Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 2,405,587 C→T P213P (CCG→CCA)  nuoF ← NADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb2,405,5870CT99.5% 350.9 / NA 184P213P (CCG→CCA) nuoFNADH:ubiquinone oxidoreductase, chain F
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  major base T (0/183);  minor base G (0/1);  total (0/184)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 184 total aligned reads displayed.

TCGCCGGAACGTTACACAGGGTTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCG  >  W3110S.gb/2405544‑2405605
                                           |                  
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                                           |                  
TCGCCGGAACGTTACACAGGGTTTCGACGTTGTTGACACAGGTCGGTTTACCCCATGCGCCG  >  W3110S.gb/2405544‑2405605

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑