Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 3,957,240 | C→T | 100% | G137R (GGG→AGG) | dmlR_13 ← | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 3,957,240 | 0 | C | T | 100.0% | 302.4 / NA | 82 | G137R (GGG→AGG) | dmlR_13 | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (40/42); total (40/42) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
GCTCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGAT > ACB122/3957111‑3957371 | gcTCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCgg < 5:32260/135‑1 (MQ=255) cTCCGGTACACGGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGc < 7:337517/135‑1 (MQ=255) cGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAg > 5:218132/1‑135 (MQ=255) gTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCg < 5:461429/135‑1 (MQ=255) gTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCg < 4:145120/135‑1 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCCCCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTg > 1:256474/1‑135 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCCCGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGGTg > 1:347732/1‑135 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTg > 8:397638/1‑135 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTg > 3:281674/1‑135 (MQ=255) gtgtCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTg > 4:155308/1‑135 (MQ=255) tCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGCTCGGGGTTgcgc > 8:205497/1‑135 (MQ=255) tCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGAGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTATCGGCCAGCGGGTCGGGGTTgcgc < 8:7133/135‑1 (MQ=255) ccAGGTAGCCGGTGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTgcgc < 8:326/134‑1 (MQ=255) cAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTg < 7:355309/135‑1 (MQ=255) aGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCCCCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGc > 5:256213/1‑135 (MQ=255) aGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGc > 6:182831/1‑135 (MQ=255) aGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCAAGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGc > 8:239046/1‑135 (MQ=255) cgcgCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGTGCTGCGACAGCGTCAGCt > 7:366394/1‑134 (MQ=255) gcgcAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCg > 1:38387/1‑135 (MQ=255) gcgcAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCg > 8:41617/1‑135 (MQ=255) cgcAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGa < 8:308969/135‑1 (MQ=255) gcAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGAt < 5:177744/135‑1 (MQ=255) gcAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGGCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGAt < 7:325534/135‑1 (MQ=255) aGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACCGCGTCAGCTCGATca > 8:175201/1‑135 (MQ=255) ggATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATcacca < 7:100086/135‑1 (MQ=255) ggATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATcacca < 8:272100/135‑1 (MQ=255) aTGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACt < 7:397638/135‑1 (MQ=255) gAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCgg > 4:218534/1‑135 (MQ=255) aaaTATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCgg < 2:24037/133‑1 (MQ=255) aaTATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGt < 2:412282/134‑1 (MQ=255) aaTATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTa < 1:399618/135‑1 (MQ=255) atatTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTaa < 7:28640/135‑1 (MQ=255) tatTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTaaa > 3:285548/1‑135 (MQ=255) cccAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCAtg > 6:265499/1‑135 (MQ=255) cAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGGCCGCTCGATCCCCACTTCCGGGTAACGCAggtt > 5:313806/1‑135 (MQ=255) ggCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAg > 7:284397/1‑135 (MQ=255) cacaGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCCCCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGcc > 5:50287/1‑135 (MQ=255) tCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCg < 3:291997/108‑1 (MQ=255) tCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCg > 4:291997/1‑108 (MQ=255) tGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGc > 3:378957/1‑135 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCGAGCGGGTCGGGGGTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 4:114925/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGTGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 8:366394/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 6:230555/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 6:142505/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 5:265499/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 8:99574/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 5:173067/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 4:55773/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 4:281674/135‑1 (MQ=255) aTCCGGCAGCGCACAGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 2:436276/135‑1 (MQ=255) ccGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCa > 3:287767/1‑135 (MQ=255) ccGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCa < 4:287767/135‑1 (MQ=255) aGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGc < 2:303586/123‑1 (MQ=255) aGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGc > 1:303586/1‑123 (MQ=255) aGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGGCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACGTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCCCCCGCGGCATCAGCAACAGc > 7:412358/1‑135 (MQ=255) cgcACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGccc < 2:38387/135‑1 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCCCCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGc > 1:452638/1‑135 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGc < 5:259945/135‑1 (MQ=255) aCGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGc < 5:72201/135‑1 (MQ=255) cGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCg < 6:218132/135‑1 (MQ=255) cGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCg < 6:174497/135‑1 (MQ=255) cGGTGATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCg < 1:16429/135‑1 (MQ=255) tGAGCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGc < 5:240693/135‑1 (MQ=255) gATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCa < 1:64814/135‑1 (MQ=255) gATCACCACGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCa > 3:371212/1‑135 (MQ=255) caccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg > 8:140172/1‑108 (MQ=255) caccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAg < 7:140172/108‑1 (MQ=255) caccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGt > 8:229011/1‑134 (MQ=255) accacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCCTGCCGTGCGGGCAGTg > 6:258285/1‑134 (MQ=255) accacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTg > 3:189685/1‑134 (MQ=255) ccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGc > 5:308064/1‑134 (MQ=255) ccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGc > 4:190598/1‑134 (MQ=255) ccacGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCa > 6:239049/1‑135 (MQ=255) acGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCa > 6:430523/1‑106 (MQ=255) acGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCa < 5:430523/106‑1 (MQ=255) acGTCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCaaa > 7:328551/1‑135 (MQ=255) tCATGCCTTTCGGCCAGCGGGTGGGGGTTGCGCTGCGACAGCGGCAGCTCGATCACCACTTCCGCGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGc < 5:269962/135‑1 (MQ=255) aTGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCCCTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCCCCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAAc > 6:116141/1‑131 (MQ=255) aTGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGc > 8:200285/1‑118 (MQ=255) aTGCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGc < 7:200285/118‑1 (MQ=255) gCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGAt > 7:289880/1‑135 (MQ=255) gCCTTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGAt > 7:380637/1‑135 (MQ=255) | GCTCCGGTACACCGTGGGTGTCCAGGTAGCCGGGGGCCGCGCAGGGGATGCTGAAAATATTGCCCAGCGGCACAGCGATCAGTTGCGAATCCGGCAGCGCACCGTCCACGGTGATCACCACGTCATGCCCTTCGGCCAGCGGGTCGGGGTTGCGCTGCGACAGCGTCAGCTCGATCACCACTTCCGGGTAAAGCATGTTGTAGCCGGCCACCAGCGGCATCAGCAACAGCCCCATGCCGTGCGGGCAGTGCAAACGCAGAT > ACB122/3957111‑3957371 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |