Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	W3110S.gb	2,681,224	C→A	A60S (GCG→TCG)	yphG ←	conserved hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	W3110S.gb	2,681,224	0	C	A	100.0%	145.1 / NA	72	A60S (GCG→TCG)	yphG	conserved hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base A (0/72);  total (0/72)

AGCCACACCGCCTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGT  >  W3110S.gb/2681214‑2681274           |                                                   aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:4104/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:42890/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:4279/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:42710/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:4269/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:42210/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:42161/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:41734/61‑1 (MQ=255) aGCCACACCGACTGCCAGGATTTCAGGGTTTTCTGCTCGCTCAGCGTATCGGTCACGCCGt  <  1:41388/61‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑