Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 3,047,193 | 0 | C | G | 23.9% | 126.6 / 13.1 | 67 | A125P (GCC→CCC) | CJ019_02862 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (19/32); new base G (16/0); total (35/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-06 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATCCAGGCCGTCGCGGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATGAAGCGACCTTGCAGCCATTGACGG > ACB143/3047062‑3047329 | aTCCAGGCCGTCGCGGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCt‑tttt > 6:228132/1‑137 (MQ=255) aGGCCGGCGCGGTACCAGTACAGTTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCCGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAg < 2:250885/137‑1 (MQ=255) gTCGCTGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTAc < 2:50994/137‑1 (MQ=255) gTCGCGGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTAc < 7:96692/137‑1 (MQ=255) tCGCGGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACg < 1:94566/137‑1 (MQ=255) cgGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGATCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCAc < 2:175534/137‑1 (MQ=255) cgGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGT‑TTTTGCAGGTTTCGCAc > 7:60931/1‑137 (MQ=255) cgGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCAc > 6:362839/1‑137 (MQ=255) ggTACCAGTACAGGTTGTTCTAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACg < 5:243186/137‑1 (MQ=255) ggTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGGATGTTACGCagc > 7:264434/1‑135 (MQ=255) ggTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACg < 7:91187/137‑1 (MQ=255) ggTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACg < 3:5207/137‑1 (MQ=255) gTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATAGGAGCGGCAGTAAAAGAACAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGTGTTTTGC‑CGTTAAGCACGAagtagt > 8:304277/1‑137 (MQ=255) gttgttATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGcc < 4:36068/137‑1 (MQ=255) tgttATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TTTTGTTGGTTAGGCACCCAGGAGTGCTGCCaa > 3:296488/1‑136 (MQ=255) tgttATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TTTTGGTGGTTTCGCACGAAGTAGTCATggcca > 1:158516/1‑133 (MQ=255) gttATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TTTTTGAGGTTTCGCCCGAAGTAGTGCTGCCaag > 5:193279/1‑135 (MQ=255) tataGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGcc < 5:345781/137‑1 (MQ=255) ataGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TATTTCAGGTTTCGCACGAACTAATCCTGCCAAGCCg > 5:254704/1‑137 (MQ=255) taGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCgg < 2:236699/137‑1 (MQ=255) aaGCCGAAGTCGTTCGCGCGATTTTCCGCTTTCAAGCTGAACCAGCAATCTGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCAGTGGCT‑TTTTTCAGGTTACGCACGAAGTAGTCGTGCCATGCCgg < 2:314410/136‑1 (MQ=255) aGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑GTTTTGAGGTTTAGCACGACGTAGTCCTGGCATGCCcgg > 5:41811/1‑137 (MQ=255) aGCCAAAGGCTTTCGCGCGTTTTACAGCGTTCCATCTTAACCATCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑GTTTTGAGGTTACGCACGGAGTTTTCCTGCCATGCCggg > 8:287715/1‑137 (MQ=255) gCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCG‑TTTTTCAGGGTGAGCCCCAAGTTGTCCTGCCATTCCgggg > 1:195111/1‑136 (MQ=255) aaGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGT‑TTTTGGAGGGTTCGCCCGCAGTTGTACTGCCATGGCgggggcag > 5:270310/1‑132 (MQ=255) aaGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGT‑TTTTGCAGGTTTCGCACGAAGTATTCCTGCCATGCCGGGCTCAg > 5:175694/1‑137 (MQ=255) aaGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAg > 5:251588/1‑137 (MQ=255) aaGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑GTTTGCAGGTTACGCCCGAAGTACTCCTGCCATGCCGGGCTCAg > 2:341526/1‑137 (MQ=255) aaGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCG‑TTTTGCAGGTTACGCCAGAAGTATTCCTGCCCTGCCGGGcggcg > 1:61014/1‑133 (MQ=255) gCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTtc < 8:157266/137‑1 (MQ=255) cTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGTCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGT‑TTTTGCAGGGTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGttgg > 4:138108/1‑135 (MQ=255) cTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCGGCCAAGCCGGGCGCAGTtcg > 5:87754/1‑137 (MQ=255) cTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGGAGGTTTCGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGttag > 3:128019/1‑135 (MQ=255) cTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTtcg > 8:355989/1‑137 (MQ=255) cTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCG‑TTTTTCAGGTTACGCCCGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTtcg > 7:218348/1‑137 (MQ=255) cgcgcgTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTtcgccgt < 1:81497/137‑1 (MQ=255) cgcgTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCCCGAAGTATTCCTTCCATGCCCGGCTCAGTtaggcgtcg > 7:221997/1‑137 (MQ=255) aCCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGtt < 5:362839/137‑1 (MQ=255) ccAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGgccagcc < 3:322840/137‑1 (MQ=255) cAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTTGAGGTTTAGCACGCATTATTGCTGCCATTCCGGGCTCATTTAGCCGTAGCCGGTTTTTggcagcca > 5:255928/1‑137 (MQ=255) agattAACCATCTATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCGATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCcac < 1:268213/134‑1 (MQ=255) aGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTGCTGCCATTCCGGGCGCAGTTCGCCGTCCCCGGTGTTTGCCAGCcac > 5:238233/1‑137 (MQ=255) aGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCcac < 5:92648/137‑1 (MQ=255) ccAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TTTTTGAGGTTAAGCACGAAGTATTACTGCCCTGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGGCACAGGCTgg > 7:297863/1‑136 (MQ=255) cAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATTCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGcc > 7:240476/1‑137 (MQ=255) cAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGcc > 6:66087/1‑137 (MQ=255) aGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCa < 6:251588/137‑1 (MQ=255) tCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGT‑TTTTTCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCCGCCACACGCTGCCAGGGAg > 8:29795/1‑137 (MQ=255) tCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAg > 7:268533/1‑137 (MQ=255) aGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGc < 8:268533/137‑1 (MQ=255) aGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGc < 3:178242/137‑1 (MQ=255) tAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCgg < 1:76/137‑1 (MQ=255) tAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TGTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCgg < 8:282428/137‑1 (MQ=255) aaaaGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCG‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTTCTATGAggg > 6:188358/1‑136 (MQ=255) aaaGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCt < 3:64044/137‑1 (MQ=255) aaaGACCAGTGGGTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCGCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCt < 3:196414/137‑1 (MQ=255) aaaGACCAGGGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCt < 8:264434/137‑1 (MQ=255) aaGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTg < 1:341526/137‑1 (MQ=255) gTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑GTTTTGAGGTTAAGCCCCAACTAGTACGGCCCTGCCCGGCGCACGTCGCCCGCGCCGCGGTTGGCCACCCCCAGGCGGCCAGGGAGGGTGCTATGCGGCTGGtcatct > 4:210466/1‑137 (MQ=255) ggttggtCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTAt > 7:236131/1‑137 (MQ=255) gttggtCCAGGTGCCCGGCCGTGGGG‑TTTTGCAGGTTACGCACGCAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTGGCCGTCGCCGGTGTTTGCCAGCCACCGGGTGGCAGGGGGGTTGGTATGCGGCTGGtgttctttt > 4:93148/1‑134 (MQ=255) gttggtCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATg < 6:41811/137‑1 (MQ=255) gttggtCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGGGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCGTGTATg > 7:205191/1‑137 (MQ=255) ttggtCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATGa < 1:315889/137‑1 (MQ=255) ccAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATGAAGCGa < 6:87754/137‑1 (MQ=255) aGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATGAAGCGAcc < 7:355989/137‑1 (MQ=255) ggCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATGAAGCGACCTTGCAGcc < 6:270310/137‑1 (MQ=255) cT‑TTTTGCAGGTTTCGCCCGCAGTAGTCCTGCCAAGCCGGGCTCAGTTCGCCCTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATGAAGCGCCCTTGCAGCCATTGACgg > 6:150311/1‑137 (MQ=255) | ATCCAGGCCGTCGCGGTACCAGTACAGGTTGTTATAGCCCAAGGCTTTCGCGCGTTTTACCGCGTTCCAGCTTAACCAGCAATCGGAGCGGCAGTAAAAGACCAGTGGTTGGTCCAGGTGCCCGGCCGTGGCT‑TTTTGCAGGTTACGCACGAAGTAGTCCTGCCATGCCGGGCTCAGTTCGCCGTCGCCGGTGTTGGCCAGCCACAGGCTGCCAGGGAGGTTGCTATGCGGCTGGTCTTCTATGAAGCGACCTTGCAGCCATTGACGG > ACB143/3047062‑3047329 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |