Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 2,641,826 | 0 | A | C | 29.7% | 121.3 / 11.6 | 74 | Q36P (CAG→CCG) | CJ019_02499 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (16/36); new base C (21/1); total (37/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.66e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
ATGTTGCGCCCCCCGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCATCCTCG > ACB143/2641690‑2641957 | aTGTTGCGCCCCCCGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCa < 4:110945/137‑1 (MQ=255) gTTGCGCCCCCCGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCccgcccgc > 7:16798/1‑137 (MQ=255) tGCGCCCCCCGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTACGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTc < 8:45491/137‑1 (MQ=255) ccccccGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCgcgc > 4:151302/1‑137 (MQ=255) ccccccGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCCCCAGCTCGAGc > 4:226543/1‑137 (MQ=255) ccccccGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCCCCAGCACgcgc > 3:340255/1‑137 (MQ=255) cccccGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCCCTCgcggt > 7:262154/1‑133 (MQ=255) cccccGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCt > 6:353302/1‑137 (MQ=255) gTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCGCGAGCGGGGCg > 5:333724/1‑137 (MQ=255) cGATTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATGAACTGATCGAGCCCGAGGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCTGGATAGCGGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGcc < 3:55744/137‑1 (MQ=255) cGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGcc < 5:43504/137‑1 (MQ=255) cGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGcc < 5:55922/137‑1 (MQ=255) cGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGcc < 6:316961/137‑1 (MQ=255) aaaTGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGCGGTGGGCGGGCCGGGCGACCgg > 6:203595/1‑136 (MQ=255) aTGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTAc < 5:97333/137‑1 (MQ=255) gcCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTCTTAGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCCCGCTGGGCGGTGCGGGAGACCGGAATTtgtgt > 8:17316/1‑137 (MQ=255) cccTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTtgtgtg > 4:288405/1‑137 (MQ=255) cccTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCCCCCCCTCGAGCTGGGCGGGCCGGTCGCCCGTACtttgtttg > 2:336128/1‑137 (MQ=255) cctgcctgGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGCGCTGGGCGTGCCGGTCGCCCGTACTTTGTGTgg > 5:115933/1‑137 (MQ=255) cctgcctgGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGACAGCCAGCGCTAGGCGTGGCGGGCGACCGTCCTTtggttgg > 4:208375/1‑132 (MQ=255) gTCCCTGTAGGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCctgc < 8:154136/137‑1 (MQ=255) ccTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGAGCGGGGCGTGGCGGGCGCCCGGACTTTGTGTGGCGGccgtgtgg > 5:282126/1‑131 (MQ=255) ccTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCtgctgc < 1:336128/137‑1 (MQ=255) ccTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCtgctgc < 3:175687/137‑1 (MQ=255) cTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCCCTCGCGCGGGGCGTGCCGGTCGACCCTAATTTTTTTTGCCGCCTCCTTcc > 8:144681/1‑137 (MQ=255) tGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGACAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCCCACGAGCGGGGGCGGCCGGGCCGCCGTCCTTTGTGTTGGGGCCCGCTGCCAGcac > 3:113148/1‑135 (MQ=255) tATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCGAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGcc < 2:84798/137‑1 (MQ=255) tATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGAGCAGGGCGTGCCGGTCGCCCCGACATTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGcc > 8:245062/1‑137 (MQ=255) tATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGcc < 7:306575/137‑1 (MQ=255) tATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCGCGCGCGGGGCGGGCCGGTCGACAGTTCTTTGTTTTGCGGCCAGCTGCCCGCGCAGcc > 7:72336/1‑137 (MQ=255) tCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGCGCTGGGCGTGGCGGTCGCCCGTTCTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCcgc > 4:290718/1‑137 (MQ=255) aaCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGGCGCCCGGACATTGTGTGGCGGCCTGCTGCCCGCTAAGCcgcgg > 2:310730/1‑136 (MQ=255) ccTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGGCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGtt < 8:263589/136‑1 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGCGCTGGGCGTGCCGGGCGCCCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCACCTCAGCcgcggt > 8:67786/1‑135 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCGCGCGCGGGGCGGGGCGGGGGCCCGTACGTTGTGTGGCGGCCGGCTGCCCGCGCCGCcgcggg > 3:308333/1‑135 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCATCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGGCGCGtt < 2:2022/137‑1 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGCGCTGGGGGTGCCGGGCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCGGCCAGGTCAGCcgcggg > 3:85687/1‑135 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGCCCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCcgcggt > 8:357314/1‑135 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGCCCGTACTTTGTGTGGCGGCCAGCTGCCAGCTCAGCCGCGtt > 6:181355/1‑137 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTTTGTTGCGGCCTGCTGCCCGCTCAGCCCCGtt > 6:156705/1‑137 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGtt < 4:80606/137‑1 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCCCCCGCGCGAGCTGGGCGGGCCGGGCGCGCGTACGTTGTGTGGCGGCCTGGGGGCAGCTCAGACCCGtg > 3:255722/1‑136 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCCCCCCCGCGAGCGGGGCGGGGCGGGCGCCCGGACGTTGTGTGGCGGGCGGGTGCCAGCGCAGCcgcggt > 3:352294/1‑135 (MQ=255) aCTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTGCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGCCCGTGCTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCCGCCGCGtt > 8:374420/1‑137 (MQ=255) tGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGCGCGGGGGGTGGCGGGGGGCCCGGCTTTGTTTGGCGGCCTGCGGCCCGCGCAGCCGCGGTgg > 4:127804/1‑137 (MQ=255) gAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGCGCTGGGCGGGGCGGTCGGCCGTTCTTTGTGTGGCGGCCTGCGGGCAGCTCAGCCGCGTTGGGCggg > 3:210744/1‑137 (MQ=255) gAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGCGCGGGGCGTGCCGGGGGGCCGGACGTTGTGTGGGGGGCTGCGGCCCGCTGCGCCGCGGTggggggg > 3:96348/1‑132 (MQ=255) gAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCGCGGGCGGGGGGTGGGGGTGGTGCGTACTTTGTGTGGGGGCCTGGTGCCAGCTCAGCCCCGGTggggggg > 1:298264/1‑132 (MQ=255) gAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCGCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGCCCGTACGTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCCGCGCCGCCGCGTTGGTCggg > 6:388138/1‑137 (MQ=255) gAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCCCGCGCGCTGGGCGTGCCGGGCGACCGGACGTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCCGCGCAGCCGCGGTGGTgggg > 7:360578/1‑137 (MQ=255) gAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGCCCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGGTGGTCggg > 8:284975/1‑137 (MQ=255) cTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGGCGCCCGGACTTTGTGTGGCGGCCTGCAGCCCGCGCAGCCGCGTTGGGCGGGGGTGCCGcgctcgct > 7:383047/1‑135 (MQ=255) tCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGAt < 3:329866/137‑1 (MQ=255) tCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGAt < 7:144681/137‑1 (MQ=255) cGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCCCCGCCCGCTGGGGGGGGCGGGGGGCCGGACTTTGTGTGGGGGGCGGCTGCCCGCGCAGCCCCGGGGGGCGGGGGGGGCGCGCTCGCTCTAACGCGCTg > 4:351609/1‑137 (MQ=255) gCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATgg < 1:1717/137‑1 (MQ=255) gCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATgg < 4:309087/137‑1 (MQ=255) gCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGGGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATgg < 4:324372/137‑1 (MQ=255) ccTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGt < 5:156705/137‑1 (MQ=255) ccAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGcc < 6:150675/137‑1 (MQ=255) ccAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGcc < 5:108277/137‑1 (MQ=255) ccAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGcc < 4:217158/137‑1 (MQ=255) ccAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCGGGGCGGGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGcc < 5:238958/137‑1 (MQ=255) aaaGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTtgt < 2:298264/137‑1 (MQ=255) aaaGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTtgt < 4:163713/137‑1 (MQ=255) aaaGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTtgt < 6:333724/137‑1 (MQ=255) aGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGa < 4:31956/137‑1 (MQ=255) aCCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTgtgccgt < 5:231910/137‑1 (MQ=255) cccGTGGCCCGCCATCTCGTGGTGGGGGTGCCGGTCGACCGTTATTTGTGTGGCGGCCTGGGGCCAGCGCAGGCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTgtgccgtgc < 1:182807/135‑1 (MQ=255) gTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCAt < 3:13008/137‑1 (MQ=255) gTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCAt < 1:310730/137‑1 (MQ=255) gTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGGGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCAt < 5:211149/137‑1 (MQ=255) ggCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCATcc < 4:255722/137‑1 (MQ=255) ggCCCGCCAGCGCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCATcc < 7:67786/137‑1 (MQ=255) cgCCCGCACGCACGAGCGGGTCGTGCCTGGCCCCCGAACATGGTGGCGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTGGGGCGGGGGTGCCGCGATCGATCAACCGCGATGGTCGCCTTGTTGCGCGGAGCCGTGCCATcc < 8:141896/136‑1 (MQ=255) ccGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCATCCTCg < 8:360578/137‑1 (MQ=255) | ATGTTGCGCCCCCCGTTTCGAGTGCTCCAAATGCCGCGCCCTGCCTGGTCCCTGTATGCCTATCAACTGATCGAGCCCGACGAGCAGCTCGACCTGTTCGCCTGCCAGGAAAGCCGCGTCCACCTCGTGGCCCGCCAGCTCGAGCTGGGCGTGCCGGTCGACCGTACTTTGTGTGGCGGCCTGCTGCCAGCTCAGCCGCGTTGGTCGGGGGTGCCGCGATCGATCTACCGCGATGGTCGCCTTTGTGAGCTGTGCCGTGCCATCCTCG > ACB143/2641690‑2641957 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |