Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 3,861,617 C→A A468S (GCC→TCG)  lldP ← L‑lactate permease

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb3,861,6170CA100.0% 448.1 / NA 238A468S (GCC→TCG) lldPL‑lactate permease
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/238);  total (0/238)

Only 100 of 238 total aligned reads displayed.

GCTTGCAGCGCGGCGAACAGGGCGTTAGATGAGGTATCCGACCCGGTCAGGAATACCCCCAG  >  W3110S.gb/3861604‑3861665
             |                                                
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 cctGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:265097/59‑1 (MQ=255)
 cctGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:264710/59‑1 (MQ=255)
  ctGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:323674/59‑1 (MQ=255)
  ctGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:69090/59‑1 (MQ=255)
   tGCAGCGCCGAGAACAGCGCGTTGGACGAAGTGTCCGAACCGGTCAGGAACACGCccag  <  1:100020/59‑1 (MQ=255)
             |                                                
GCTTGCAGCGCGGCGAACAGGGCGTTAGATGAGGTATCCGACCCGGTCAGGAATACCCCCAG  >  W3110S.gb/3861604‑3861665

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑