Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | ACB122 | 1,503,076 | G→A | 69.1% | P516L (CCG→CTG) | lpoA ← | Penicillin‑binding protein activator LpoA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB122 | 1,503,076 | 0 | G | A | 69.1% | 90.6 / 57.5 | 68 | P516L (CCG→CTG) | lpoA | Penicillin‑binding protein activator LpoA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (11/10); new base A (20/27); total (31/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCAGTTGGCCCAGGCGCGGCGCCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTCGGCTTGATC > ACB122/1502942‑1503204 | tCAGTTGGCCCAGGCGCGGCGCCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACg > 1:222664/1‑135 (MQ=255) tCAGTTGGCCCAGGCGCGGCGCCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGACGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACgg > 8:18025/1‑136 (MQ=255) ccAGGCGCGGCGCCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGCCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTCTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGAGTTTc > 2:158460/1‑133 (MQ=255) cAGGCGCGGCGCCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTc > 6:256543/1‑132 (MQ=255) aGGCGCGGCGCCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGa < 7:283679/136‑1 (MQ=255) gcggcgcCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGc > 5:215105/1‑135 (MQ=255) cggcgcCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACCGGCGGCCGCGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCGGTTGACGCAGGCTGGTGCTGGTGTCGCGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCg > 5:111771/1‑135 (MQ=255) ggcgcCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCgg < 5:127982/135‑1 (MQ=255) ccAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGc > 1:126883/1‑135 (MQ=255) aGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGt < 7:49912/136‑1 (MQ=255) ggCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGt < 4:391158/135‑1 (MQ=255) ggCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGt < 2:110170/135‑1 (MQ=255) ggCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGt < 3:8286/135‑1 (MQ=255) gCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGTCTTGCGGCCACTGCTGTACACCCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCa > 3:38490/1‑135 (MQ=255) gCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCa > 1:174754/1‑135 (MQ=255) aTCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTAGAACCTGGTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCAtt < 6:342793/135‑1 (MQ=255) aTCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCAtt < 5:189461/135‑1 (MQ=255) tCGACGCCCATGGGATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGTCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGGGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTg < 5:242124/135‑1 (MQ=255) cGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACg > 3:276811/1‑96 (MQ=255) cGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACg < 4:276811/96‑1 (MQ=255) cGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACt < 4:320235/135‑1 (MQ=255) cGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTg > 7:198638/1‑136 (MQ=255) gCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTg < 4:278187/135‑1 (MQ=255) tACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCAc < 8:236609/136‑1 (MQ=255) aCAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCAc < 4:308484/135‑1 (MQ=255) aCAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCAc < 1:194093/135‑1 (MQ=255) aCAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCAc < 2:196041/135‑1 (MQ=255) ggcggcCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGc < 4:177763/135‑1 (MQ=255) gcggcCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGTCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTg < 7:288771/136‑1 (MQ=255) cggcCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTg < 4:314598/135‑1 (MQ=255) cggcCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTg < 2:222664/135‑1 (MQ=255) cggcCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTg < 3:275993/135‑1 (MQ=255) cggcCGAGGCGGCCGGCGGCTTGCGGCCACTTCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTg < 2:88923/135‑1 (MQ=255) gcCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGgc > 4:219511/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGTTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 1:150579/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 6:275358/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTg > 7:190591/1‑136 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGCTGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 3:392168/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 4:297002/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 6:247250/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 1:155428/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 2:325550/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt > 4:328354/1‑135 (MQ=255) gAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCAAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCt < 4:330944/135‑1 (MQ=255) aGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTg < 1:165313/135‑1 (MQ=255) gCCTGCGGCTTGCGGCCTCTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGGGTCGAGCAGCCTCAGTGTTTCGCAGTAGCGGAAGGCGATCATGGCATTGTACTGGTGGATGTCACCTCTGGGGCTGGACAg < 1:158460/135‑1 (MQ=255) gcggcTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGCTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTc < 3:69758/135‑1 (MQ=255) cggcTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCg < 3:51459/135‑1 (MQ=255) gCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTg > 2:394662/1‑134 (MQ=255) ccACTGCTGTACAACCTTTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTGATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCTATGTGGCATa < 2:122030/135‑1 (MQ=255) tgTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCg < 2:148424/133‑1 (MQ=255) tgTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGCGGTGGCATAGACCg < 6:324607/133‑1 (MQ=255) aaCCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGt < 5:247250/134‑1 (MQ=255) gTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGCCCGGCACGTCACCGGc > 8:216620/1‑136 (MQ=255) tGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTc > 8:228530/1‑105 (MQ=255) tGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTc < 7:228530/105‑1 (MQ=255) tGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGc > 3:100876/1‑134 (MQ=255) gACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGt > 6:363534/1‑135 (MQ=255) gACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGt > 3:353694/1‑135 (MQ=255) gACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGt > 3:347870/1‑135 (MQ=255) cGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTAc > 4:391733/1‑135 (MQ=255) cGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTAc < 2:343726/135‑1 (MQ=255) cGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTAc > 6:88182/1‑135 (MQ=255) gCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGaa < 5:88182/135‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCa < 1:12190/135‑1 (MQ=255) cTGGTGTCGAGCAGCCACAGTGTTTCGAAGAAGCGGATGCCGGTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAg < 5:256543/134‑1 (MQ=255) gtgtCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTc < 7:198841/135‑1 (MQ=255) tCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTCGGc > 1:89555/1‑135 (MQ=255) tCGAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTCGGc > 4:113332/1‑135 (MQ=255) gAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTCGGCtt > 6:370165/1‑135 (MQ=255) gAGCAGCCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTCGGCTTg > 8:98591/1‑136 (MQ=255) agcCACAGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTCGGCTTGATc < 3:328354/135‑1 (MQ=255) | TCAGTTGGCCCAGGCGCGGCGCCAGGCTGTAGGCATCGACGCCCATGGCATACAGGCGGCCGAGGCTGCCGGCGGCTTGCGGCCACTGCTGTACAACCTGTTGACGCAGGCTGTTGCTGGTGTCGAGCAGCCACGGTGTTTCGCAGAAGCGGATGCCGTTCATGTCATTGTACTGGTTGATGTCACCGCTGGCGCTGTACAGGTTCGAGGTGGCATAGACCGGCACGTCACCGGCGTACTGGAAGTTCAGGGTCGGCTTGATC > ACB122/1502942‑1503204 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |