| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | W3110S.gb | 4,159,134 | T→C | intergenic (‑5/‑123) | yheS ← / → kefG | fused predicted transporter subunits and ATP‑binding components of ABC superfamily/component of potassium effux complex with KefB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | W3110S.gb | 4,159,134 | 0 | T | C | 99.5% | 749.1 / ‑6.8 | 418 | intergenic (‑5/‑123) | yheS/kefG | fused predicted transporter subunits and ATP‑binding components of ABC superfamily/component of potassium effux complex with KefB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (0/416); minor base G (0/2); total (0/418) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 418 total aligned reads displayed.
AAGGTGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAG > W3110S.gb/4159130‑4159190 | aaGGCGCCTTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:206548/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:294216/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:330281/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:326989/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:320569/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:319443/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:317816/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:309573/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:308296/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:303974/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:299172/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:297626/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:332175/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:293304/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:291526/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:29049/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:287407/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:283732/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:2822/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:280618/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:272223/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:268020/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:103903/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:262696/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:62555/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:96379/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:90200/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:85104/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:8132/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:80234/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:78222/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:76489/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:74524/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:73189/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:70414/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:65686/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:265227/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:58376/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:54202/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:50286/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:45828/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:42137/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:40253/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:37152/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:3610/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:346767/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:338384/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:334420/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:140354/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:257851/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:189178/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:184493/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:18307/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:179714/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:176633/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:170892/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:164190/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:15460/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:152328/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:146808/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:143216/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:190288/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:137810/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:132884/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:130048/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:127478/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:123458/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:120373/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:117497/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:114675/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:112978/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:111390/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:10538/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:209009/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:244162/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:242098/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:234478/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:245929/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:233590/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:228866/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:225025/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:247517/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:219316/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:212340/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:205267/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:20352/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:249197/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:202466/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:200258/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:252666/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:198243/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:193295/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:195139/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATATAATGTATGGGCGAg < 1:254166/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTAATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:222056/61‑1 (MQ=255)aaGGCGCCGTATGTTCAGACTAAGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:313802/61‑1 (MQ=255) aGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:71970/60‑1 (MQ=255) aGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:276687/60‑1 (MQ=255) aGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:342731/60‑1 (MQ=255) aGGCGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAg < 1:324571/60‑1 (MQ=255) | AAGGTGCCGTATGTTCAGACTATGTTAACTTATCATTATGATAATGTAATGTATGGGCGAG > W3110S.gb/4159130‑4159190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |