Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA minE 2,469,507 C→T L163L (CTC→CTT atpD → F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, beta subunit

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*minE2,469,5070CT100.0% 2063.7 / NA 642L163L (CTC→CTTatpDF1 sector of membrane‑bound ATP synthase, beta subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base C (0/0);  new base T (642/0);  total (642/0)

Only 100 of 642 total aligned reads displayed.

GTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATT  >  minE/2469470‑2469510
                                     |   
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GTGCGGGTGTAGGTAAAACCGTAAACATGATGGAGCTCATT  >  minE/2469470‑2469510

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: