Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 1,804,932 | C→T | S181N (AGC→AAC) | dmlR_4 ← | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 1,804,932 | 0 | C | T | 97.6% | 264.9 / NA | 83 | S181N (AGC→AAC) | dmlR_4 | HTH‑type transcriptional regulator DmlR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (39/41); minor base G (0/2); total (39/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.95e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGCTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAGGTCCATGCCT > ACB122/1804801‑1805060 | ccAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTtgt > 2:121986/1‑135 (MQ=255) cTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTggccggcc < 3:311380/135‑1 (MQ=255) cTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTggccggcc > 3:278034/1‑135 (MQ=255) cTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTggccggcc < 1:98839/135‑1 (MQ=255) cTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGCTGTGTggccggcc < 4:31403/135‑1 (MQ=255) ggCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCCCGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTggccggcc > 4:199981/1‑133 (MQ=255) ggCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTggccggcc > 3:300072/1‑133 (MQ=255) ggCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCAt > 4:34568/1‑135 (MQ=255) cACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGTCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAgc < 5:445939/135‑1 (MQ=255) cACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAgc < 4:303682/135‑1 (MQ=255) cACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAgc < 3:126426/135‑1 (MQ=255) cACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTCTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGGGGCCGGCCATAgc < 1:4084/135‑1 (MQ=255) ttGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGATCTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCt > 3:409202/1‑133 (MQ=255) tGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCa < 5:142381/134‑1 (MQ=255) cgcCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAgg < 7:300463/136‑1 (MQ=255) gTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGc > 7:30954/1‑136 (MQ=255) ttACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCg < 7:12661/136‑1 (MQ=255) tACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCg < 1:86166/135‑1 (MQ=255) ccTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGaa < 3:34568/134‑1 (MQ=255) cTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAac < 5:446608/135‑1 (MQ=255) cTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATACGCCGGCGAAac < 6:302976/135‑1 (MQ=255) gTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAacac > 4:302319/1‑135 (MQ=255) gTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAacac > 3:42509/1‑135 (MQ=255) ccGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGACACACACAg > 1:210671/1‑135 (MQ=255) ccGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAg > 6:396607/1‑135 (MQ=255) gctggctgATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTggccggcc < 6:85442/100‑1 (MQ=255) gctggctgATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTggccggcc > 5:85442/1‑100 (MQ=255) tggctgATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTAc < 3:302319/135‑1 (MQ=255) gctgATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACAt > 4:8910/1‑135 (MQ=255) gATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATgcg > 1:420447/1‑135 (MQ=255) aTCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAacacac > 5:181025/1‑123 (MQ=255) aTCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAacacac < 6:181025/123‑1 (MQ=255) aTCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGCTACATgcgc > 1:344827/1‑135 (MQ=255) aTCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCACGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATgcgc > 2:99247/1‑135 (MQ=255) cATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGCACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCa > 1:247888/1‑135 (MQ=255) ctgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGGGTGGCCGGCCATAGCGCTCAACATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCg < 1:426626/135‑1 (MQ=255) ctgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGGGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCg < 1:426623/135‑1 (MQ=255) tgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCATTTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCgg < 5:5711/135‑1 (MQ=255) tgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCggg > 8:398660/1‑136 (MQ=255) tgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCgg > 2:93092/1‑135 (MQ=255) tgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCgg < 5:409120/135‑1 (MQ=255) tgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACAAGCGCCTAGGCGCCAGGCgg > 4:374808/1‑135 (MQ=255) tgctgTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGCGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCgg < 1:37337/135‑1 (MQ=255) aGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGc < 4:353326/134‑1 (MQ=255) gcgcCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTgg > 4:402198/1‑118 (MQ=255) gcgcCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTgg < 3:402198/118‑1 (MQ=255) gcCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGccacc < 3:199981/135‑1 (MQ=255) cccACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGccacca > 6:150520/1‑135 (MQ=255) acaAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAgg > 3:362852/1‑134 (MQ=255) acaAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGc > 2:288846/1‑135 (MQ=255) acaAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGc > 8:278536/1‑135 (MQ=255) aGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCg > 4:226294/1‑133 (MQ=255) aGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCg > 1:151542/1‑133 (MQ=255) aaCTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGTCAGTCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCCCCAGGCGCGAGTCgg > 1:333789/1‑135 (MQ=255) cTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCgg > 6:371669/1‑133 (MQ=255) tCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCa > 4:191509/1‑135 (MQ=255) tCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAg > 7:347905/1‑136 (MQ=255) ccaccaGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGGTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTGGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAggc < 3:199030/135‑1 (MQ=255) acccGGCAATGGTGCCGCGCCAGCTCCGCCCGGGTGTGGGGCCGGCCATAGCGCTCAAGAGAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAggcggc < 8:185374/136‑1 (MQ=255) accaGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAggcgg > 4:204461/1‑135 (MQ=255) accaGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAggcgg > 3:186351/1‑135 (MQ=255) accaGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAggcgg > 6:299483/1‑135 (MQ=255) ccaGGCACTTGGGCCGCGCCCGCTCCGACAGGTTGTGGGGCCGGCCATAGCGCTCAAGCTCGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAggcggc < 1:374714/135‑1 (MQ=255) caGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAggcggc > 6:360728/1‑134 (MQ=255) gCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGa < 8:140649/136‑1 (MQ=255) gCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGa < 7:398660/136‑1 (MQ=255) cAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGa < 6:191154/135‑1 (MQ=255) cAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGa < 4:278034/135‑1 (MQ=255) cAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGa < 3:418014/135‑1 (MQ=255) aTTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGAc > 3:312745/1‑134 (MQ=255) gtgCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGAt < 7:172168/135‑1 (MQ=255) tgCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATg > 6:263228/1‑135 (MQ=255) tgCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATg < 7:278536/135‑1 (MQ=255) tgCCGCGCCAGCGCCGACAGGTTGTGGGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATg < 1:320412/135‑1 (MQ=255) gCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATg < 6:29282/134‑1 (MQ=255) gCCGCGCCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATg < 4:384351/134‑1 (MQ=255) gcCAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAgg > 6:190104/1‑135 (MQ=255) gcCAGCTCCGACAGGTTGGGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGAGAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACTGATGGCCAGGt < 7:227394/136‑1 (MQ=255) cccgCTCGGACCGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGCTAGGCCGGCTAAACACACAGGTACAGGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAGGt < 5:254724/132‑1 (MQ=255) ccAGCTCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAGGt < 4:362852/135‑1 (MQ=255) ccAGCTCCGACAGGTTGTGGGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAGGt < 5:190104/135‑1 (MQ=255) tCCGACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAGGTCCATg < 3:8910/135‑1 (MQ=255) gACAGGTTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAGGTCCATGCCt < 1:121986/135‑1 (MQ=255) | CCAGCACTGCCTGGCCACTGTTGCAGCGCCAGTTACCCTGTACCCGCTGGCTGATCTCACGGCCATCCTGCTGTAGCGCCCACAAGTCCGAACTCCCCACCAGGCAATTGTGCCGCGCCAGCTCCGACAGGCTGTGTGGCCGGCCATAGCGCTCAAGATAGGCCGGCGAAACACACAGGTACATGCGCCTTGGCGCCAGGCGGGTAGCCACCAGGCGAGAGTCGGCCAGGCGGCCAAGACGGATGGCCAGGTCCATGCCT > ACB122/1804801‑1805060 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |