Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,017,984 A→G P56P (CCA→CCG)  ssnA → predicted chlorohydrolase/aminohydrolase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,017,9840AG99.6% 465.1 / ‑4.0 259coding (168/1329 nt)ssnApredicted chlorohydrolase/aminohydrolase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  major base G (258/0);  minor base . (1/0);  total (259/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01

Only 100 of 259 total aligned reads displayed.

ACGCTACCCCGACGCCAGCTTCAAAGAGATGCATGGCCGGATTGTGATGCCAGGGATTGTCT  >  W3110S.gb/3017933‑3017994
                                                   |          
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACATAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:134084/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGTGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:293623/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTc   >  1:114383/1‑61 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTc   >  1:171607/1‑61 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTc   >  1:192998/1‑61 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTc   >  1:280974/1‑61 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTc   >  1:207730/1‑61 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTc   >  1:307743/1‑61 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:32600/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:338054/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:324922/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:32182/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:312865/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:310375/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:308662/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:304343/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:301018/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:299944/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:293182/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:291381/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:287646/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:285466/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:281371/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:279312/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:274112/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:272289/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:263453/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:64428/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:96492/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:94843/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:91833/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:91227/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:87261/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:86663/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:85796/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:76775/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:75138/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:70228/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:6710/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:332155/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:59657/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:57733/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:54807/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:53031/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:51209/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:44778/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:41528/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:3771/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:345700/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:101830/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:334231/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:14922/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:17866/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:176111/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:169142/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:163371/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:162932/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:160808/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:157945/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:153696/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:153454/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:15104/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:149847/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:248604/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:14578/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:144253/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:140002/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:135211/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:12985/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:128981/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:127552/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:125662/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:124215/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:109153/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:100077/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:184688/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:254562/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:245624/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:244035/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:242228/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:241385/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:236786/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:235205/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:234764/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:232446/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:232169/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:230079/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:22968/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:225575/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:221666/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:219820/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:209036/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:198912/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:197001/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:195973/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:192059/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:180082/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCCCGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATCCCGGGAATTGTCt  >  1:99255/1‑62 (MQ=255)
aCGCTACCACGATGCCAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:294520/1‑62 (MQ=255)
aCGATACCCCGATGCAAGCTACAAAGAGATGCATGGTCGGATTGTGATGCCGGGAATTGTCt  >  1:270220/1‑62 (MQ=255)
                                                   |          
ACGCTACCCCGACGCCAGCTTCAAAGAGATGCATGGCCGGATTGTGATGCCAGGGATTGTCT  >  W3110S.gb/3017933‑3017994

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑