Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,325,144 A→G L144L (TTA→TTG)  atoS → sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,325,1440AG99.6% 473.2 / NA 264L144L (TTA→TTG) atoSsensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (263/0);  minor base C (1/0);  total (264/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 264 total aligned reads displayed.

CCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAG  >  W3110S.gb/2325139‑2325201
     |                                                         
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATAtttt                        >  1:285531/1‑41 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATAtt                          >  1:203048/1‑39 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:227637/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:61189/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:85105/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:124371/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:327336/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:321952/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:322923/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:323924/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:318744/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:31463/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:314298/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:312368/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:34393/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:309801/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:330684/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:306761/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:296535/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:294954/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:291912/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:289513/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:288982/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:284022/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:282982/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:280992/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:275253/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:274248/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:6056/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:98383/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:9607/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:95533/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:90552/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:87264/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:78837/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:75488/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:71337/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:68709/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:67625/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:64653/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:334153/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:55217/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:51306/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:48644/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:46913/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:44257/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:41277/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:40718/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:38039/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:34947/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:347201/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:26697/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:140735/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:170964/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:168642/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:163630/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:162182/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:159514/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:158949/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:154269/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:151889/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:146512/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:143590/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:141243/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:176443/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:138853/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:137827/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:13512/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:133715/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:132991/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:127575/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:121309/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:118898/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:115818/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:112881/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:107195/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:225584/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:103636/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:263952/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:258657/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:255220/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:248572/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:24647/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:244912/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:241079/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:235783/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:23512/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:229170/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:268307/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:221457/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:21907/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:214156/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:211919/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:201412/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:197773/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:194612/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:192995/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:18731/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:18467/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:177406/1‑62 (MQ=255)
     |                                                         
CCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAG  >  W3110S.gb/2325139‑2325201

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑