Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,083,201 A→T Q288L (CAG→CTG)  rtcB → conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,083,2010AT100.0% 716.1 / NA 329Q288L (CAG→CTG) rtcBconserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/329);  total (0/329)

Only 100 of 329 total aligned reads displayed.

TGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCAC  >  W3110S.gb/4083159‑4083205
                                          |    
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:29219/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:323569/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:31795/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:316958/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:315364/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:314785/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:31089/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:308979/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:305651/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:302087/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:30014/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:297735/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:293765/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:325274/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:286898/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:285468/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:282651/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:280351/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:278666/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:276792/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:270653/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:269394/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:26619/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:258193/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:100220/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:56060/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:96971/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:91455/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:85839/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:81/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:78311/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:72896/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:70058/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:67350/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:63320/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:60998/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:59197/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:248639/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:54576/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:48441/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:46143/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:40695/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:36898/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:345759/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:342545/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:334750/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:3332/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:331382/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:330422/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:132086/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:247554/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:171780/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:170921/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:165475/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:162527/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:158796/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:154508/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:152560/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:147151/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:145450/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:141886/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:137339/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:17400/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:1304/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:128065/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:124906/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:124046/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:120806/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:117207/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:116287/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:114999/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:108270/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:106634/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:103209/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:206816/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:244938/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:241241/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:240310/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:2368/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:23268/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:229977/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:22533/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:223011/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:221306/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:218662/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:215821/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:212652/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:204440/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:200178/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:198456/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:196371/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:191477/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:189474/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:187918/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:179921/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:177297/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:176494/47‑1 (MQ=255)
tGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGAGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:4371/47‑1 (MQ=255)
 ggAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:321648/46‑1 (MQ=255)
      agaTCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACTGCAc  <  1:160810/41‑1 (MQ=255)
                                          |    
TGGAAGAGATCAACTGTCACCACAACTATGTGCAAAAAGAACAGCAC  >  W3110S.gb/4083159‑4083205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑