Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,538,196 G→C T114T (ACG→ACC)  cysK → cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,538,1960GC99.7% 653.8 / NA 312T114T (ACG→ACC) cysKcysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base G (0/0);  major base C (311/0);  minor base A (1/0);  total (312/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 312 total aligned reads displayed.

CCGCAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACGGA  >  W3110S.gb/2538154‑2538198
                                          |  
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAACCCTGGTGCTGACCGa  >  1:244117/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:285498/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:336113/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:331476/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:32748/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:314925/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:311150/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:308043/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:304943/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:301032/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:297396/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:2936/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:289524/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:287789/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:33939/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:284786/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:283602/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:280758/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:2779/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:276615/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:272379/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:27007/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:264938/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:261035/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:26000/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:257700/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:60527/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:97144/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:91777/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:88404/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:85872/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:83282/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:82569/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:78245/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:73460/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:70331/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:68655/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:649/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:64282/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:252903/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:58415/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:54022/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:50438/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:48492/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:4510/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:42359/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:38171/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:348048/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:34673/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:343420/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:341096/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:133196/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:17533/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:171838/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:168603/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:167050/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:162375/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:156662/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:150410/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:145752/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:144210/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:140954/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:137636/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:178812/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:128595/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:127623/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:125060/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:12159/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:119405/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:117213/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:114063/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:108630/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:107445/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:101908/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:101075/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:216181/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:251712/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:249193/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:247769/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:239292/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:237531/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:235256/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:232119/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:22561/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:222243/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:218132/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:217031/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:100678/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:212783/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:21054/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:206416/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:20238/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:2011/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:196239/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:195129/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:189788/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:187468/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:185070/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:183666/1‑45 (MQ=255)
ccgcAAGCTGATGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACCGa  >  1:131710/1‑45 (MQ=38)
                                          |  
CCGCAAGCTGCTGAAAGCGTTAGGTGCAAACCTGGTGCTGACGGA  >  W3110S.gb/2538154‑2538198

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑