Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 2,217,280 C→T A445A (GCG→GCA)  yhdA ← conserved inner membrane protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE2,217,2800CT100.0% 1303.5 / NA 448A445A (GCG→GCA) yhdAconserved inner membrane protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (0/448);  total (0/448)

Only 100 of 448 total aligned reads displayed.

CCAAACTGCAAGACCATCGGCATATACTCCGCCGAGCTAACCTCTTCATTACCATCGAAGAT  >  minE/2217251‑2217312
                             |                                
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ccAAACTGCAAGACCATCGGCATATACTCTGCCGAGCTAACCTCTTCATTACCATCGAAGAt  <  1:681075/62‑1 (MQ=255)
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 cAAACTGCAAGACCATCGGCATATACTCTGCCGAGCTAACCTCTTCATTACCATCGAAGAt  <  1:407039/61‑1 (MQ=255)
                tCGGCATATACTCTGCCGAGCTAACCTCTTCATTACCATCGAAGAt  <  1:246325/46‑1 (MQ=255)
                      tataCTCTGCCGAGCTAACCTCTTCATTACCATCGAAGAt  <  1:662851/40‑1 (MQ=255)
                             |                                
CCAAACTGCAAGACCATCGGCATATACTCCGCCGAGCTAACCTCTTCATTACCATCGAAGAT  >  minE/2217251‑2217312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑