Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 1,010,006 | G→A | 5.9% | Y45Y (TAC→TAT) | CJ019_00951 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 1,010,006 | 0 | G | A | 5.9% | 230.4 / 2.5 | 72 | Y45Y (TAC→TAT) | CJ019_00951 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (26/39); new base A (2/2); total (30/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.14e-01 |
TGAATGCGGTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGCGATCA > ACB122/1009873‑1010139 | tGAATGCGGTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATTGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGt < 8:99190/135‑1 (MQ=255) gAATGCGGTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTAGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTa > 2:45174/1‑135 (MQ=255) gCGGTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCCGGCGCGTACGTACTGGCGGCGTTACTGATGGCCGCGCCCGCGGTTGTGAAAGAAGTCGTGGTACAgg > 2:354799/1‑135 (MQ=255) gCGGTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTGGATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTgg > 2:87910/1‑135 (MQ=255) cGGTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGa > 3:278769/1‑135 (MQ=255) gTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGata < 8:365096/135‑1 (MQ=255) gTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGATGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTGGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGata < 5:327360/135‑1 (MQ=255) ctgcCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCg < 3:300507/135‑1 (MQ=255) ctgcCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGAGGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCg < 3:209952/135‑1 (MQ=255) tCGACGCTGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGggtgg < 6:84271/135‑1 (MQ=255) tCGACGCGGATGGGGGCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTGCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGggtgg < 6:89694/135‑1 (MQ=255) tCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGCGCACGCGGGTCTGAAAGCAGTCGGGGTACTGGATATCGGggtgg > 6:260925/1‑135 (MQ=255) aCGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTa < 3:345261/134‑1 (MQ=255) gcgGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGGAGTTCCTGATGGCCGAGCCCGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTagag > 7:6026/1‑135 (MQ=255) gcgGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGCGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTagag > 4:190651/1‑135 (MQ=255) gATGTCCTCGCGGGCCTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGGAGGCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCCCGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGGGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTc < 2:256358/135‑1 (MQ=255) gATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTc < 3:170677/135‑1 (MQ=255) gATGTCCGCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTc < 6:237441/135‑1 (MQ=255) tGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTcgc < 2:65490/135‑1 (MQ=255) tGTCCTCGCCGGCTGCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTcgc < 6:329912/135‑1 (MQ=255) ggTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTcgc < 5:316310/134‑1 (MQ=255) ccTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGAt > 2:318683/1‑135 (MQ=255) ccTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGAGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGAt > 1:270640/1‑135 (MQ=255) cTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTGCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGGACTGGATATCGGGGTGGTTGCGCGCCATGACACCGGCGAGGTCGCGATg > 5:223122/1‑135 (MQ=255) cGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCt > 2:68739/1‑135 (MQ=255) cTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCcagc < 4:32162/135‑1 (MQ=255) cTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCcagc < 4:278769/135‑1 (MQ=255) ggcaggcaGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAggtgg < 8:44093/135‑1 (MQ=255) gcaggcGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAgc > 4:133474/1‑134 (MQ=255) gtacgtaGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTcgc > 8:187794/1‑102 (MQ=255) gtacgtaGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTcgc < 7:187794/102‑1 (MQ=255) acgtaGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGAtt < 4:163273/135‑1 (MQ=255) acgtaGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGAtt < 3:133474/135‑1 (MQ=255) acgtaGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAACTCGTGCTACTGGATATCCGGGTGGTACAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGCTGGTAGCGCAGCACCAtt > 5:123683/1‑135 (MQ=255) taGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATTCTTCCAGCAGCGGTGGTAGCGCAGCACGATTTcg > 3:214042/1‑135 (MQ=255) taGTCGCGCAGTTCCTCATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGCCACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTcg > 7:275263/1‑135 (MQ=255) gcgcAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGt < 4:251059/135‑1 (MQ=255) cgcAGTTCCTGATGGCCGATCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGTGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGt < 4:151341/134‑1 (MQ=255) aGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGCTACTGGATATCGGGGTGGTAGCGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGc > 4:345090/1‑135 (MQ=255) ttCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCgg < 7:78170/135‑1 (MQ=255) tCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTTGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCgg < 1:354799/134‑1 (MQ=255) tGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGttt < 3:52917/133‑1 (MQ=255) ggCCGAGCACGCGGGTCTGAATGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGGGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTACAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCt < 6:342187/135‑1 (MQ=255) ccGAGCCCGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCg < 5:113336/135‑1 (MQ=255) ccGAGCACGCGGTTCTGAAAGACGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCg < 5:289449/135‑1 (MQ=255) aGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTcgc < 4:15943/73‑1 (MQ=255) aGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTcgc > 3:15943/1‑73 (MQ=255) aGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCgggg > 4:351530/1‑135 (MQ=255) aGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCgggg > 5:106790/1‑135 (MQ=255) aCGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCg > 3:330064/1‑135 (MQ=255) aCGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCg > 2:25166/1‑135 (MQ=255) gcgGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTc < 4:330064/135‑1 (MQ=255) gcgGTTCTGAAAGAAGGCGTGTTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCggc < 2:190369/135‑3 (MQ=255) tCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGa > 4:355333/1‑57 (MQ=255) tCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGa < 3:355333/57‑1 (MQ=255) aaaGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTcc < 2:358451/68‑1 (MQ=255) aaaGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTcc < 8:336604/68‑1 (MQ=255) aaaGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTcc > 7:336604/1‑68 (MQ=255) aaaGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTcc > 1:358451/1‑68 (MQ=255) aaaGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGggt > 1:126151/1‑135 (MQ=255) aagaagTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTATGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAggggg < 2:321347/135‑3 (MQ=255) agaagTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGggtgg < 5:128544/135‑1 (MQ=255) gTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGc < 3:190651/135‑1 (MQ=255) cGTTGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACCCCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGCGa < 1:71450/135‑1 (MQ=255) cGTGGTACTGGATCTATGTGTGTTAGAGCGCCATGACACCTTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTTGTAGCTCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTTGCGa < 4:119662/135‑1 (MQ=255) cGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCgg < 1:357015/100‑1 (MQ=255) cGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCgg > 2:357015/1‑100 (MQ=255) cGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGCGa > 4:23830/1‑135 (MQ=255) cGTGATACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGc > 7:269596/1‑133 (MQ=255) cGTGATACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGc < 6:381099/133‑1 (MQ=255) cGTGATACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGc < 8:269596/133‑1 (MQ=255) cGTGATACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGc > 5:381099/1‑133 (MQ=255) ggTAGTGGATTTCGGGGTGGTAGAGCTCCATGACACAGTCGATGTCGCGATGCTTCCAGCAGTGGTGGTAGCGCAGCACGTTTTCGGCGGTAAGGGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGCGATCa < 1:68739/135‑1 (MQ=255) ggTACTGGATAGCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGCGATCa < 2:283755/135‑1 (MQ=255) | TGAATGCGGTGCTGCCATCGACGCGGATGCGGTCGCTGTGGACGATGTCCTCGCCGGCTTCATGGGGCAGGCAGGCGCGTACGTAGTCGCGCAGTTCCTGATGGCCGAGCACGCGGTTCTGAAAGAAGTCGTGGTACTGGATATCGGGGTGGTAGAGCGCCATGACACCGTCGAGGTCGCGATGCTTCCAGCAGAGGTGGTAGCGCAGCACGATTTCGGCGGTAAGCGGGGTTTGCTCGGGGCCGTCGGGGAGGGTGGTGGCGATCA > ACB122/1009873‑1010139 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |