Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	minE	279,817	A→G	V88A (GTG→GCG)	cyoA ←	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	279,817	0	A	G	100.0%	87.8 / NA	24	V88A (GTG→GCG)	cyoA	cytochrome o ubiquinol oxidase subunit II
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (0/24);  total (0/24)

TAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCACTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCG  >  minE/279786‑279841                                |                         tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:390291/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:934554/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:92300/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:847752/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:738496/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:731400/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:650132/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:498559/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:481662/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:463634/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:449816/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1154175/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:229708/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:177166/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1631137/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1566760/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1547899/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1420304/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:141155/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1322230/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1285949/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:126569/56‑1 (MQ=255) tAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:1211191/56‑1 (MQ=255)                     ccACAGCTTCCGCTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCg  <  1:426606/36‑1 (MQ=255)                                |                         TAAGATAGGTACCGTCCAGACCACAGCTTCCACTTTATTGGAGTGTGACCAGTTCG  >  minE/279786‑279841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑