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acacCAACGCAG‑CAGGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCCGGTGGCTGCCGGCTAGAATTGCACGGTCTGGCAGCTGCCACCGTTGCTATTTGGCCCCCTGCTGAAcac > 1:1276012/1‑147 (MQ=255) acCAACGCAG‑CAGGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTa < 1:396834/101‑1 (MQ=255) acCAACGCAG‑CAGGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTa > 2:396834/1‑101 (MQ=255) acCAACGCAG‑CAGGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCGCTCTGCTAAACCAGa > 1:442093/1‑149 (MQ=255) ccAACGCAG‑CAGGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGaa > 1:952147/1‑149 (MQ=255) cAAAGCAG‑CAGGTCAGGTTTTCCACGCCGTTCTTCCGCGTTAGAAGGAGGGTGACTGGCCGGAGGGACAAAAGCTTGGTGGCTTGATGTGATAAGTGCACGGTGTGGCAGTAGCCGCAATTGCTATCTGGCACTATCATAAAcccaaaa > 2:574927/1‑144 (MQ=255) ag‑cagGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACcgcg < 1:1213575/149‑1 (MQ=255) ag‑cagGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACcgcg < 2:186152/149‑1 (MQ=255) g‑cagGTCAGGTTTTCCACGACGACATTCCGCGTTCTATGGCGGGTGTCCTGATCACGTGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGGTCGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACcgcgc < 2:1390682/149‑1 (MQ=255) gggcaggtTTTCCACGACGACATTCCGCGTTAGATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAGAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGaa < 1:383723/146‑1 (MQ=255) gtcaggtTTTCCTCGACGACATTCCGCGTTATGTGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAGCCGCGCGaaa < 2:737345/149‑1 (MQ=255) tcaggtTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGGAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACGCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAg > 1:660954/1‑149 (MQ=255) ggtTTTCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTgg > 1:328020/1‑149 (MQ=255) ttttCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGc > 2:795306/1‑149 (MQ=255) tttCCACGACGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCg > 2:616214/1‑149 (MQ=255) ccACGACGACCTTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGta < 2:270048/149‑1 (MQ=255) | CTTACCAGAACCCGGTAGTTGCGTTTGGCATTTACGGTTTCATCGAACGTTGCCTGGTACCGTTTGGTCTGCAC‑CACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAG‑CAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTA > CP009273/1153884‑1154171 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |