Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	904,315	+G	coding (286/843 nt)	ycjP →	predicted sugar transporter subunit

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	904,311	1	.	G	96.7%	107.2 / ‑3.0	30	coding (282/843 nt)	ycjP	predicted sugar transporter subunit
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (1/0);  new base G (29/0);  total (30/0)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01

GTGGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑T‑GGGGCTTACGCGCTTTCCCGCC  >  minE/904273‑904333                                         |                       gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCTCG‑GGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1099877/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1772228/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:886763/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:803482/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:717924/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:690054/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:634750/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:619454/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:488719/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:449051/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:327154/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:270441/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:204647/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1060484/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1735274/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1698356/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1610711/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1523941/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1422969/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1414446/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:137775/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1369813/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1351279/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1129046/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:1064296/1‑62 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGc   >  1:1677437/1‑61 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGc   >  1:230226/1‑61 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGc   >  1:391577/1‑61 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGc   >  1:1195113/1‑61 (MQ=255) gtgGTTTCATCCGTGGTGGCGGGATTCCTCGGCATTCT‑TGGGGGCTTACGCGCTTTCCCGcc  >  1:467196/1‑62 (MQ=255)                                         |                       GTGGTTTCATCCGTGGTGGCGGTATTCCTCGGCATTCT‑T‑GGGGCTTACGCGCTTTCCCGCC  >  minE/904273‑904333

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑