Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | CP009974 | 3,961,904 | C→T | T416T (ACC→ACT) | RPPX_17635 → | damage‑inducible protein CinA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP009974 | 3,961,904 | 0 | C | T | 99.6% | 977.5 / NA | 265 | T416T (ACC→ACT) | RPPX_17635 | damage‑inducible protein CinA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (113/151); total (113/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
CCCGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGC > CP009974/3961757‑3962050 | cccGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACttct < 2:4184965/151‑1 (MQ=255) cGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACttctct > 1:2306924/1‑151 (MQ=255) gTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTgg < 2:3559145/151‑1 (MQ=255) gTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTgg < 1:766797/151‑1 (MQ=255) aaTCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATc < 1:247634/151‑1 (MQ=255) aTCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCa < 1:4427702/151‑1 (MQ=255) cGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCAcg > 1:3030158/1‑150 (MQ=255) cGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACt < 1:2750015/151‑1 (MQ=255) cGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACt < 1:1387319/151‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTTTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTg > 1:285937/1‑151 (MQ=255) gCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTg < 1:4025854/151‑1 (MQ=255) cccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgc < 2:4301256/151‑1 (MQ=255) cccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgc < 2:4550408/151‑1 (MQ=255) cccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgc > 1:2584488/1‑151 (MQ=255) ccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgcg > 1:1071168/1‑151 (MQ=255) ccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgcg < 1:842771/151‑1 (MQ=255) ccGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgcg < 1:5140147/151‑1 (MQ=255) cgcgCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgcgc > 1:5181701/1‑151 (MQ=255) cgcgCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTgcgc > 1:4507806/1‑151 (MQ=255) gcCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTgg > 1:1111342/1‑151 (MQ=255) gcCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTgg > 2:5002506/1‑151 (MQ=255) tCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCAc > 1:2658077/1‑151 (MQ=255) tCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCAc < 2:3734285/151‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCActg < 2:607272/151‑1 (MQ=255) ggTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCActg > 2:4083381/1‑151 (MQ=255) tGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCActgct < 1:4736091/151‑1 (MQ=255) tGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGAc < 1:269535/151‑1 (MQ=255) tGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGAc < 1:2825966/151‑1 (MQ=255) tGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGAc < 1:269612/151‑1 (MQ=255) ggggCAGCCTGGGCCCCGGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACg < 2:4682074/151‑1 (MQ=255) gCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGCCGGgc > 2:2864367/1‑151 (MQ=255) gCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGgc > 1:874600/1‑151 (MQ=255) cAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTGCACTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGgcg > 2:3022474/1‑151 (MQ=255) ccTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCt > 2:2702317/1‑151 (MQ=255) ccTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCt < 2:1299479/151‑1 (MQ=255) cTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCTCCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCtt < 1:524487/151‑1 (MQ=255) cACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCt < 1:1636118/151‑1 (MQ=255) gatgaGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATg < 2:3333483/151‑1 (MQ=255) gatgaGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATg < 2:4172227/151‑1 (MQ=255) gatgaGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATg > 1:6902/1‑151 (MQ=255) atgaGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATgg < 1:1670180/151‑1 (MQ=255) gCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTATGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTg > 2:4615779/1‑151 (MQ=255) ccGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGaa > 2:816830/1‑151 (MQ=255) ccGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGaa > 1:58249/1‑151 (MQ=255) ggCTGGTGGGTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAg < 2:4499965/150‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGCTTCCGCCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAg < 1:3283165/151‑1 (MQ=255) cGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAg > 2:5233563/1‑151 (MQ=255) tggtggCTTCCGCCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCAc < 1:3845298/151‑1 (MQ=255) tggtggCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCAc > 2:3921556/1‑151 (MQ=255) gtggCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTc > 1:1430388/1‑151 (MQ=255) gtggCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTc < 1:3748468/151‑1 (MQ=255) ggCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAg > 1:1550089/1‑151 (MQ=255) cTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGGTCACTGCGCTGGCACTGGTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAggg < 2:3614809/151‑1 (MQ=255) tCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGgcg < 2:3494363/151‑1 (MQ=25) aCCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGcgccg < 1:3495176/151‑1 (MQ=21) ttgttgCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTc < 1:4838530/151‑1 (MQ=18) gCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGgcgc > 1:3179139/1‑151 (MQ=18) gCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGgcgc < 1:181431/151‑1 (MQ=18) cTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCCCGGCGCCGCTCGGCGcc > 2:5145490/1‑151 (MQ=255) ggtggGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGcccc < 1:19308/151‑1 (MQ=25) gtggGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCg < 1:2328215/143‑1 (MQ=14) gCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGACCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCACCTCTGa < 2:2332345/151‑1 (MQ=255) aTGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACt > 1:2147725/1‑151 (MQ=255) tGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCCTGGTTTGTAGCACTCAGGGCGCCCCTCGGCGCCCCTCTGACTc > 2:4431536/1‑151 (MQ=255) ggTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCa > 1:4074886/1‑151 (MQ=255) gTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAGGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCAc < 2:4005111/151‑1 (MQ=255) gTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCAc > 1:4262260/1‑151 (MQ=255) cGACAGGGATAGCGGTGAGTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCAccc < 2:1516363/151‑1 (MQ=255) gACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCa > 2:1080149/1‑151 (MQ=255) gACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCa > 2:1085239/1‑151 (MQ=255) aCAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCaa > 1:1279939/1‑151 (MQ=255) cAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAg < 1:5002506/151‑1 (MQ=255) cAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAg > 2:2083140/1‑151 (MQ=255) aGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCGCCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGa < 2:4820647/151‑1 (MQ=255) aGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGa > 2:3031502/1‑151 (MQ=255) aGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGa > 2:2403102/1‑151 (MQ=255) aGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGa < 1:2080243/151‑1 (MQ=255) gggATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaa < 1:2978110/151‑1 (MQ=255) tatCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaacaac < 2:3139721/151‑1 (MQ=255) tCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaacaacaa < 1:2794671/151‑1 (MQ=255) cGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGaaaaacaac > 2:2112182/1‑151 (MQ=255) ttCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTaa > 1:5109088/1‑151 (MQ=255) tCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAAc > 1:3405695/1‑151 (MQ=255) gAAAGCCACGTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcatc < 2:4932374/151‑1 (MQ=255) gAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcatc < 2:169463/151‑1 (MQ=255) aaGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACcatcat < 1:3535000/151‑1 (MQ=255) aGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGCGCAACCATCATg > 2:1737603/1‑151 (MQ=255) ccACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTc > 1:4779546/1‑151 (MQ=255) cccTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTccc < 2:2607292/150‑1 (MQ=255) aCCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTccc < 2:3858683/151‑1 (MQ=255) ccgtCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCg < 1:3954792/148‑1 (MQ=255) ccTTCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCg < 2:2275602/151‑1 (MQ=255) ttCAAGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGAt < 2:477455/151‑1 (MQ=255) aGTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCACCATGTCCGGATTTCt > 2:3204385/1‑151 (MQ=255) gTGGGCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCtt < 2:1653234/151‑1 (MQ=255) ggCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTc < 1:2032104/151‑1 (MQ=255) gCCGTGCTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTcc > 2:656053/1‑151 (MQ=255) cTCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGTGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCTGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAAAAACAGGGTAAGCATCATGTACCGGTCTCTTCTCCGTgggg > 1:1952617/1‑151 (MQ=21) tCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGc > 1:4294881/1‑151 (MQ=255) tCACTTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGc < 2:2497116/151‑1 (MQ=255) | CCCGGTGGAAATCGCCCGCGCCTCGGTGCTGGGGCAGCCTGTGCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCTTCCACCTTGTTGCTGGTGGGCATGGTCGACAGGGATATCGGTGATTTCCAGAAAGCCACCTTCAAGTGGGCCGTGCTCACCTCTCTGGTGATCACTGCGCTGGCACTGCTGACGGGCGCCTTGTCCTTCATGGTTTGAAGCACTCAGGGCGCCGCTCGGCGCCCCTCTGACTCACCCAAGAACAACAACAGAGTAACCATCATGTCCCGATTTCTTTTCCGTGGGGC > CP009974/3961757‑3962050 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |