Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,325,192 C→T L160I (CTC→ATT)  atoS → sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,325,1920CT100.0% 493.1 / NA 260L160I (CTC→ATT) atoSsensory histidine kinase in two‑component regulatory system with AtoC
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (260/0);  total (260/0)

Only 100 of 260 total aligned reads displayed.

CCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAG  >  W3110S.gb/2325139‑2325201
                                                     |         
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:124371/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:85105/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:145462/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTg    >  1:227637/1‑61 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:300576/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:330992/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:328940/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:324353/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:323613/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:32278/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:320397/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:317774/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:314543/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:314171/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:310552/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:306981/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:347521/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:294954/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:294323/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:290214/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:288982/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:286652/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:284022/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:282982/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:280992/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:274492/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:27324/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:63125/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:98383/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:9607/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:95533/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:90552/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:88841/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:78837/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:76378/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:71337/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:68853/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:68160/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:64653/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:336871/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:6056/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:55647/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:52115/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:48644/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:45438/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:43016/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:40733/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:39206/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:37649/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:266388/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:344243/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:139988/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:172703/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:170834/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:163862/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:162679/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:161820/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:159514/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:15662/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:152609/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:151889/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:143590/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:141243/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:177032/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:138853/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:137665/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:13512/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:133715/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:131329/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:127575/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:121309/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:118898/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:115818/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:112881/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:107195/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:221457/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:103636/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:263345/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:257516/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:250014/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:248012/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:24647/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:242787/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:240629/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:235783/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:234060/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:229170/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:224209/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:267707/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:218195/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:214156/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:211919/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:202234/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:201089/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:195577/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:194372/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:189904/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:186845/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:181302/1‑62 (MQ=255)
ccTTTGGATTATTCAGGCAGGCAGGTGCCCGGCGATATTTTGAATTCAATGATTCCCATTGa   >  1:46918/1‑62 (MQ=255)
                                                     |         
CCTTTAGTTTATTCAGGCAGGCAGGTGCGCGGCGATATTTTGAATTCAATGCTCCCCATTGAG  >  W3110S.gb/2325139‑2325201

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑