Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 5,613,064 | C→T | 6.3% | P13P (CCG→CCA) | mshA_6 ← | D‑inositol‑3‑phosphate glycosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 5,613,064 | 0 | C | T | 6.3% | 247.8 / 4.8 | 79 | P13P (CCG→CCA) | mshA_6 | D‑inositol‑3‑phosphate glycosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/36); new base T (2/3); total (40/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
TGAGGGCATATGCCATTCCCGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCAACCAGCGTCAAT > ACB122/5612929‑5613197 | tGAGGGCATATGCCATTCCCGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTAc > 7:137923/1‑136 (MQ=255) aGGGCATATGCCATTCCCGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACg < 4:17615/135‑1 (MQ=255) atatGCCATTCCCGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTc < 7:233506/136‑1 (MQ=255) atatGCCATTCCCGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTc < 7:377386/136‑1 (MQ=255) tGCCATTCCCGGGTCGAACCGCGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCAc > 4:333044/1‑136 (MQ=255) ccATTCCCGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCcccc > 5:6141/1‑135 (MQ=255) ccATTCCCGGGTCGAACCGACCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCAGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCAccc > 4:205123/1‑136 (MQ=255) cccGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCACCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCca > 7:211677/1‑136 (MQ=255) ccGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCCCCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCca > 7:115575/1‑135 (MQ=255) ccGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTATGGCGTTCCACCCGccc > 1:171411/1‑134 (MQ=255) ccGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTATGGCGTTCCACCCGccc > 1:176166/1‑134 (MQ=255) ccGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCca < 7:179581/135‑1 (MQ=255) ccGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCca > 7:98998/1‑135 (MQ=255) ccGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCACTTACTGCTCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTAGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCca > 8:17480/1‑135 (MQ=255) cGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTATGGCGTTCCACCCGCCca < 5:104348/134‑1 (MQ=255) cGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAACACCTGCCGGTGCCCCTTGTGGATGGCCATGTCCGGCGTTCCACCCGcccc > 2:177338/1‑133 (MQ=255) aaCCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCatat < 5:139719/135‑1 (MQ=255) aCCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTg < 8:137067/136‑1 (MQ=255) ccGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTATGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTg < 2:176166/135‑1 (MQ=255) ccGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTATGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTg < 2:171411/135‑1 (MQ=255) ccGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGa < 8:137923/136‑1 (MQ=255) ccACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATg > 6:75575/1‑135 (MQ=255) cacaGCAGAGCGCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGGATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGtt < 8:85901/136‑1 (MQ=255) cagAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTg > 5:29894/1‑123 (MQ=255) cagAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTg < 6:29894/123‑1 (MQ=255) cagAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATgg > 4:151385/1‑136 (MQ=255) cagAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATgg < 7:55784/136‑1 (MQ=255) cagAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCAGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTg < 5:325959/123‑1 (MQ=255) cagAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCAGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTg > 6:325959/1‑123 (MQ=255) cccGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCct < 7:340463/136‑1 (MQ=255) ccGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCAccc > 8:193191/1‑102 (MQ=255) ccGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCAccc < 7:193191/102‑1 (MQ=255) ccGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCct > 5:173080/1‑135 (MQ=255) ccGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGGTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCct < 5:56548/135‑1 (MQ=255) ccccAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTccc > 6:353883/1‑135 (MQ=255) ccccAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCATGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCCCCCACATAATATTGCCGATGTTCATGGGCCCTCTccc > 6:250123/1‑135 (MQ=255) ccAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCTCCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCGCTCTccc < 5:250123/133‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTccc < 6:173080/133‑1 (MQ=255) ccAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTccc < 2:365846/133‑1 (MQ=255) gcagcagcCAGTTACTGCTCCGGGCATCGGCACCCTCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGAAATGTACGGCGTTCCACCCGCCAACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCa < 2:229448/135‑1 (MQ=255) aGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGAACATTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCAGCCCACATAATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTgg > 3:386890/1‑136 (MQ=255) cTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACa > 6:363063/1‑135 (MQ=255) cGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCAcc < 1:87815/71‑1 (MQ=255) cGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCAcc > 2:87815/1‑71 (MQ=255) cGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGCCt > 1:345117/1‑135 (MQ=255) cGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACt < 8:98998/135‑1 (MQ=255) cGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACt < 3:333044/135‑1 (MQ=255) ggCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACtt > 1:186253/1‑134 (MQ=255) ggCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTc > 1:37031/1‑135 (MQ=255) ggCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATAATGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGATCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTc < 1:177338/135‑1 (MQ=255) cATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCAtt < 7:17480/136‑1 (MQ=255) cACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTc < 7:92653/104‑1 (MQ=255) cACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTc > 8:92653/1‑104 (MQ=255) cACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACa > 8:3034/1‑135 (MQ=255) cgcgTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAAt < 8:360720/136‑1 (MQ=255) gcgTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAAt < 6:110803/135‑1 (MQ=255) gcgTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAAt < 2:238486/135‑1 (MQ=255) gcgTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGACCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAAt < 5:241041/135‑1 (MQ=255) cAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGccc < 8:83748/53‑1 (MQ=255) cAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGccc > 7:83748/1‑53 (MQ=255) aaGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTccc < 7:3034/136‑1 (MQ=255) aGACCAGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTccc < 5:240771/135‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCTCCCGCCAACATCATATTGACGATGTTCATGGGACCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGc > 2:21340/1‑135 (MQ=255) cTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGcc < 3:205123/136‑1 (MQ=255) ggTGCACCTTGTGGATTGACATGTACGGAGTTCCACCAGCCCACATCATAATCACGATGTTCATTGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGCCAGCGCCTTCAATCACAAAAAATCGAGCTTCCCTTGCAGATc > 6:239872/1‑135 (MQ=255) aCCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGc > 5:222088/1‑135 (MQ=255) ccTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGACAGGAGGGACAGCCACTACATTGAACAAAAAATGAGATACCCATGCCGATCAAGGcc > 5:211537/1‑135 (MQ=255) ggatggaCATGTACGGCGTTCCACCCGCCGACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGc < 6:209072/134‑1 (MQ=255) ggatggaCATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCaa > 8:51487/1‑136 (MQ=255) ggatggaCATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCa > 1:121511/1‑135 (MQ=255) ggatggaCATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATAGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGCTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCa > 5:164147/1‑135 (MQ=255) gatggaCATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCaa > 5:66698/1‑135 (MQ=255) aCATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCAGATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGCCTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCAACCAGc > 2:307382/1‑135 (MQ=255) aTGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCAtt < 3:315563/86‑1 (MQ=255) aTGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCAtt > 4:315563/1‑86 (MQ=255) aTGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCACCCAGCg > 6:295770/1‑134 (MQ=255) aTGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCAACCAGCGt > 7:356279/1‑135 (MQ=255) aCGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCAACCAGCGTCaa < 6:334919/134‑1 (MQ=255) aCGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCAACCAGCGTCAAt > 5:172948/1‑135 (MQ=255) aCGGCGGTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCACTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCAACCAGCGTCa < 6:6141/133‑1 (MQ=255) | TGAGGGCATATGCCATTCCCGGGTCGAACCGAGCCCACAGCAGAGCCCGCTCCCCAGCAGCAGCCAGTTACTGATCCGGGCATCGGCACCCGCGTTCGACAAGACCTGCCGGTGCACCTTGTGGATGGACATGTACGGCGTTCCACCCGCCCACATCATATTGACGATGTTCATGGGCCCTCTCCCGCTCAAGTCAGGTGGGACAGCGACTTCATTGAACAAAAATGGTGATTCCCATGCCGATCAAGGCCCCCGCAACCAGCGTCAAT > ACB122/5612929‑5613197 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |