| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | ACB143 | = 3376605 | 52 (0.880) | 293 (4.950) | 81/240 | NT | 86.6% | coding (501/546 nt) | CJ019_03184 | hypothetical protein |
| ? | ACB143 | = 4850748 | 39 (0.660) | coding (435/489 nt) | CJ019_04550 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
AACCTTCCTCAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > ACB143/3376471‑3376605‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTGCGCCGATG < ACB143/4850748‑4850615 CTTCCTCAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTT > 7:193745/1‑136 TTCCTCAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTATGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTG > 4:383145/1‑136 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ATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCA < 3:125361/135‑1 ATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCA < 6:286658/135‑1 ATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCA < 2:37695/135‑1 TTTGCCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCCGTAC > 8:176606/1‑136 CCTTATCTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCT < 4:334298/136‑1 CTTATCTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTG > 3:184075/1‑136 CTTATCTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTG > 7:11402/1‑136 CTCGGCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAG > 1:383530/1‑123 GCATGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTG < 1:59532/136‑1 TGACCCCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTGCGC < 1:95929/136‑1 CCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTGCGCCGATG > 5:155621/1‑136 CCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTGCGCCGATG > 3:273361/1‑136 CCTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTGCGCCGATG > 3:59562/1‑136 CTTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTGCGCCGATG > 2:53654/1‑135 AACCTTCCTCAATGGATGGCTGAAGCGATTGGGCGCGAAGCAGTCTTTGCTGAGCAGGGCTTCTAATCTACTCGTTTAAATACAATAGCTTAGAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATGACCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > ACB143/3376471‑3376605‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTTTGTGTTTGGTGTGGGGTTGTTCTTGAGTGCGGGTTTACTTGCTTTAGTGTGACGGCAGGGAGTTGGGTCAGAGCGAGCGCAAAATCAGCATGCCTGCTAACAGCAGTACCCCTGTAGAGATTGCGCCGATG < ACB143/4850748‑4850615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |