAGGAACGAACATCTGCTATTAATGCCTCATGTATGTGATGAATCGATTTCATACTTACTGGGCGAAAAAGGTATACTTGAAGAAATAGATAAGCTCTACGCATTAAATGATCACGGAATTGATAATGACAAAGTAGGTAACAATGAAATTAATGACATCAAAGTTAACCTGTCTCATATTCTTATTGATTCCTTAGATGATGCAAAGGTTAACCTTACACCGGTCATCGATTCGATTCTGGAGACTTTTTCAAAATCCCCATATATTAATGATGTAAGAATACTGGATTGGTGTTTTAATAAAAGCATGCAATATTTTGA > NC_000913/4476192‑4476620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |