Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA W3110S.gb 4,076,121 C→T S762S (AGC→AGT)  glgP → glycogen phosphorylase

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*W3110S.gb4,076,1210CT100.0% 460.2 / NA 239S762S (AGC→AGT) glgPglycogen phosphorylase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/239);  total (0/239)

Only 100 of 239 total aligned reads displayed.

AGGTACTGGCGGATTATCGCAGCTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGATGAACTCTACGA  >  W3110S.gb/4076099‑4076159
                      |                                      
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 ggTACTGGCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGGCGACGAACTCTACGa  <  1:38644/60‑1 (MQ=255)
     cTGGCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:10369/56‑1 (MQ=255)
       ggCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:27626/54‑1 (MQ=39)
       ggCGGATTATCGCAGTTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGACGAACTCTACGa  <  1:20654/54‑1 (MQ=39)
                      |                                      
AGGTACTGGCGGATTATCGCAGCTATGTCGATTGTCAGGATAAAGTCGATGAACTCTACGA  >  W3110S.gb/4076099‑4076159

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑