Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	194,924	A→T	intergenic (+120/+80)	nlpE → / ← yaeF	lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion/predicted lipoprotein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	194,924	0	A	T	100.0%	94.3 / NA	30	intergenic (+120/+80)	nlpE/yaeF	lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion/predicted lipoprotein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base T (0/30);  total (0/30)

ATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAC  >  minE/194915‑194976          |                                                     cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1080216/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:980702/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:910213/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:871545/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:703348/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:499772/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:289991/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:25893/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:236027/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:228910/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1856275/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1809288/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1755982/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1733768/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1402123/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1007010/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1121570/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:11832/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1183960/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1304718/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1348397/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:166851/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1408375/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1457753/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1608134/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1660735/59‑1 (MQ=255) cgtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCAAAc  <  1:366255/59‑1 (MQ=18)  gtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1413612/59‑1 (MQ=255)  gtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:188182/59‑1 (MQ=255)  gtgTGCTCTACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:551000/59‑1 (MQ=255)       ctctACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAc  <  1:1750587/56‑1 (MQ=255)          |                                                     ATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACAACCCCCCTCATAC  >  minE/194915‑194976

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑