| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | ACB143 | 3359593 = | 47 (0.780) | 107 (1.780) | 51/262 | 0.0 | 69.0% | intergenic (+219/‑151) | pikAII_1/CJ019_03160 | Narbonolide/10‑deoxymethynolide synthase PikA2,modules 3 and 4/Tn3 family transposase ISPa42 |
| ? | ACB143 | 4755885 = | 49 (0.820) | coding (684/1659 nt) | yojI | ABC transporter ATP‑binding/permease proteinYojI | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < ACB143/3359723‑3359593‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCGCTGTGGCCCACAGGCGACAAGAGC > ACB143/4755885‑4756014 GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAATCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACTAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTT < 8:222521/136‑1GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTT > 6:249565/1‑136GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTT < 1:73438/136‑1GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTT < 8:16172/136‑1GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTT < 4:372136/136‑1GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTT < 7:317362/136‑1GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATAAATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTT < 6:331144/136‑1 GCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTG < 3:152512/136‑1 CAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGC > 8:156954/1‑136 CAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGC > 5:333577/1‑136 AAAAGCATCAGCATAGACTGCTAGGCAGACGGTGGATGAGCAGCAAGACACGTACTATAGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATATCCCCTATTTGCG < 4:46936/136‑1 AAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTTCTAATTTTTTAATTATATCGGCATAACCCCTATTTGCGC < 2:311703/136‑1 AAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGC < 8:331365/136‑1 AAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGC > 3:351536/1‑136 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GAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCA > 8:317921/1‑135 GAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGAGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCTCCGTGGCCCTGGCCAT > 8:118762/1‑136 ATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGC < 3:219600/136‑1 ATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGC < 7:312497/136‑1 TCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGT > 1:231821/1‑136 CTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCG < 6:61503/136‑1 ATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACTCTCGATCACCCCCTTCGTAATCGCCAAGCCCCTGGGCTCGATGCGGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCCGTCGCTG > 6:15063/1‑136 ATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCGCTG > 3:43653/1‑136 TTTGCCTTATCTCGCCATAAGCAGTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCTATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGTCCATGCAGTCGCTGTG < 2:311801/135‑1 TGCCTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCGCTGTGGC < 2:48697/135‑1 CTTATCTCGGCATAACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCAAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCACTGGCCATGCAGTCGCTGTGGCCCA > 8:145381/1‑135 CTTATCTCGGCATAACCCCTAAATGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCGCTGTGGCCCA > 7:195304/1‑135 AACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCGCTGTGGCCCACAGGCGACAAGAGC < 1:184264/136‑1 AACCCCTATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCGCTGTGGCCCACAGGCGACAAGAGC > 5:236261/1‑136 GGCAAAAGCATCAGCATAGACGGCTAGCCAGACGGTGGATGACCAGCAAGCCACGGCCTCTCGAATAACCTTTTAAATCATATATTTACAGAACGAATGTCCTAATTTTTGCCTTATCTCGGCATAACCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < ACB143/3359723‑3359593‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTTGCGCCACCCAGGTACGCTCGATCAACACCTTCGTAATCGCCAAGACCCTGGGCTCGATGCTGTTCTTCGTGGTCATCGCCGTGGCCCTGGCCATGCAGTCGCTGTGGCCCACAGGCGACAAGAGC > ACB143/4755885‑4756014 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |