Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | ACB143 | 5,206,107 | 0 | C | A | 25.3% | 165.8 / 12.8 | 83 | A308A (GCG→GCT) | metC | Cystathionine beta‑lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (22/40); new base A (21/0); total (43/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.82e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCTCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCCACCTGCAGGGCATTGGCGC > ACB143/5205972‑5206243 | gCTCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTAATTTAATCg > 5:66911/1‑137 (MQ=255) tCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGTCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGcc < 5:204129/137‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCGTTTTACTTTCATCGcc > 3:280579/1‑137 (MQ=255) tCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCGGTTTACTTTCATAGcc > 1:92102/1‑137 (MQ=255) tCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGcc > 6:277132/1‑137 (MQ=255) tCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGcc > 8:362424/1‑137 (MQ=255) aGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGccac < 7:132318/137‑1 (MQ=255) gAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCCCCCCTCCCAGCGAGTCGTCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCCGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTGGCCGTGTAGATTAAACGCcaccac > 1:354758/1‑137 (MQ=255) aGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTAATTTCATCGCCaccacc > 2:6500/1‑137 (MQ=255) gCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCAccg < 7:297151/137‑1 (MQ=255) gTGCGACATGCTCGATGAGTGTTTGTTCATTCTCTCAAACCCGCCCAGCGAGTCGGACAGCAAAAAAATCTGCAGCGCCTACACCTGTCGGTTGATCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGACACCAcagccc < 6:101041/137‑1 (MQ=255) gTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATAGCCACCAccgccc > 2:261533/1‑137 (MQ=255) cGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCAccgccccgc > 4:252992/1‑137 (MQ=255) aCATGCTCCAGGAGTGGTTGATCTTGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCa < 7:167646/137‑1 (MQ=255) aCATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCa < 1:48232/137‑1 (MQ=255) aCATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCa < 3:323309/137‑1 (MQ=255) ccAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCa < 6:126640/137‑1 (MQ=255) aGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCCCCACAGCGCATc > 2:72829/1‑137 (MQ=255) ggAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCt < 6:15532/137‑1 (MQ=255) tGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTAATTTAATAGCCCCCCCCGCCCCCCCCCTGCGCCTCTGGCg > 2:174156/1‑137 (MQ=255) ggTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGt < 8:269267/137‑1 (MQ=255) gTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGtt < 2:19670/137‑1 (MQ=255) tGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTg < 7:122013/137‑1 (MQ=255) tGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTg < 5:359665/137‑1 (MQ=255) tGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTg < 8:180452/137‑1 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGTCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTAATTTGATAGCCACCCACCCCCCCCCCCAGCGCCTATGGCgggttg > 1:279537/1‑132 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCTCCATTTACTATCATAGCCACCACCCCCCCGCCCAAGCGCAACAGGGGTTTgg > 2:314628/1‑136 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCGTTTTACTTTAATAGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCCTCTGGCGTTTgg > 3:158980/1‑136 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTTCTTTAAAAGCCACCACCGCCCCCCCACCGCGCAACAGGCGGTTGc > 7:98512/1‑137 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTAGTTTCATCGCCACCCCCGCCCCCCCACTGCGCATATGGGGTTTgg > 4:20036/1‑136 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGc > 8:353848/1‑137 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATAGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGc > 5:133189/1‑137 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTAATTTAATCGCCCCCACCCCCCCCCCACAGCGCAACTGGCGgtttg > 5:319402/1‑135 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTTCTTTCAAAGCCACCACCCCCCCGCCACAGCGCATCTGGCGTTTgg > 7:153387/1‑136 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTTATTTCATAGCCACCACCCCCCCGCCACGGCCGATCTGGCGGTTgg > 2:294865/1‑136 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTACTTTCATCGCCCCCACCCCCCCGCCACTGCGCAACTGGCGTTTGc > 2:232617/1‑137 (MQ=255) gATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTAATTTCATAGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGCCGTTTGc > 5:139398/1‑137 (MQ=255) tGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACAGCGCATCTGGCGTTTGCACAGt > 4:135244/1‑137 (MQ=255) tcCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCGTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCAtt > 5:252981/1‑136 (MQ=255) aCCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCCCTGCGCCTCTGGCGGTTGCACAGTTGAtgggg > 5:94063/1‑134 (MQ=255) cccGCCCAGCGAGTCGTCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCCCCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTTCTTTCATCGACACCACCGCCCCGCCACAGCGCATCTGGCGTTTGCCAAGTTGCTGCTGCg > 5:263440/1‑137 (MQ=255) cccGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCg > 3:174022/1‑137 (MQ=255) cccGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTAATAGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATATGGCGTTTGCCAAGTTCATGCTGCg > 8:467/1‑137 (MQ=255) cGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCggg < 2:160875/137‑1 (MQ=255) cccAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTTATTTCATAGCCACCACCGCCCCCCCACAGCGCATCTGGCGGTTGCACAGTTGATGCTGCGGGTg > 5:336988/1‑137 (MQ=255) ccAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTgg > 4:126726/1‑137 (MQ=255) ccAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTAATTTGATAGCCACCACCGCCCCGCCACAGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTGATGCTGCGGGTgg > 3:168342/1‑137 (MQ=255) aGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCt < 1:283838/137‑1 (MQ=255) gCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTTATTTAATAGCCCCCACCGCCCCGCCCCTGCGCATCTGGCGTTTGGACAGTTGATTCTGCGGGTggggt > 3:286351/1‑134 (MQ=255) gAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTAGTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTGATGCTGCGGGGGGCtttg > 6:333709/1‑136 (MQ=255) gTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCa < 7:194217/137‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCa < 7:362424/137‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCa < 1:314628/137‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCa < 1:302606/137‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTTCTTTAATAGCCACCACCGCCCCGCCCCTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTACTGCTGCGGGTGGCTTTGCa > 4:266052/1‑137 (MQ=255) tCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAg < 4:174022/137‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATAGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATATGGCCTTTGCACAGTTCATGAAGCGGGTGGCTTTcccg > 8:282355/1‑135 (MQ=255) cGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGc < 4:71348/137‑1 (MQ=255) ggCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGcc < 4:28372/137‑1 (MQ=255) cAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATAGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCCTCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGccccc > 5:345034/1‑136 (MQ=255) aaaaaTCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAAt < 1:174156/137‑1 (MQ=255) aaaaaTCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAAt < 3:219498/137‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCt < 6:68348/137‑1 (MQ=255) cTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGAGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCt < 1:80838/137‑1 (MQ=255) gcgcCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTAATTTCATAGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATATGGCGTTTGCACAGTTCATTCTGCGGGTGGCTTTACAGCCCCGGGTAAAACACCTGCTCg > 7:101008/1‑137 (MQ=255) cTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCt < 7:353848/137‑1 (MQ=255) ccaccaGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCGGTTTTATTTGATAGCCACCACCCCCCCGCCCCCGCGCCTCTGGGGTTTTCACAGTTAATTCTGCGGGTGGCGTTGCAGCCCCGGGGTATACACCTGCTCGAccagg > 6:46130/1‑134 (MQ=255) accaGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTgcgc < 1:232617/137‑1 (MQ=255) accaGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTgcgc < 1:336540/137‑1 (MQ=255) accaGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTgcgc < 3:252992/137‑1 (MQ=255) caGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGt < 8:153387/137‑1 (MQ=255) cGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCGTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGAcc > 3:309471/1‑137 (MQ=255) gTTGAGCGCGGCGCGGTCGCGTTTTAAATTAATAGCCCCCACCGCCCCCCCACTGCCCCTCTGGCGTTTTCCCACGTGATGCTGCGGGTGGCTTTACAGCCCCGGGTAATACACCAGCTCGACCAGCGCGGGAccgg > 2:158268/1‑135 (MQ=255) gAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCa > 7:26231/1‑137 (MQ=255) gcggcgcggTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGaa < 4:158980/137‑1 (MQ=255) gcgcggTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAgcg < 6:168723/137‑1 (MQ=255) cgcggTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAgcgc < 7:467/137‑1 (MQ=255) cgcggTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAgcgc < 6:336988/137‑1 (MQ=255) ggTCGCGTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGGGTTCCAGCCCCGGGGAATAAACCTGCTCGCCCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGcc > 3:66686/1‑137 (MQ=255) tACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCCACCTGCAggg < 4:165695/137‑1 (MQ=255) cTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCTCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCCACCTGCAGGGCa < 3:313628/137‑1 (MQ=255) cTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCCACCTGCAGGGCa < 1:301767/137‑1 (MQ=255) tCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCCACCTGCAGGGCATTg < 1:104450/137‑1 (MQ=255) cGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCCACCTGCAGGGCATTGgcgc > 6:71889/1‑137 (MQ=255) cGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCAACCTGCATGGCATTGgctg > 8:343557/1‑135 (MQ=255) | GCTCAGCGAGCAGTGCGACATGCTCCAGGAGTGGTTGATCATGCTCTCCACCCCGCCCAGCGAGTCGGCCAGCACAAAAATCTGCAGCGCCTCCACCAGGCGGTTGAGCGCGGCGCGGTCGCCTTTTACTTTCATCGCCACCACCGCCCCGCCACTGCGCATCTGGCGTTTGCACAGTTCATGCTGCGGGTGGCTTTCCAGCCCCGGGTAATACACCTGCTCGACCTGCGCGTGACCTTCCAGGAAGCGCGCCACCTGCAGGGCATTGGCGC > ACB143/5205972‑5206243 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |