| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | ACB143 | 445,359 | A→G | 73.8% | H76R (CAC→CGC) | argD_1 → | Acetylornithine aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | ACB143 | 445,359 | 0 | A | G | 73.8% | 149.4 / 52.1 | 81 | H76R (CAC→CGC) | argD_1 | Acetylornithine aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/9); new base G (30/29); total (42/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.00e-01 | |||||||||||
CCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGTGACCAGGCC > ACB143/445226‑445492 | ccTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACCGCTTGGGCca > 2:299744/1‑134 (MQ=255)ccTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCca > 2:30246/1‑134 (MQ=255)ccTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCca > 3:186993/1‑134 (MQ=255)ccTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCca > 5:350574/1‑134 (MQ=255)ccTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCca > 3:252618/1‑134 (MQ=255)ccTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGAGGTCAACAGCTTGGGCca > 1:327029/1‑134 (MQ=255) aGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGcc < 3:391638/135‑1 (MQ=255) aGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGcc < 1:328079/135‑1 (MQ=255) ccTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGc < 5:10785/136‑1 (MQ=255) aTGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGc > 8:173411/1‑136 (MQ=255) gCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGCCAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTg > 6:24906/1‑136 (MQ=255) ccGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAACGc > 5:171527/1‑136 (MQ=255) aaCGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGtt < 4:110354/136‑1 (MQ=255) aCGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTg > 4:39540/1‑136 (MQ=255) gTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTggg < 3:39540/136‑1 (MQ=255) gTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTggg > 1:190048/1‑136 (MQ=255) tGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGGGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGc < 1:81933/136‑1 (MQ=255) gcgcAGGTATTCGTGCGTGGCTAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAAcc < 8:264870/136‑1 (MQ=255) gcgcAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGATGGTCAAAGCGTTGGGCAAc > 1:252675/1‑135 (MQ=255) gcAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAg < 5:163496/136‑1 (MQ=255) tCGTGCGTGGCCATGGTTCGTGGGTGTGGGTCAACGTAGGTCAGGCCTACCTGGTCTTCACTCAGGGCGGTGCTGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAgg < 5:294537/135‑1 (MQ=255) gcgtgGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGtt > 2:90436/1‑135 (MQ=255) gcgtgGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGtt > 1:10671/1‑135 (MQ=255) ccgtgGCAAGGCATCTTGTTTGTGGAACAACGAAGGCCATGCAAACATGTACTTCACACAGGCCGGTGCGGTCAACAGCTTGGACCGCAGACCCAGCGTCCGTGTCAAACCGTTGGGCAACCAGGCTAAgccttt > 8:344777/2‑130 (MQ=255) cgtgGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTg < 5:397543/135‑1 (MQ=255) ggCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATc > 5:305328/1‑135 (MQ=255) ccAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAAc > 2:342969/1‑136 (MQ=255) ccAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAAc > 5:164373/1‑136 (MQ=255) ccAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAAc > 7:386122/1‑136 (MQ=255) ggCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCcgg < 5:127610/136‑1 (MQ=255) tCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCcgggct > 8:207591/1‑136 (MQ=255) gTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTTGTCAACCAGTCTCAGGCGTTGATCAACCcgggctc < 8:73584/135‑1 (MQ=255) gTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCcgggctcg < 3:118634/136‑1 (MQ=255) ggTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCcgggctcggg > 6:40575/1‑136 (MQ=255) gTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCcgggctcgggc < 5:206468/136‑1 (MQ=255) gtgGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCtt < 8:6544/135‑1 (MQ=255) gtgGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACGCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCtt < 2:352335/135‑1 (MQ=255) gACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCcaca < 8:256922/136‑1 (MQ=255) gACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCcaca < 2:209040/136‑1 (MQ=255) cGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGt < 4:243409/136‑1 (MQ=255) aaGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGAGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCCTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACCACCGtcg > 2:145284/1‑134 (MQ=255) aGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGc > 1:105069/1‑136 (MQ=255) gggCCTGCCTACCTGGACGTCACTCAGGGCGGTGAGGTCAACATCGTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCGGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGGTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCt < 1:164602/136‑1 (MQ=255) gggCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCt < 7:293883/136‑1 (MQ=255) aTGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCt > 7:121245/1‑136 (MQ=255) aTGCCTACATGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAAAAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTTCTGGTCAAAGCTTTGGGCAACCAGGCTCAGGAGTTGATCAACCCGCGCTAGGGCTTCCAAAACCTTgaattg > 6:99748/1‑129 (MQ=255) tGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTg < 1:19746/136‑1 (MQ=255) ccTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTggg > 6:99971/1‑136 (MQ=255) tACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACACCCGTGGCTTGCTGGGGc > 6:151500/1‑136 (MQ=255) tACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGc > 7:250744/1‑136 (MQ=255) ccTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCt < 1:348920/135‑1 (MQ=255) ggACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGt > 1:177619/1‑135 (MQ=255) ggACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGt > 5:311831/1‑135 (MQ=255) ggACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGt > 7:249163/1‑135 (MQ=255) cTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAAc < 1:30246/136‑1 (MQ=255) tCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCg > 5:284944/1‑136 (MQ=255) tCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCg > 6:252082/1‑136 (MQ=255) aCTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCgg < 2:18452/135‑1 (MQ=255) aCTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGc > 6:59281/1‑136 (MQ=255) tCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCACCCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCtg > 4:58177/1‑136 (MQ=255) tCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCtg > 3:221301/1‑136 (MQ=255) tCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCCTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCGACAACCGTGGCTTGCTGTGGCTGGTAAACCGGCtg > 7:300049/1‑136 (MQ=255) tCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCCACCGGCtg > 2:290831/1‑136 (MQ=255) agtgcggtgctgtCAACATCTTGGGCCGCATCTACAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGTCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCtgt < 3:238929/132‑1 (MQ=255) gggCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTgtgt < 2:77744/136‑1 (MQ=255) ggCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTgtgt > 7:252814/1‑135 (MQ=255) gcggtgcggtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTgtgt > 6:95643/1‑134 (MQ=255) ggtgcggtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCa > 5:305113/1‑134 (MQ=255) gtgcggtCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCagag < 7:766/136‑1 (MQ=255) cggtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTAc > 1:231299/1‑136 (MQ=255) cggtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTAc > 1:322417/1‑136 (MQ=255) ggtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTAcc > 8:248423/1‑136 (MQ=255) ggtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTAcc < 3:359948/136‑1 (MQ=255) ggtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTAcc > 8:154332/1‑136 (MQ=255) gtCTACAGCTTGGGCCTCAGGCCGAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAAGCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCTACCGGCTGTGTCAGAGTACCg < 4:406459/136‑1 (MQ=255) gtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCg < 6:305328/136‑1 (MQ=255) gtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCg < 8:262704/136‑1 (MQ=255) gtCAACAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCg < 4:25198/136‑1 (MQ=255) aCAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCACCCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAg > 7:163804/1‑136 (MQ=255) aCAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAg < 6:91605/136‑1 (MQ=255) aCAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAg < 8:45099/136‑1 (MQ=255) cAGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGt < 5:131596/136‑1 (MQ=255) cAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGt < 1:244868/136‑1 (MQ=255) aGCTTGGGCCGCAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGTg < 4:141170/136‑1 (MQ=255) ggCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGTGACCAgg < 8:356030/136‑1 (MQ=255) ccACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGTGACCAGGcc > 7:367768/1‑136 (MQ=255) ccACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGTGACCAGGcc > 3:272021/1‑136 (MQ=255) | CCTGAGCGCCTGATGCCCGGCACCGAACGTGCAGCGCAGGTATTCGTGCGTGGCCAGGGCTCGTGGTTGTGGGACAACGAAGGGCATGCCTACCTGGACTTCACTCAGGGCGGTGCGGTCAACAGCTTGGGCCACAGCCCCAGCGTGCTGGTCAAAGCGTTGGGCAACCAGGCTCAGGCGTTGATCAACCCGGGCTCGGGCTTCCACAACCGTGGCTTGCTGGGGCTGGTCAACCGGCTGTGTCAGAGTACCGGCAGTGACCAGGCC > ACB143/445226‑445492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |