Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 1,522,272 | A→C | 22.4% | Q80P (CAG→CCG) | ftsZ → | Cell division protein FtsZ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 1,522,272 | 0 | A | C | 22.4% | 144.4 / 5.2 | 88 | Q80P (CAG→CCG) | ftsZ | Cell division protein FtsZ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/11); new base C (3/19); total (55/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.17e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTGGCCAAGGAA > ACB122/1522138‑1522402 | cGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCa > 3:178534/1‑135 (MQ=255) cGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCa > 1:264124/1‑135 (MQ=255) cGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCa > 6:124980/1‑135 (MQ=255) cGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCa > 2:89871/1‑135 (MQ=255) cGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCa > 6:326377/1‑135 (MQ=255) cGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGGCa > 5:127767/1‑135 (MQ=255) cGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCACCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCa > 5:137128/1‑135 (MQ=255) aaGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAgg > 8:193388/1‑135 (MQ=255) aaGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTCCAATT‑GGGCCC‑GGGTGTGACCATGGGCCTGGGGGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCa < 2:322668/133‑1 (MQ=255) cGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCcgc > 2:134492/1‑135 (MQ=255) ggAATTCATCTGCGCAAACACGGATGCCCAGGCGCTTAAAAACTTTGGCGCGCGCACAATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGGGCCGGTGCCAATCCGTAAGGCGGCCGTCAGGCCGCGCt < 3:446815/135‑1 (MQ=255) gAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCt > 3:178388/1‑134 (MQ=255) gAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAAAT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTAGGCGGGCACGCCgcgcgg > 5:347799/1‑133 (MQ=255) aaTTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCgcgcgg > 1:366708/1‑132 (MQ=255) aaTTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTg > 1:133749/1‑134 (MQ=255) ttCAGCTGGCCCAACCCCGATGCCCAGGCGCTTAAAAACATGGGCGCGCGAACCATCCTGAATTT‑GGGCAG‑GGGTGTTCCCACGGGCCTGGGGGCGGGGGCCAATCCGGACGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGaa < 8:195936/135‑1 (MQ=255) cAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAgc > 4:409424/1‑134 (MQ=255) cAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAgc > 5:195247/1‑134 (MQ=255) cAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAgc > 3:355080/1‑134 (MQ=255) ccGATCCCCCGGCGCTCAAAAACTTTGGCGCGCGCACCACCCTGCATTG‑GGGCAC‑GGGTGTCACCACGGGCCGGGGGGCCGGTGCCAATCCGTAAGGCGGCCGTCTGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTg < 7:307137/135‑1 (MQ=255) agccccGGGCGCTTAAAAACTTGGGCGCGCCCACCATCGT‑CAATTGGGGCCC‑GGGTGTGACCATGGGCCGGGGGGCGGGTGCAAATCGGTAAGTGGGCCGACTGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCg < 6:364295/132‑1 (MQ=255) gCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGaa > 8:307137/1‑135 (MQ=255) gCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGaa > 4:81699/1‑135 (MQ=255) gCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCACTCCGCGCTGGAAGCCCCTGCGCGCATTGCCGaa > 7:210304/1‑135 (MQ=255) gCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCCGCCCGCCGCGCGGGCAGACCCTGCGCGCAATTCCGaa > 1:444896/1‑135 (MQ=255) cccAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCCGGCCGCGCTGGAAGCCCGGGAGCGCATTGCCGAAg > 3:64622/1‑135 (MQ=255) cccAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCCGGCCGCCCGGGCAGCCCGTGACCCCAGTGCCGAAg > 6:249643/1‑135 (MQ=255) cccAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCCTTGCCGCAg > 6:51159/1‑135 (MQ=255) cctcaaaaaCATGGGCGCGCGCACCATCCTCCAATT‑GGCCCC‑GGGGGGGCCCACGGGCCGGGGTGCCGGGGCAAATCCGCACGGCGGCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCa < 5:196277/131‑1 (MQ=255) cTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAg > 3:205820/1‑135 (MQ=255) aaaaCATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGGGTGACCAAGGGCCTGGGGGCCGGTGCCAATCCGGACGTCGGCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAggg < 7:104791/133‑1 (MQ=255) aaaaCATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATG‑GGGCAG‑GGGTGTGACCACGGGCGGGGGGGCGGGTGCAAATCCGGAAGCGGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCa < 4:317932/135‑1 (MQ=255) aaaaCATTGGCGCGCGCACCAGCCTGCAATG‑GGCCAC‑GGGGGTGACCACGGGCCTGGGGGCCGGGGCCAATCCGCACGGCGGCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAggg < 4:234283/133‑1 (MQ=255) aaaCATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCAATGCCGAAGTGCTGCAGGGccc > 3:455842/1‑133 (MQ=255) aaCATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCAc > 7:15106/1‑134 (MQ=255) acttgggCGCGCGCACCATCCTGCATTT‑GGGCAC‑GGGGGGGACCACGGGCCGGGGGGCGGGGGCAAATCGGTACGGCGGCCGGCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCa < 4:430752/130‑1 (MQ=255) aTTGGCGCGCGCACCATCGTGCAATG‑GGCCAG‑GGGTGTCACCAAGGGCCGGGGGGCGGGTGCAAATCCGGAAGGCGGCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAAc < 7:110226/135‑1 (MQ=255) aTTGGCCGGCGCACCACCCT‑CAATTGGGGCCG‑GGGGGTGACAATGGGCGTGGGGGCGGGGGCCAAGCCGGACGGCGCCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAAc < 3:294014/135‑1 (MQ=255) cgcgcgcACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCGGGCAGACCGGGCGCGCAGTGCCGAAGTGCTGCAGCGCACCAACATggg > 2:248128/1‑134 (MQ=255) gcgcACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGtt < 3:81699/135‑1 (MQ=255) aCCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGCAGTGCTGCAGGGCACCAACAAGGTGTtcatc > 1:339539/1‑135 (MQ=255) gtccAATG‑GGGCCC‑GGGGGGGACCACGGGCCGGGGGGCGGGGGCCATGCGGGAAGGCGCCCGTCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCaccacc < 6:184094/132‑1 (MQ=255) ctccAATT‑GGGCCG‑GGGGGTGACCACGGGCCTGGGTGCCGGGGCAAATCCGGACGGCGGCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCaccacc < 5:326377/132‑1 (MQ=255) cgCAACT‑GGGCCCGGGGGGTGCCCAGGGGCCGGGGGGCCGGGCACAAGCGGGACGCCGGCCGCCCGCCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCaccacc < 5:86472/134‑1 (MQ=255) ggCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGt > 3:161388/1‑135 (MQ=255) ggCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGt > 7:123318/1‑135 (MQ=255) gcccc‑GGGGGTCACCAAGGGCCGGGGGGCGGGGGCCAATCCGCACGGCGGCCGTCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGt < 1:288186/131‑1 (MQ=255) gacaggggGTGACGACGGGCCTGGGTGCGGGTGCCAATCCGTAAGTCGGCGGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGTCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTg < 8:454739/131‑1 (MQ=255) cAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGATCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCTCCGGCATGGGTgg > 3:314865/1‑135 (MQ=255) cAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCCCCAACATGGTGGTCATCACCACCGGCATGGGTgg > 7:201887/1‑135 (MQ=255) cAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTGATCACCACCGGCATGGGTgg > 5:341566/1‑135 (MQ=255) cAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTgg > 6:184085/1‑135 (MQ=255) cAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTgg > 2:59188/1‑135 (MQ=255) cAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTgg > 3:403768/1‑135 (MQ=255) cAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACAAGGTGGTCATCACCACCGGCATGGGTgg > 4:261618/1‑135 (MQ=255) ggTGTGACCATGGGCCGGGGTGCCGGTGCAAATCCGGAAGGCGGCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGcggt < 4:268768/135‑1 (MQ=255) ggTGTCACCATGGGCCGGGGGGCGGGGGCAAATCCGGACGGCGGCCGCCCGCCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGcggt < 2:427704/135‑1 (MQ=255) tgtgACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGcggtac > 1:252116/1‑135 (MQ=255) 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ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCCACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTaccggtaccggt > 7:442623/1‑133 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGtt < 2:358426/96‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGtt > 1:358426/1‑96 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTaccggtaccggt > 8:36235/1‑133 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTaccggtaccggt > 4:429419/1‑133 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTaccggtaccggt > 4:172722/1‑133 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGCCATCGGTGGCggtaccggtaccctgtc > 7:454739/1‑130 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGAACGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTaccggtaccggt > 8:457456/1‑133 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCCCGCTGGAAGACCGGGAGCGCATTTCAGAAGTGCAGCAGGGCACCAACAAGGTGTTCATAACCACCGGCAGGGGTGGCGGTgccgggaccggt > 1:121571/1‑133 (MQ=255) ccTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCCGCCGTCAGGCCGCGGTGGGAGCCCGGGCGCCCATTTCCGAACTGCTGCAGGGCCCCAACAAGGTGTTCATCACCACCCGCAGTGGTGGCGGTACccgtgcccgtgc > 6:310782/1‑135 (MQ=255) gtgccggtgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTTATCGCATTTCCCAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCCCCGGCATGGGTGGCCGTACCGGTACCCGTGCAgcgc > 4:349715/1‑135 (MQ=255) gtgccggtgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCAGGGAGACCCTGAGCGCATTGCCGCACTGCTGCATGGCCCCCACATTGTGTTCATCACCACCCGCAAGGGTGGCGGTTCCGGATCCCGTCCAgcgc > 5:46502/1‑135 (MQ=255) gtgccggtgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCACTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTTCCGGTCCCGGTGCAgcgc > 3:351777/1‑135 (MQ=255) gtgccggtgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCACGCCCCCCTGGAACCCCGTGAGCGCATTGCCGAAGAGCAGCAGGGCACCACCATAGTGTTCATCACCACCCGCATGGGTGGCCGTTCCCGTACCGGTGCAgcg > 2:416354/1‑134 (MQ=255) tgccggtgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGCCCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCCCCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGcc > 5:373136/1‑135 (MQ=255) ggccggggccAAGCGGGAAGGCGGCGGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGcc < 4:456639/134‑1 (MQ=255) gccggtgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCCCCAACATGGTGTTCATCCCCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCa > 3:388433/1‑135 (MQ=255) gtgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCCCCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCa > 6:215927/1‑135 (MQ=255) tgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCAt > 2:323396/1‑135 (MQ=255) tgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCAt > 5:423966/1‑135 (MQ=255) tgccAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCAt > 7:44321/1‑135 (MQ=255) aaTCGGTAAGGCGGCCGGCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGcc < 5:83683/135‑1 (MQ=255) aaTCCGGACGTCGGCCGGCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGcc < 6:137128/135‑1 (MQ=255) gacgTCGGCCGTCGGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTg < 4:455842/132‑1 (MQ=255) gAAGTCGGCCGGCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTg < 2:366708/135‑1 (MQ=255) gAAGGCGGCGGTCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTg < 6:127767/135‑1 (MQ=255) aggTCGGCCGTCCGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTgg < 1:248324/133‑1 (MQ=255) acgtgggCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTgg < 3:213474/130‑1 (MQ=255) gTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGCCCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCCATCATTGCCGAAGTGGc > 5:390338/1‑134 (MQ=255) gggccggccggccGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTGGCCaa < 7:193388/134‑1 (MQ=255) cggccggcAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTGGCCaa < 6:430468/135‑1 (MQ=255) cGGCCGTACGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACAAAGATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTGGCCaa < 8:210304/135‑1 (MQ=255) cGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTGGCCAAGGaa > 3:452961/1‑135 (MQ=255) | CGAAGGCGTGGAATTCATCTGCGCCAACACCGATGCCCAGGCGCTGAAAAACATTGGCGCGCGCACCATCCTGCAATT‑GGGCAC‑GGGTGTGACCAAGGGCCTGGGTGCCGGTGCCAATCCGGAAGTCGGCCGTCAGGCCGCGCTGGAAGACCGTGAGCGCATTGCCGAAGTGCTGCAGGGCACCAACATGGTGTTCATCACCACCGGCATGGGTGGCGGTACCGGTACCGGTGCAGCGCCAATCATTGCCGAAGTGGCCAAGGAA > ACB122/1522138‑1522402 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |