Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 2,127,629 | 0 | C | G | 21.5% | 170.3 / 12.8 | 83 | E727Q (GAA→CAA) | fadE | Acyl‑coenzyme A dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (23/39); new base G (17/0); total (44/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GTCGATACCGGACTGGCCGGGGGCTGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAGGGGAAC > ACB143/2127498‑2127759 | gTCGATACCGGACTGGCCGGGGGCTGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCt > 8:264694/1‑137 (MQ=255) cGATACCGGACGGGCGGGGGGCGGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCGGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCtgt < 8:357151/137‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGGGGCTGGCTGGACTTTGCCTGCCTTGCCGGCTTGGTCCCGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGAGCGGTag < 6:180789/136‑1 (MQ=255) cgggCCGGGGGCTGGCGGGACTTTGCCGTCCTTGCCGGCTTGGTCCCGGGCCTGGCTCAACTGTGCCGGGTCTTCGCGCAGGGCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTagc < 5:4651/135‑1 (MQ=255) ggCCGGGGGCTGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTagcag > 3:170466/1‑137 (MQ=255) ggCCGGGGGCTGGCGGGAATTGGCCTTCCTTGACGGCTTGGAACAGGGCCTTGCGCAACTGTGCGGTGGCTGCGAGCCGGGCACTGGCCCGTTGCAGACCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTagcag < 2:327449/137‑1 (MQ=255) gggggCTGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCgg > 1:224351/1‑137 (MQ=255) gggggCTGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCgg > 6:186267/1‑137 (MQ=255) gggggCTGGCTGGACTTTGACTTCCTTGACTGCTTGGTACAGTGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGAAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGAGCCTGTGGGCGGGAGGAGccag > 5:314915/1‑135 (MQ=255) gggCTGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGGCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGcc < 2:29319/137‑1 (MQ=255) ggctggctGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTGCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCca < 7:282569/137‑1 (MQ=255) gtggctggACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCcagc < 3:107354/136‑1 (MQ=255) gtggatggaCTTTGCCTGCCTTGAGGGCTGGGTACAGGGCCTTCCGCAAGTGTGCGGTGTCTTCGAGCAGGCCACGGGCCCGTTGCAGAGCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCcagc < 7:309675/136‑1 (MQ=255) ggggctggACTTTGCCTTCCTTCACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGGGTCTGCGAGCAGGTCAGGGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCcagc < 8:138501/135‑1 (MQ=255) ctggctggACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTTTGCCGGTGGGGGGGTGCAGCccgcccgc > 1:129014/1‑137 (MQ=255) tggACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGGCGGTGGGCGGTTGCCGCCGGCCAGCAGTtc > 6:252847/1‑137 (MQ=255) tggACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTtc > 7:69766/1‑137 (MQ=255) tggACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTtc < 2:47923/137‑1 (MQ=255) tttGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCa < 7:206451/137‑1 (MQ=255) ttccttGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAAGTGTGCCGTGTCTTCGAGCTGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCTAGCAGTTCCTCCAGTGCCg < 8:16199/137‑1 (MQ=255) ttccttGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGGGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCCGTGccc > 6:277384/1‑136 (MQ=255) ttccttGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCg < 8:69766/137‑1 (MQ=255) ttccttGACGGCGTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCGGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCg < 6:143370/137‑1 (MQ=255) tccttGACGGTTTGGTACAGGGCATTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGTTAACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCgg < 3:169816/137‑1 (MQ=255) ttGACGGCTTGGTACAGGGCCGTGCTCAACTGTGCCGTTTCTTCTAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGAGCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATc < 8:135681/137‑1 (MQ=255) gACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCAGTGGGCGGGAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGAgcgc > 4:81558/1‑137 (MQ=255) ggCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTGGCGGTTGGCGGGTGCAGCCGGCCCGCACGTCCACCAGTGCCCGATAGcccg > 1:89593/1‑136 (MQ=255) ggCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCt < 5:106617/137‑1 (MQ=255) gttACCGGGCCTTGCTCAAATGTGCCGTGTCTGCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTgcgc < 2:101408/135‑1 (MQ=255) ggTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTgcgc < 2:224351/137‑1 (MQ=255) ggTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTCTGGCTGTGGGGGGTAGCCGCCGGCCAGCAGGTCCTCCAGTGCCGGATCCCCCGTgcgc > 8:161857/1‑137 (MQ=255) tACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTTCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGGTGCTCCAGTGCCGGATCGCCCGTGCgccc > 3:147098/1‑136 (MQ=255) tACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTGCCTGTGGGCGGTTGGCGCCCGCCAGCAGTTGCTCCAGTGCCGGCTCGCCCGTGCgccc > 4:276639/1‑136 (MQ=255) aGGGCCTTGCTCACCTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGGCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCgccggcc < 8:268084/137‑1 (MQ=255) gggCCTGGCTCAAGTGTGCCGGGTCTTCGAGCAGGGCACTGGCCCGTTGCACATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCgccggccg < 1:41777/137‑1 (MQ=255) ccTTGCTCAACTGTGCCGGGTCTTCGAGCTGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATc < 1:3842/137‑1 (MQ=255) cTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCCGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGCTcc > 4:153410/1‑136 (MQ=255) cTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTGCTCCAGTGCCCGATCGCCCATGCGCCGGCCGATCa > 5:117487/1‑137 (MQ=255) cTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTGTGCGTGTGGGGGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTGCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTTCGCCGGCCGATCa > 3:89136/1‑137 (MQ=255) cTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTGTGCCTGTGGGCGGTTGCAGCCGGCCCGCAGTTCCTCCCGTGCCGGATCGCCCGTGCgccggccgcgcc > 4:61251/1‑133 (MQ=255) tCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCCGCAGTTCCTCCAGTGCCGGCTCGCCCGTGCGCCGGCCGCTCCGCTCg > 3:332933/1‑137 (MQ=255) tCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTGCCTGTGGGCGGGAGCAGCCCGCCCGCAGTTCCTCGAGTGCCGGATAGGCCTTGCGCCGGCCGCTCACCtag > 7:6291/1‑135 (MQ=255) tCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTTCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTGCTCCAGTGCCGGATCGCCCGTGCGCCGGCCGCTCAGCTCg > 3:153693/1‑137 (MQ=255) tCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCCGCCGTTCCTCCAGTGCCGGCTAGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCg > 5:252121/1‑137 (MQ=255) tCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTcc > 8:8654/1‑136 (MQ=255) tCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCCGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCCGCCGCTCAGCTCg > 4:107740/1‑137 (MQ=255) tCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTATGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTACTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCg > 7:261047/1‑137 (MQ=255) acAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGAGCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCg < 3:276639/136‑1 (MQ=255) aaCTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGGCAGTGGGGGGTAGCCGCCGGCCCGCAGTAGCGACACTGCCCGATCGCCCTTGCGCCCGCCGCTCAGCTCGGc > 6:358092/1‑137 (MQ=255) tgCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTATGCCTGTGGGGGGGAGCCGCCGGCCAGCCGTTCCTCCCCTGCCGGCTCGCCCGTGCGCCCGCCGCTCAGCTCGGCcccca > 5:299112/1‑136 (MQ=255) tgCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTATGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTACACTGCCGGATACCCCAAGCGCCGGCCGATAAGCTCGGCcccca > 6:254352/1‑136 (MQ=255) ccGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCg < 7:264694/137‑1 (MQ=255) ccGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTGTTGCTGTGGGGGGTTGCAGCCGGCCCGCAGGTGCTCCACTGGCGGATCGCCCGTGCGCCGGCCGCTCAGCTCGGCCACcgcg > 3:109093/1‑137 (MQ=255) cGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTGCCTGTGGGCGGTAGCCGCCGGCCAGCAGGTGCACCAGTTCCGGATAGGCCAAGAGCCGGCCGATCAGCACGGCccccaccg > 7:215901/1‑133 (MQ=255) cGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGATCCTGTGGGCGGTGGGCCCCCGCCAGCAGTTGCACCAGTGCCGGATCGCCCGTGGCCCGGTCGATCAGCGCGGCCCCCACgg > 5:305712/1‑137 (MQ=255) cGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGGCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCCGCAGGTCCGCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCCGCCGATCAGCTCGGCCACCGCgg > 1:20006/1‑137 (MQ=255) gtgtCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGATGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTAGGc < 3:81558/137‑1 (MQ=255) gtgtCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGAAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGc < 3:74368/137‑1 (MQ=255) cTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCCGTTCCTCCCGTGTCGGATCGCCCTTTCGCCCGCCGATACGCTAGGCCACCTCGGCAAcc > 6:266456/1‑137 (MQ=255) ggcACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑c < 2:116419/135‑1 (MQ=255) gTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑c < 2:129014/137‑1 (MQ=255) gTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑c < 1:114003/137‑1 (MQ=255) ctCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGGAGCCGGCCAGCAGTTGCTCCAGTGCCGGATCGCCGTTGCGGCGGCCGATCAGCTCGGCCACATCGGCATCCAGTTCATCA‑c < 6:362828/136‑1 (MQ=255) tCAGTGGCCTGTTGCCGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCATCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGGCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑cc < 1:67493/137‑1 (MQ=255) aCTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTTCCAGTGGGCGGTAGCATCCGGCCAGCAGTTGCTACAGTGCCGGATACCCCATGCGCCGGCCGCACAGCTACGCCCCCCCCGCAACCAGTTCATCA‑cccg > 6:235748/1‑135 (MQ=255) aCTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCACCTAGGCCACCTCGGCATCCAGTTGATCA‑cccg > 7:57361/1‑135 (MQ=255) tGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTGTTGCGTTGGGGGGGAGCAGCCCGCCCGCAGGTGCTCCACTGCCGGCTGGCCCGTGCGCCGGCCCCTACACTCGGGCCCCACCGCCTACAGTTAATTACCCGGGGCCCtatt > 6:232689/1‑134 (MQ=255) tGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGGCTGTGGGCGGTTGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCCATCAGCTCGGCCACCGCGGCCTCCAGTTCATAA‑CCCGGGgccggatt > 2:114003/1‑132 (MQ=255) tGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTGTGCCTGTGGGGGGTAGCAGCCCGCCACCCCTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCATGCGCCGCCCGATGCGCTCGCGCACCTCGGCCTGCAGTTGGTGA‑CCCGGGCCCGTATg > 8:42370/1‑137 (MQ=255) cAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATggc > 6:160127/1‑137 (MQ=255) cAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTGTTGCTGTGGGGGGTAGCAGCCGGCCCGCAGTTACGCCAGTGCCGGCTCCCCCGTGCGCCCGCCGCGCAGCTCGGCCCCCTCGGCCTACAGGTCATCA‑CCGGCGCCCGTATggg > 4:39369/1‑136 (MQ=255) cAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTGTGCCGGGTGGGGGTTGCAGCCGGCCCGCAGTTACACCCGTGCCGGCTCGCCCATGCGCCGGCCGAGAAACACCGCCCCCGCGGCCTGCCCGTCAACA‑CCGGGGCCCCTATtgc > 2:76167/1‑137 (MQ=255) cAGATCCGCGACCGGGTCGTGGTCTGCCTGTGGGGGGTAGCAGCCGGCCCGCAGGTACTCCAGTGCCGGATAGCCCATGCGCCGGCCCATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGGTAATAA‑CCCGGGCCCGTAttgg > 2:301989/1‑134 (MQ=255) ccGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATggcggcgg < 1:76167/137‑1 (MQ=255) ccGGGTCGTGTTGTGGCTGTGGGGGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTGCGCCAGTGCCGGCTCGCCCGTGCGCCCGCCGAGCACCTCGGCCCCCTCCGCATCCAGTTGATCA‑CCCGGGCCCGTATTGGGGGGGCCGacg > 2:222986/1‑135 (MQ=255) ccGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAg < 2:89593/137‑1 (MQ=255) ccGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCGTATGGCGGCGGCCGAAg > 2:54806/1‑137 (MQ=255) gggTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGTTCGGCCTTGCGCAGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAggg < 5:298595/137‑1 (MQ=255) gggTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAggg < 5:239018/137‑1 (MQ=255) gggTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAggg < 1:222986/137‑1 (MQ=255) cGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAGGGGAac < 5:254352/137‑1 (MQ=255) cGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGATCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAGGGGAac < 3:166241/137‑1 (MQ=255) cGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGCTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAGGGGAac < 5:186267/137‑1 (MQ=255) | GTCGATACCGGACTGGCCGGGGGCTGGCTGGACTTTGCCTTCCTTGACGGCTTGGTACAGGGCCTTGCTCAACTGTGCCGTGTCTTCGAGCAGGTCACTGGCCCGTTGCAGATCCGCGACCGGGTCGTGTTCTGCCTGTGGGCGGTAGCAGCCGGCCAGCAGTTCCTCCAGTGCCGGATCGCCCTTGCGCCGGCCGATCAGCTCGGCCACCTCGGCATCCAGTTCATCA‑CCGGGGCCCTTATGGCGGCGGCCGAAGGGGAAC > ACB143/2127498‑2127759 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |