Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 1,310,781 | C→T | 5.9% | T382T (ACC→ACT) | aaeB_2 → | p‑hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 1,310,781 | 0 | C | T | 5.9% | 226.3 / 2.7 | 68 | T382T (ACC→ACT) | aaeB_2 | p‑hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (22/42); new base T (2/2); total (24/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.10e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AGGGGCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGAGCAGCTT > ACB122/1310648‑1310915 | aGGGGCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCt < 3:40792/135‑1 (MQ=255) ggggCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTg < 4:109264/135‑1 (MQ=255) ggggCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTg < 4:285447/135‑1 (MQ=255) ggggCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTg < 7:37934/135‑1 (MQ=255) ggggCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTg < 5:342338/135‑1 (MQ=255) ggggCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCGGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTg < 4:57540/135‑1 (MQ=255) gCCGCGCCCCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTTGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCGGCGTGGTc > 8:23162/1‑135 (MQ=255) ccGCGCTCCGAGAGTGGTCGCTGGCCGGGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGGTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCt < 7:361474/135‑1 (MQ=255) ccGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCt < 7:361472/135‑1 (MQ=255) ccGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCGGTGCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGGGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCt < 3:88282/135‑1 (MQ=255) gcgcACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGGAATGAGTGGTTTGTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCGGGTGCTGCCCTGCGTGGGCt > 8:155872/1‑133 (MQ=255) cGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCGTCCGCCCCCGGTGGCCGGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGccgg > 4:13874/1‑133 (MQ=255) gagaCTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGACTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGt < 5:376605/135‑1 (MQ=255) aCTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCg < 5:146316/135‑1 (MQ=255) cGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCCGCCTGTTCGCCAGTc > 7:249836/1‑135 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGGCGTGCGCCCCCCGGGGCGGGGTGGTGAGCGGCGGGGGGGGCACCCCGTTGGCCACTcg > 5:37839/1‑135 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTg > 3:14986/1‑108 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTg < 4:14986/108‑1 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTcg > 2:198853/1‑135 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTcg > 2:204948/1‑135 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTcg > 5:256805/1‑135 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTcg > 3:104327/1‑135 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTcg > 1:251394/1‑135 (MQ=255) gCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCAGGTGCTTACCTGCGTGGTCTGCCGCCAGTTCGCCCGTcg > 6:40147/1‑135 (MQ=255) cTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGc > 8:364098/1‑117 (MQ=255) cTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGc < 7:364098/117‑1 (MQ=255) ccTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCga < 3:93762/133‑1 (MQ=255) ccTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCga < 7:375375/133‑1 (MQ=255) cTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACTTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGaa > 2:30643/1‑135 (MQ=255) cTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAAAGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCGGGTGCTGACTTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGaa > 2:30655/1‑135 (MQ=255) cTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACgg < 1:119540/134‑1 (MQ=255) cTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACg < 2:105799/133‑1 (MQ=255) tGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGgcg > 8:198813/1‑135 (MQ=255) cTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGGCGTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGATGCCCTACGTTGTATGCCGCCTGGTCGCCATTCGCGAGAACTGCGcacatcg > 6:29596/1‑132 (MQ=255) cTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGGCGTCGGCCCCCGGGGGGCGGGGGCTGACCTGGGTGGGGTGCAGCCCGTTGGCCCGTCGCGCGCACCGCGcccacct > 2:179518/1‑132 (MQ=255) cgcAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCg < 2:211026/133‑1 (MQ=255) cgcAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCg < 5:288104/133‑1 (MQ=255) cgcAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCg < 8:158015/133‑1 (MQ=255) gcAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGgc > 4:81846/1‑122 (MQ=255) gcAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGgc < 3:81846/122‑1 (MQ=255) ggCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCt < 7:198813/135‑1 (MQ=255) ccTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCt < 7:269829/133‑1 (MQ=255) cTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGTGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTgcg < 6:70145/135‑1 (MQ=255) cTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGcgcg < 5:225487/133‑1 (MQ=255) tGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTcc > 4:321519/1‑135 (MQ=255) gTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTgg < 4:105872/135‑1 (MQ=255) tCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGCTAc > 1:224037/1‑135 (MQ=255) ctggctggCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGGGGCCTGGTGCTGACCGGCGTGGTCTGCAGCCAGTTCGCCACTCGCGAGCACCGCGCCCAGATCGGCCTGAGTTTCCTTCGCCGGTTATTCCGGGCGGTAcc > 6:253217/1‑135 (MQ=255) tggctggcCACGGCCTGACCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACcg < 3:249213/135‑1 (MQ=255) ctggcCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACcggcg > 7:67326/1‑135 (MQ=255) ctggcCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACcg < 8:42403/132‑1 (MQ=255) ctggcCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACcg < 6:256805/132‑1 (MQ=255) ctggcCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACcg < 5:40147/132‑1 (MQ=255) ctggcCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGACTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGTCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACcg < 6:362513/132‑1 (MQ=255) ctggcctTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGt < 3:13874/135‑1 (MQ=255) tggcctTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTc < 7:114633/135‑1 (MQ=255) tggcctTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTc < 2:140399/135‑1 (MQ=255) ctTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGCCCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCgg > 8:105561/1‑133 (MQ=255) cccccGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCa < 6:348011/135‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACAGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCAtgc < 2:52686/135‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCg < 8:287/135‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGGTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCg < 4:104327/135‑1 (MQ=255) cTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCaa < 6:316091/135‑1 (MQ=255) tGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATg < 5:375754/133‑1 (MQ=255) tGACTTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGagca < 1:30655/135‑1 (MQ=255) tGACTTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGagca < 1:30643/135‑1 (MQ=255) tGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGagca < 5:61933/135‑1 (MQ=255) tGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGagca < 1:179518/135‑1 (MQ=255) cTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGAGCAGCtt > 8:10631/1‑135 (MQ=255) cTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGAGCAGCtt < 1:71475/135‑1 (MQ=255) cTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGAGCAGCtt < 1:204948/135‑1 (MQ=255) cTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGAGCAGCtt < 1:198853/135‑1 (MQ=255) cTGCGTGGGCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGAGCAGCtt < 6:116247/135‑1 (MQ=255) | AGGGGCTGGCCGCGCACCGAGACTGGTCGCTGGCCTTGCTGTTCGGCTCGCGCAGCGCGCTGGCCTTCCTGGTAATGAGTGGTTTCTGGCTGGCCACGGCCTGGCCTTCGGCCCCCGGTGGCCTGGTGCTGACCTGCGTGGTCTGCAGCCTGTTCGCCAGTCGCGAGAACGGCGCACAGATCGGCCTGAGTTTCCTGCGCGGGATATTCCTGGCGATACCGGCGGCGTTTGTGGTCGGGCAGATCATGCTGCCGCAATGGAGCAGCTT > ACB122/1310648‑1310915 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |