BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	minE	53,515	G→A	P425S (CCT→TCT)	imp ←	exported protein required for envelope biosynthesis and integrity

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	minE	53,515	0	G	A	100.0%	365.1 / NA	110	P425S (CCT→TCT)	imp	exported protein required for envelope biosynthesis and integrity
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (54/56); total (54/56)

Only 100 of 110 total aligned reads displayed.

GATGCTGCCCCAGTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGGCATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAACA  >  minE/53447‑53582

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gATGCTGCCCCAGTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACa                                                                   >  1:740502/1‑71 (MQ=255)

gATGCTGCCCCAGTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACa                                                                   >  1:1344760/1‑71 (MQ=255)

gATGCTGCCCCAGTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACa                                                                   >  1:3608355/1‑71 (MQ=255)

  tgctgcCCCAGTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATg                                                                 >  1:2669229/1‑71 (MQ=255)

  tgctgcCCCAGTTATTAGAGAGAGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATg                                                                 >  1:2908958/1‑71 (MQ=255)

            gTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACAt                                                                  <  1:3861133/60‑1 (MQ=255)

            gTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACAt                                                                  <  1:3846410/60‑1 (MQ=255)

             ttattaGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACAt                                                                  <  1:2199643/59‑1 (MQ=255)

              tattaGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATgt                                                                >  1:1091423/1‑60 (MQ=255)

              tattaGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATgt                                                                >  1:681103/1‑60 (MQ=255)

              tattaGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATgt                                                                >  1:1917972/1‑60 (MQ=255)

              tattaGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATgt                                                                >  1:1915330/1‑60 (MQ=255)

              tattaGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATgt                                                                >  1:1527941/1‑60 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGGTGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:86145/1‑71 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:3884802/1‑71 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:1938498/1‑71 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:4019106/1‑71 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:4176538/1‑71 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:4196646/1‑71 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:765702/1‑71 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTa                                                  >  1:365319/1‑70 (MQ=255)

                  agagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTa                                                  >  1:2901315/1‑70 (MQ=255)

                   gagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:1010752/1‑70 (MQ=255)

                   gagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:384848/1‑70 (MQ=255)

                   gagagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTaa                                                 >  1:3505563/1‑70 (MQ=255)

                    agagCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACa                                               <  1:3041085/71‑1 (MQ=255)

                      agCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:4612364/71‑1 (MQ=255)

                      agCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:380150/71‑1 (MQ=255)

                      agCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:366934/71‑1 (MQ=255)

                      agCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:2709467/71‑1 (MQ=255)

                      agCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:3640884/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:504414/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:3265853/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:2995558/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:4852181/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:2935157/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:4407631/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:2874889/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:1569578/71‑1 (MQ=255)

                       gCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:1510224/71‑1 (MQ=255)

                        cGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:2751893/69‑1 (MQ=255)

                        cGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:612055/69‑1 (MQ=255)

                        cGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:3915191/69‑1 (MQ=255)

                        cGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACaaa                                             <  1:753623/69‑1 (MQ=255)

                        cGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:1866728/70‑1 (MQ=255)

                            aaaTTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAg                                            <  1:4891755/66‑1 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATgtcgt                                                             >  1:3914937/1‑46 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          >  1:2245145/1‑65 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          >  1:4301466/1‑65 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          <  1:4084932/65‑1 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          >  1:906486/1‑65 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          >  1:2238235/1‑65 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          <  1:2772368/65‑1 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          <  1:2707257/65‑1 (MQ=255)

                               ttGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTg                                          >  1:1902304/1‑65 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:4348633/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:1242510/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:4700137/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:2537253/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:2575481/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:2638545/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:4256343/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:1715830/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGcc                                   >  1:4288501/1‑71 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGc                                    >  1:147024/1‑70 (MQ=255)

                                tGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGc                                    >  1:3916773/1‑70 (MQ=255)

                                   tGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAAc                                                <  1:2554432/55‑1 (MQ=255)

                                   tGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAAc                                                <  1:4605599/55‑1 (MQ=255)

                                   tGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAAc                                                <  1:4246183/55‑1 (MQ=255)

                                   tGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAAc                                                <  1:873967/55‑1 (MQ=255)

                                   tGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAAc                                                <  1:3486350/55‑1 (MQ=255)

                                   tGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAAc                                                <  1:3297046/55‑1 (MQ=255)

                                        ggTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTa                           <  1:2417891/71‑1 (MQ=255)

                                        ggTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTa                           <  1:3720797/71‑1 (MQ=255)

                                        ggTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTa                           <  1:3035571/71‑1 (MQ=255)

                                         gTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTa                           <  1:470969/70‑1 (MQ=255)

                                         gTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTa                           <  1:872945/70‑1 (MQ=255)

                                                gTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATAcgcg                   <  1:18395/71‑1 (MQ=255)

                                                gTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATAcgcg                   <  1:3303546/71‑1 (MQ=255)

                                                gTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATAcgcg                   <  1:4528136/71‑1 (MQ=255)

                                                gTGAACACGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATAcgcg                   <  1:204568/71‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATAcgcg                   <  1:2909115/66‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCa              <  1:3133472/71‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCa              <  1:4672720/71‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCa              <  1:2948055/71‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCa              <  1:2712324/71‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCa              <  1:2486993/71‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGCTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCa              <  1:2400716/71‑1 (MQ=255)

                                                     cacGGGTTGATTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCa              <  1:1384100/71‑1 (MQ=255)

                                                              cTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGAcc      <  1:514271/70‑1 (MQ=255)

                                                              cTTCAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGAcc      <  1:944078/70‑1 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCaa    >  1:2871987/1‑69 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAAca  >  1:2700779/1‑71 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAAca  >  1:2508207/1‑71 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAAca  >  1:2263998/1‑71 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAAca  >  1:2203627/1‑71 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAAca  >  1:1169312/1‑71 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAAc   >  1:3915718/1‑70 (MQ=255)

                                                                 cAGACATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAAc   >  1:2668979/1‑70 (MQ=255)

GATGCTGCCCCAGTTATTAGAGAGCGGCAAATTGATGGTCGGTTCCAGGTGAACACGGGTTGCTTCAGGCATGTCGTCTCTGGTGTTAACAAAGTGCACTGCCTGGCCGTAAATACGCGTATCAAACGGACCAACA  >  minE/53447‑53582

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 21 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 36 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`