New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3245381 | 78 (0.960) | 5 (0.070) | 5/280 | 11.3 | 6.2% | intergenic (+12/‑282) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
? | CP009273 | = 3245385 | 77 (1.000) | intergenic (+16/‑278) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
ACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTT > CP009273/3245238‑3245533 | aCAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGa < 1:1019998/149‑1 (MQ=255) gTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAgg > 2:529571/1‑148 (MQ=255) cGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGa < 1:1317571/149‑1 (MQ=255) aTCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGAt < 2:1171570/148‑1 (MQ=255) cATATCCGTAATCATTACGTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAAt < 1:438718/149‑1 (MQ=255) tctCCGTAATCATTACTTCCGCCGCCCTAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAAtt < 2:828368/146‑1 (MQ=255) tatCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTa < 1:534016/149‑1 (MQ=255) tccttACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGc < 1:620856/146‑1 (MQ=255) aTTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAt > 1:1259757/1‑149 (MQ=255) tcactctcGCAGCCATAAGACCATCCACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAt < 2:1196838/141‑1 (MQ=255) cTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGACCCGCATGGACGAGGTGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGGGCCTCTGATAATTACCTAAGTGCAcgttg > 1:668264/1‑149 (MQ=255) ttCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTGGCTAAGTGCAtgttgt > 1:189813/1‑149 (MQ=255) ttCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGAGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAtgttg > 2:1079353/1‑148 (MQ=255) ttCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATACCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCAtgttg > 2:824766/1‑148 (MQ=255) gccgaagcactAAGATCACCTACCCTACGGGGGTTCTTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATgttgtt < 1:28794/139‑1 (MQ=255) gCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTTAAAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTc > 2:831761/1‑148 (MQ=255) gCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGt < 2:1114781/148‑1 (MQ=255) ccATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGGCGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCg > 1:1027985/1‑149 (MQ=255) atacggccATCAACCCTCCGGGGATTATTTCACTTGGCCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCAGGTACGGGATGTTTGAAACGGAT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCgg < 2:1221585/142‑1 (MQ=255) aTAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGGTGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCAACTTACGACGGGCCACTGATAAGTAGCTAAGTGCATGTTGATCATGGCgg > 2:658655/1‑148 (MQ=255) tAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGGGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATATCGAAt > 1:371085/1‑149 (MQ=255) gACCATCCACCCGACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGAtgtg < 1:199583/149‑1 (MQ=255) aCCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTgg < 1:1182964/149‑1 (MQ=255) aTCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCAt > 1:70943/1‑149 (MQ=255) aTCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCAt > 1:70847/1‑149 (MQ=255) tCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCAt > 2:1153865/1‑148 (MQ=255) aaCCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGaa < 1:768121/149‑1 (MQ=255) ccTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGc > 1:906524/1‑149 (MQ=255) cTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGcc > 1:148808/1‑149 (MQ=255) tACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCt > 1:1304450/1‑149 (MQ=255) ggggATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTAt < 1:686634/149‑1 (MQ=255) ggggTTCTTTCAATTGGGCCGGGGTCGGCTTTCGATGACCCGCATGTACGAGATGTTCGCTTCCGTC‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCTTCTGATAATTAGCTAAGTGCATTTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTAt < 2:368480/148‑1 (MQ=255) gggATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGGCTTATc > 1:334039/1‑149 (MQ=255) ttattTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGAc < 1:925155/149‑1 (MQ=255) ttattTCAATTGGCCCGTGCCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGAc < 1:705178/149‑1 (MQ=255) tgattTCAATTGTTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTCCGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGa < 2:993219/146‑1 (MQ=255) aTTGGTCCGTGGCAGGCTCTCGATGAACCGCATTGACGAGCTGTTCGCTCCCGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACaaaa < 1:1198638/149‑1 (MQ=255) ttGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACaaaa > 2:1077283/1‑148 (MQ=255) ggTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTCCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCACGAACGCCTTATCTGACATACAAAACa < 2:644676/148‑1 (MQ=255) gTCCGTGGCAGGCTCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTCCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACAtt < 1:120445/149‑1 (MQ=255) tCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTg > 1:357634/1‑149 (MQ=255) tCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGGT‑GAAAAAAAGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTg > 1:1284697/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGt < 1:488553/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGt < 1:567042/149‑1 (MQ=255) cGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTa < 1:1202511/149‑1 (MQ=255) gCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACAtt < 1:892349/149‑1 (MQ=255) aGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTc < 2:172988/148‑1 (MQ=255) ggATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTGCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCaa < 1:654761/149‑1 (MQ=255) tcGATGAACCGCATGGACGAGATGTGCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAGAACATTGTACATTCAATAGAt > 1:685942/1‑149 (MQ=255) cGATGAACCGCATTGACGAGTTGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGAt < 2:1124182/148‑1 (MQ=255) aaCCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATa < 1:1119310/149‑1 (MQ=255) gagaTGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGCTTGCATAACCCGAGCGGa > 2:1180030/1‑148 (MQ=255) gaTGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGAcc < 2:1159294/148‑1 (MQ=255) gaTGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGAcc > 2:639417/1‑148 (MQ=255) gggtggcgttCGTTT‑AAAAAAAGGCACGTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCa < 2:1063753/140‑1 (MQ=255) aggTTCGCTTGCGTT‑AAAAAAAGGCCCCTGACGAGGGGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGCCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCa < 2:904601/146‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCTCGGTC‑AAAAAAAGGCCCCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCa < 2:895495/148‑1 (MQ=255) ttCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGAt > 2:295751/1‑148 (MQ=255) ttCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTAACTCTTATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGAt > 2:1208923/1‑148 (MQ=255) cTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGGTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCGTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGc > 2:1056917/1‑148 (MQ=255) cTTCCGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCg < 1:588657/149‑1 (MQ=255) ttCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCg > 2:468231/1‑148 (MQ=255) ggttaaaaaaaaGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAg < 1:915911/144‑1 (MQ=255) ggTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGCTCATATCGGACGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCCGATAAGCGTAg > 2:507851/1‑148 (MQ=255) gTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAgc < 2:615170/148‑1 (MQ=255) gTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGAATGAACGCCTTATATGAAATACAAAACATTGTACATTACATAGATTGCATAACCCGCACAGAccgtataggctgagc > 2:248078/1‑135 (MQ=255) aaaaaaaGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCAt > 1:1208328/1‑149 (MQ=255) aaaaaaGGCACCTGCCCAGGTTCCTCTGATAATTAGCTAATTGCGTGTGGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCAt < 2:264236/148‑1 (MQ=255) gaacaGGCATCTTCCGACGTGCCTGTGGTGTGTAGCGATGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATTAACGCCTTATCTGACATACAAAACATGGTACATTCAATCGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATc < 2:1174285/144‑1 (MQ=255) aaaaaGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGACGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCATTAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCt > 1:462165/1‑149 (MQ=255) aaaGGCACCCTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCGAAGTGCATGTTGCCCCTGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTgg < 1:288288/149‑1 (MQ=255) aaGGCGCCTTACTAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGGGCATGTTGTTCATGGCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGc < 1:584439/149‑1 (MQ=255) aaGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTgg < 2:969435/148‑1 (MQ=255) gCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAGCATTGTACATTCAATAGATTGCGTAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGa < 2:758059/148‑1 (MQ=255) ttACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTgc > 1:680104/1‑149 (MQ=255) ttACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTg > 2:489891/1‑148 (MQ=255) ttACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTACATGTTCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTgc > 1:930271/1‑149 (MQ=255) aCGGGGTGCCTCTGATGATTGGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTgcg < 2:284510/148‑1 (MQ=255) gAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCtt < 1:825585/149‑1 (MQ=255) | ACAGTCAATTTCGATCATATCCGTAATCATTACTTCCGCAGCCATAAGACCATCAACCCTACGGGGATTATTTCAATTGGTCCGTGGCAGGATCTCGATGAACCGCATGGACGAGATGTTCGCTTCGGTT‑AAAAAAAGGCACCTTACGAGGTGCCTCTGATAATTAGCTAAGTGCATGTTGTTCATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTT > CP009273/3245238‑3245533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |