Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 567,801 T→C I88I (ATT→ATC)  emrE → multidrug resistance protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb567,8010TC100.0% 1149.5 / NA 551I88I (ATT→ATC) emrEmultidrug resistance protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base C (551/0);  total (551/0)

Only 100 of 556 total aligned reads displayed.

TGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGC  >  W3110S.gb/567746‑567807
                                                       |      
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tGATTAGTTTGCTTTCCTGGGGATTTTTTGGTCAACGACTGGACCTGCCAGCTATCATAgg   >  1:228869/1‑61 (MQ=255)
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tGAATAGTTTGCTTTCCTGGGGATATTTTGGTCAACGACTGGACCTGCCAGCTATCATAgg   >  1:189206/1‑61 (MQ=255)
agATTAGTTTGCTTTCCTGGGGATTTTTTGGTCAACGACTGGACCTGCCAGCTATCATAGGc  >  1:313484/2‑62 (MQ=255)
                                                       |      
TGATTAGCTTACTGTCATGGGGATTTTTCGGCCAACGGCTGGACCTGCCAGCCATTATAGGC  >  W3110S.gb/567746‑567807

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑